RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578093.1

PTPRM-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 464 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-206ENST00000578093 KIF13AQ9H1H9 1805 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRM-206ENST00000578093 POTEB3A0JP26 581 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-206ENST00000578093 POTEBQ6S5H4 581 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-206ENST00000578093 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-206ENST00000578093 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-206ENST00000578093 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-206ENST00000578093 SHROOM2Q13796 1616 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-206ENST00000578093 VASPP50552 380 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-206ENST00000578093 GRIN2AQ12879 1464 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-206ENST00000578093 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-206ENST00000578093 NUP160Q12769 1436 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-206ENST00000578093 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-206ENST00000578093 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-206ENST00000578093 CREBZFQ9NS37 354 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-206ENST00000578093 TOP2BQ02880 1626 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-206ENST00000578093 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-206ENST00000578093 PLEKHG5O94827 1062 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-206ENST00000578093 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRM-206ENST00000578093 PLCD3Q8N3E9 789 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRM-206ENST00000578093 MIER1Q8N108 512 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRM-206ENST00000578093 KLHL34Q8N239 644 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-206ENST00000578093 HS3ST6Q96QI5 342 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-206ENST00000578093 ERICH3Q5RHP9 1530 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-206ENST00000578093 FHAD1B1AJZ9 1412 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-206ENST00000578093 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-206ENST00000578093 DIP2BQ9P265 1576 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-206ENST00000578093 ADCY10Q96PN6 1610 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-206ENST00000578093 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-206ENST00000578093 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-206ENST00000578093 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-206ENST00000578093 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-206ENST00000578093 TSPOAP1O95153 1857 aa7.21□□□□□ -1.25
PTPRM-206ENST00000578093 MAPKBP1O60336 1514 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-206ENST00000578093 ABCC10Q5T3U5 1492 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRM-206ENST00000578093 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
PTPRM-206ENST00000578093 KDM6BO15054 1643 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRM-206ENST00000578093 EMP3P54852 163 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRM-206ENST00000578093 SPOCK2Q92563 424 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRM-206ENST00000578093 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
PTPRM-206ENST00000578093 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-206ENST00000578093 SNPHO15079 494 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-206ENST00000578093 SEC24BO95487 1268 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-206ENST00000578093 CUL7Q14999 1698 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-206ENST00000578093 TRPC6Q9Y210 931 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRM-206ENST00000578093 FAM205CA6NFA0 338 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRM-206ENST00000578093 FAM69CQ0P6D2 419 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRM-206ENST00000578093 JPH4Q96JJ6 628 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRM-206ENST00000578093 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRM-206ENST00000578093 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRM-206ENST00000578093 MYT1LQ9UL68 1186 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRM-206ENST00000578093 ABCC2Q92887 1545 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRM-206ENST00000578093 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRM-206ENST00000578093 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP7.09□□□□□ -1.27
PTPRM-206ENST00000578093 TIE1P35590 1138 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRM-206ENST00000578093 IGF1RP08069 1367 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRM-206ENST00000578093 GLI2P10070 1586 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRM-206ENST00000578093 IQGAP2Q13576 1575 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRM-206ENST00000578093 IER5LQ5T953 404 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRM-206ENST00000578093 ADGRL1O94910 1474 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRM-206ENST00000578093 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
PTPRM-206ENST00000578093 ASXL2Q76L83 1435 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRM-206ENST00000578093 KIF27Q86VH2 1401 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRM-206ENST00000578093 DISP1Q96F81 1524 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRM-206ENST00000578093 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
PTPRM-206ENST00000578093 KIAA0556O60303 1618 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRM-206ENST00000578093 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
PTPRM-206ENST00000578093 HECW2Q9P2P5 1572 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRM-206ENST00000578093 PTPRGP23470 1445 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRM-206ENST00000578093 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
PTPRM-206ENST00000578093 TNIKQ9UKE5 1360 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRM-206ENST00000578093 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRM-206ENST00000578093 GSE1Q14687 1217 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRM-206ENST00000578093 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
PTPRM-206ENST00000578093 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
PTPRM-206ENST00000578093 PLB1Q6P1J6 1458 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRM-206ENST00000578093 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRM-206ENST00000578093 UGGT2Q9NYU1 1516 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRM-206ENST00000578093 KDM5BQ9UGL1 1544 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRM-206ENST00000578093 TTLL13PA6NNM8 815 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRM-206ENST00000578093 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
PTPRM-206ENST00000578093 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa7.03□□□□□ -1.28
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PTPRM-206ENST00000578093 FAM212AQ96EL1 285 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRM-206ENST00000578093 KIF12Q96FN5 646 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRM-206ENST00000578093 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRM-206ENST00000578093 UACAQ9BZF9 1416 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRM-206ENST00000578093 KIF21BO75037 1637 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRM-206ENST00000578093 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
PTPRM-206ENST00000578093 NUBP1P53384 320 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRM-206ENST00000578093 DCAF8Q5TAQ9 597 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRM-206ENST00000578093 CFAP43Q8NDM7 1665 aa7□□□□□ -1.29
PTPRM-206ENST00000578093 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa7□□□□□ -1.29
PTPRM-206ENST00000578093 TEX14Q8IWB6 1497 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRM-206ENST00000578093 WDR7Q9Y4E6 1490 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRM-206ENST00000578093 CCDC61Q9Y6R9 512 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRM-206ENST00000578093 ABCA8O94911 1581 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRM-206ENST00000578093 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRM-206ENST00000578093 TRIM35Q9UPQ4 493 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRM-206ENST00000578093 RASEFQ8IZ41 740 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-206ENST00000578093 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa6.95□□□□□ -1.3
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