RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579859.1

TSPOAP1-AS1-204, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 1,791 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP38.85■■■■□ 3.81
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TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CHIC2Q9UKJ5 165 aa38.79■■■■□ 3.8
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TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ROCK1Q13464 1354 aa38.75■■■■□ 3.79
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TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ADGBQ8N7X0 1667 aa38.59■■■■□ 3.77
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP38.57■■■■□ 3.77
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TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SIN3AQ96ST3 1273 aa38.49■■■■□ 3.75
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 NCOA1Q15788 1441 aa38.48■■■■□ 3.75
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TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 NEUROD1Q13562 356 aa38.41■■■■□ 3.74
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TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ARHGAP5Q13017 1502 aa38.4■■■■□ 3.74
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 C9orf84Q5VXU9 1444 aa38.38■■■■□ 3.73
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 KCNH8Q96L42 1107 aa38.38■■■■□ 3.73
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TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP38.33■■■■□ 3.73
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TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TSPY10P0CW01 314 aa38.31■■■■□ 3.72
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TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 MPHOSPH9Q99550 1183 aa38.31■■■■□ 3.72
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TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa38.29■■■■□ 3.72
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TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ARAP3Q8WWN8 1544 aa38.2■■■■□ 3.71
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TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 MAST1Q9Y2H9 1570 aa38.2■■■■□ 3.71
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa38.16■■■■□ 3.7
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TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PZPP20742 1482 aa38.15■■■■□ 3.7
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TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 KDM5DQ9BY66 1539 aa38.02■■■■□ 3.68
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TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa37.83■■■■□ 3.65
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TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TEX14Q8IWB6 1497 aa37.78■■■■□ 3.64
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TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa37.78■■■■□ 3.64
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 FAM135AQ9P2D6 1515 aa37.78■■■■□ 3.64
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 L3MBTL2Q969R5 705 aa37.77■■■■□ 3.64
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 AFAP1Q8N556 730 aa37.75■■■■□ 3.63
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SCAPERQ9BY12 1400 aa37.73■■■■□ 3.63
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP37.71■■■■□ 3.63
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TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 MAGI2Q86UL8 1455 aa37.7■■■■□ 3.62
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 IQGAP3Q86VI3 1631 aa37.69■■■■□ 3.62
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ATP7AQ04656 1500 aa37.68■■■■□ 3.62
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 MIER1Q8N108 512 aa37.64■■■■□ 3.62
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP37.58■■■■□ 3.61
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