RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576635.6

SPNS2-208, Transcript of sphingolipid transporter 2, humanhuman

TSL 3

Gene SPNS2, Length 901 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS2-208ENST00000576635 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa25.74■■□□□ 1.71
SPNS2-208ENST00000576635 SCAPERQ9BY12 1400 aa25.74■■□□□ 1.71
SPNS2-208ENST00000576635 KIF14Q15058 1648 aa25.73■■□□□ 1.71
SPNS2-208ENST00000576635 FMN1Q68DA7 1419 aa25.72■■□□□ 1.71
SPNS2-208ENST00000576635 UBTFP17480 764 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
SPNS2-208ENST00000576635 PLPPR3Q6T4P5 718 aa25.71■■□□□ 1.71
SPNS2-208ENST00000576635 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa25.71■■□□□ 1.71
SPNS2-208ENST00000576635 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.7
SPNS2-208ENST00000576635 MLECQ14165 292 aa25.67■■□□□ 1.7
SPNS2-208ENST00000576635 HSPA2P54652 639 aa25.66■■□□□ 1.7
SPNS2-208ENST00000576635 ATP10AO60312 1499 aa25.63■■□□□ 1.69
SPNS2-208ENST00000576635 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa25.63■■□□□ 1.69
SPNS2-208ENST00000576635 C9orf84Q5VXU9 1444 aa25.63■■□□□ 1.69
SPNS2-208ENST00000576635 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa25.62■■□□□ 1.69
SPNS2-208ENST00000576635 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
SPNS2-208ENST00000576635 ARHGAP5Q13017 1502 aa25.6■■□□□ 1.69
SPNS2-208ENST00000576635 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
SPNS2-208ENST00000576635 KDM5CP41229 1560 aa25.59■■□□□ 1.69
SPNS2-208ENST00000576635 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa25.58■■□□□ 1.69
SPNS2-208ENST00000576635 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa25.58■■□□□ 1.69
SPNS2-208ENST00000576635 PREX1Q8TCU6 1659 aa25.56■■□□□ 1.68
SPNS2-208ENST00000576635 CLIP1P30622 1438 aa25.55■■□□□ 1.68
SPNS2-208ENST00000576635 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.55■■□□□ 1.68
SPNS2-208ENST00000576635 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa25.53■■□□□ 1.68
SPNS2-208ENST00000576635 PREX2Q70Z35 1606 aa25.52■■□□□ 1.68
SPNS2-208ENST00000576635 AFAP1Q8N556 730 aa25.51■■□□□ 1.67
SPNS2-208ENST00000576635 ABCA6Q8N139 1617 aa25.51■■□□□ 1.67
SPNS2-208ENST00000576635 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
SPNS2-208ENST00000576635 REREQ9P2R6 1566 aa25.48■■□□□ 1.67
SPNS2-208ENST00000576635 ITSN2Q9NZM3 1697 aa25.47■■□□□ 1.67
SPNS2-208ENST00000576635 ABCC1P33527 1531 aa25.46■■□□□ 1.67
SPNS2-208ENST00000576635 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa25.45■■□□□ 1.66
SPNS2-208ENST00000576635 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.45■■□□□ 1.66
SPNS2-208ENST00000576635 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.45■■□□□ 1.66
SPNS2-208ENST00000576635 MYT1LQ9UL68 1186 aa25.44■■□□□ 1.66
SPNS2-208ENST00000576635 MLH3Q9UHC1 1453 aa25.43■■□□□ 1.66
SPNS2-208ENST00000576635 STRCQ7RTU9 1775 aa25.43■■□□□ 1.66
SPNS2-208ENST00000576635 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
SPNS2-208ENST00000576635 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa25.42■■□□□ 1.66
SPNS2-208ENST00000576635 C3P01024 1663 aa25.42■■□□□ 1.66
SPNS2-208ENST00000576635 CERKQ8TCT0 537 aa25.4■■□□□ 1.66
SPNS2-208ENST00000576635 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa25.4■■□□□ 1.66
SPNS2-208ENST00000576635 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa25.37■■□□□ 1.65
SPNS2-208ENST00000576635 AGLP35573 1532 aa25.37■■□□□ 1.65
SPNS2-208ENST00000576635 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.34■■□□□ 1.65
SPNS2-208ENST00000576635 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa25.31■■□□□ 1.64
SPNS2-208ENST00000576635 SYCP2Q9BX26 1530 aa25.28■■□□□ 1.64
SPNS2-208ENST00000576635 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
SPNS2-208ENST00000576635 DMRT2Q9Y5R5 561 aa25.25■■□□□ 1.63
SPNS2-208ENST00000576635 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
SPNS2-208ENST00000576635 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
SPNS2-208ENST00000576635 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
SPNS2-208ENST00000576635 MROH2AA6NES4 1674 aa25.23■■□□□ 1.63
SPNS2-208ENST00000576635 CNTLNQ9NXG0 1405 aa25.22■■□□□ 1.63
SPNS2-208ENST00000576635 PTPRTO14522 1441 aa25.2■■□□□ 1.62
SPNS2-208ENST00000576635 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
SPNS2-208ENST00000576635 ATP7AQ04656 1500 aa25.19■■□□□ 1.62
SPNS2-208ENST00000576635 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP25.17■■□□□ 1.62
SPNS2-208ENST00000576635 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
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SPNS2-208ENST00000576635 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
SPNS2-208ENST00000576635 NCOA1Q15788 1441 aa25.14■■□□□ 1.62
SPNS2-208ENST00000576635 NPATQ14207 1427 aa25.13■■□□□ 1.61
SPNS2-208ENST00000576635 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa25.13■■□□□ 1.61
SPNS2-208ENST00000576635 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa25.13■■□□□ 1.61
SPNS2-208ENST00000576635 LTBP4Q8N2S1 1624 aa25.12■■□□□ 1.61
SPNS2-208ENST00000576635 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa25.12■■□□□ 1.61
SPNS2-208ENST00000576635 CCNB3Q8WWL7 1395 aa25.11■■□□□ 1.61
SPNS2-208ENST00000576635 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
SPNS2-208ENST00000576635 A2MP01023 1474 aa25.1■■□□□ 1.61
SPNS2-208ENST00000576635 ZMYM3Q14202 1370 aa25.1■■□□□ 1.61
SPNS2-208ENST00000576635 MYO3AQ8NEV4 1616 aa25.09■■□□□ 1.61
SPNS2-208ENST00000576635 ADGBQ8N7X0 1667 aa25.09■■□□□ 1.61
SPNS2-208ENST00000576635 TIAM1Q13009 1591 aa25.09■■□□□ 1.61
SPNS2-208ENST00000576635 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.08■■□□□ 1.61
SPNS2-208ENST00000576635 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
SPNS2-208ENST00000576635 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.03■■□□□ 1.6
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SPNS2-208ENST00000576635 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
SPNS2-208ENST00000576635 PTPRKQ15262 1439 aa25.01■■□□□ 1.59
SPNS2-208ENST00000576635 IQSEC2Q5JU85 1478 aa25.01■■□□□ 1.59
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SPNS2-208ENST00000576635 MBD5Q9P267 1494 aa25■■□□□ 1.59
SPNS2-208ENST00000576635 DISP3Q9P2K9 1392 aa24.99■■□□□ 1.59
SPNS2-208ENST00000576635 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa24.98■■□□□ 1.59
SPNS2-208ENST00000576635 PLA2R1Q13018 1463 aa24.96■■□□□ 1.59
SPNS2-208ENST00000576635 CEP162Q5TB80 1403 aa24.95■■□□□ 1.58
SPNS2-208ENST00000576635 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa24.93■■□□□ 1.58
SPNS2-208ENST00000576635 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
SPNS2-208ENST00000576635 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
SPNS2-208ENST00000576635 ILDR2Q71H61 639 aa24.92■■□□□ 1.58
SPNS2-208ENST00000576635 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa24.92■■□□□ 1.58
SPNS2-208ENST00000576635 PPP6R1Q9UPN7 881 aa24.9■■□□□ 1.58
SPNS2-208ENST00000576635 PKD2Q13563 968 aa24.89■■□□□ 1.58
SPNS2-208ENST00000576635 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.57
SPNS2-208ENST00000576635 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
SPNS2-208ENST00000576635 A2ML1A8K2U0 1454 aa24.87■■□□□ 1.57
SPNS2-208ENST00000576635 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa24.87■■□□□ 1.57
SPNS2-208ENST00000576635 NCOA2Q15596 1464 aa24.87■■□□□ 1.57
SPNS2-208ENST00000576635 CCDC141Q6ZP82 1450 aa24.87■■□□□ 1.57
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