RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568622.1

KIAA0556-208, Transcript of KIAA0556, humanhuman

TSL 2

Gene KIAA0556, Length 570 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556-208ENST00000568622 KIF14Q15058 1648 aa18.53■□□□□ 0.56
KIAA0556-208ENST00000568622 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
KIAA0556-208ENST00000568622 MYO5CQ9NQX4 1742 aa18.53■□□□□ 0.56
KIAA0556-208ENST00000568622 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa18.53■□□□□ 0.56
KIAA0556-208ENST00000568622 UBTFP17480 764 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
KIAA0556-208ENST00000568622 ATP10AO60312 1499 aa18.52■□□□□ 0.55
KIAA0556-208ENST00000568622 KDM5CP41229 1560 aa18.51■□□□□ 0.55
KIAA0556-208ENST00000568622 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa18.51■□□□□ 0.55
KIAA0556-208ENST00000568622 CHIC1Q5VXU3 224 aa18.51■□□□□ 0.55
KIAA0556-208ENST00000568622 C9orf84Q5VXU9 1444 aa18.5■□□□□ 0.55
KIAA0556-208ENST00000568622 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
KIAA0556-208ENST00000568622 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa18.49■□□□□ 0.55
KIAA0556-208ENST00000568622 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa18.49■□□□□ 0.55
KIAA0556-208ENST00000568622 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa18.47■□□□□ 0.55
KIAA0556-208ENST00000568622 REREQ9P2R6 1566 aa18.45■□□□□ 0.54
KIAA0556-208ENST00000568622 CLIP1P30622 1438 aa18.44■□□□□ 0.54
KIAA0556-208ENST00000568622 HSPA2P54652 639 aa18.44■□□□□ 0.54
KIAA0556-208ENST00000568622 ARHGAP5Q13017 1502 aa18.44■□□□□ 0.54
KIAA0556-208ENST00000568622 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa18.42■□□□□ 0.54
KIAA0556-208ENST00000568622 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa18.42■□□□□ 0.54
KIAA0556-208ENST00000568622 MLH3Q9UHC1 1453 aa18.42■□□□□ 0.54
KIAA0556-208ENST00000568622 MLECQ14165 292 aa18.42■□□□□ 0.54
KIAA0556-208ENST00000568622 AFAP1Q8N556 730 aa18.42■□□□□ 0.54
KIAA0556-208ENST00000568622 EHMT2Q96KQ7 1210 aa18.42■□□□□ 0.54
KIAA0556-208ENST00000568622 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP18.42■□□□□ 0.54
KIAA0556-208ENST00000568622 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa18.42■□□□□ 0.54
KIAA0556-208ENST00000568622 PREX2Q70Z35 1606 aa18.4■□□□□ 0.54
KIAA0556-208ENST00000568622 CCDC18Q5T9S5 1454 aa18.39■□□□□ 0.54
KIAA0556-208ENST00000568622 ABCC1P33527 1531 aa18.39■□□□□ 0.54
KIAA0556-208ENST00000568622 AGLP35573 1532 aa18.38■□□□□ 0.53
KIAA0556-208ENST00000568622 ABCA6Q8N139 1617 aa18.38■□□□□ 0.53
KIAA0556-208ENST00000568622 PREX1Q8TCU6 1659 aa18.38■□□□□ 0.53
KIAA0556-208ENST00000568622 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa18.37■□□□□ 0.53
KIAA0556-208ENST00000568622 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
KIAA0556-208ENST00000568622 PLPPR3Q6T4P5 718 aa18.34■□□□□ 0.53
KIAA0556-208ENST00000568622 ITSN2Q9NZM3 1697 aa18.34■□□□□ 0.53
KIAA0556-208ENST00000568622 FYCO1Q9BQS8 1478 aa18.33■□□□□ 0.53
KIAA0556-208ENST00000568622 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa18.32■□□□□ 0.52
KIAA0556-208ENST00000568622 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa18.31■□□□□ 0.52
KIAA0556-208ENST00000568622 STRCQ7RTU9 1775 aa18.3■□□□□ 0.52
KIAA0556-208ENST00000568622 CERKQ8TCT0 537 aa18.3■□□□□ 0.52
KIAA0556-208ENST00000568622 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
KIAA0556-208ENST00000568622 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa18.28■□□□□ 0.52
KIAA0556-208ENST00000568622 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
KIAA0556-208ENST00000568622 C3P01024 1663 aa18.28■□□□□ 0.52
KIAA0556-208ENST00000568622 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa18.27■□□□□ 0.52
KIAA0556-208ENST00000568622 CNTLNQ9NXG0 1405 aa18.23■□□□□ 0.51
KIAA0556-208ENST00000568622 SYCP2Q9BX26 1530 aa18.23■□□□□ 0.51
KIAA0556-208ENST00000568622 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa18.23■□□□□ 0.51
KIAA0556-208ENST00000568622 ILDR2Q71H61 639 aa18.22■□□□□ 0.51
KIAA0556-208ENST00000568622 DMRT2Q9Y5R5 561 aa18.22■□□□□ 0.51
KIAA0556-208ENST00000568622 PTPRTO14522 1441 aa18.22■□□□□ 0.51
KIAA0556-208ENST00000568622 MYT1LQ9UL68 1186 aa18.21■□□□□ 0.51
KIAA0556-208ENST00000568622 PLXNC1O60486 1568 aa18.21■□□□□ 0.51
KIAA0556-208ENST00000568622 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
KIAA0556-208ENST00000568622 MROH2AA6NES4 1674 aa18.19■□□□□ 0.5
KIAA0556-208ENST00000568622 NPATQ14207 1427 aa18.19■□□□□ 0.5
KIAA0556-208ENST00000568622 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa18.18■□□□□ 0.5
KIAA0556-208ENST00000568622 ATP7AQ04656 1500 aa18.18■□□□□ 0.5
KIAA0556-208ENST00000568622 NCOA1Q15788 1441 aa18.16■□□□□ 0.5
KIAA0556-208ENST00000568622 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
KIAA0556-208ENST00000568622 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP18.15■□□□□ 0.5
KIAA0556-208ENST00000568622 LTBP4Q8N2S1 1624 aa18.15■□□□□ 0.5
KIAA0556-208ENST00000568622 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
KIAA0556-208ENST00000568622 ZMYM3Q14202 1370 aa18.14■□□□□ 0.49
KIAA0556-208ENST00000568622 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
KIAA0556-208ENST00000568622 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
KIAA0556-208ENST00000568622 CCNB3Q8WWL7 1395 aa18.13■□□□□ 0.49
KIAA0556-208ENST00000568622 A2MP01023 1474 aa18.13■□□□□ 0.49
KIAA0556-208ENST00000568622 SOCS7O14512 581 aa18.12■□□□□ 0.49
KIAA0556-208ENST00000568622 DISP3Q9P2K9 1392 aa18.12■□□□□ 0.49
KIAA0556-208ENST00000568622 MBD5Q9P267 1494 aa18.12■□□□□ 0.49
KIAA0556-208ENST00000568622 TIAM1Q13009 1591 aa18.11■□□□□ 0.49
KIAA0556-208ENST00000568622 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
KIAA0556-208ENST00000568622 IQSEC2Q5JU85 1478 aa18.09■□□□□ 0.49
KIAA0556-208ENST00000568622 MTUS2Q5JR59 1369 aa18.09■□□□□ 0.49
KIAA0556-208ENST00000568622 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa18.08■□□□□ 0.49
KIAA0556-208ENST00000568622 PTPRKQ15262 1439 aa18.08■□□□□ 0.49
KIAA0556-208ENST00000568622 CEP162Q5TB80 1403 aa18.08■□□□□ 0.49
KIAA0556-208ENST00000568622 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
KIAA0556-208ENST00000568622 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa18.08■□□□□ 0.48
KIAA0556-208ENST00000568622 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
KIAA0556-208ENST00000568622 PLA2R1Q13018 1463 aa18.07■□□□□ 0.48
KIAA0556-208ENST00000568622 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa18.06■□□□□ 0.48
KIAA0556-208ENST00000568622 PPP6R1Q9UPN7 881 aa18.06■□□□□ 0.48
KIAA0556-208ENST00000568622 ADGBQ8N7X0 1667 aa18.06■□□□□ 0.48
KIAA0556-208ENST00000568622 MYO3AQ8NEV4 1616 aa18.05■□□□□ 0.48
KIAA0556-208ENST00000568622 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
KIAA0556-208ENST00000568622 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
KIAA0556-208ENST00000568622 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
KIAA0556-208ENST00000568622 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
KIAA0556-208ENST00000568622 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa18■□□□□ 0.47
KIAA0556-208ENST00000568622 GGT6Q6P531 493 aa17.99■□□□□ 0.47
KIAA0556-208ENST00000568622 FAM135AQ9P2D6 1515 aa17.98■□□□□ 0.47
KIAA0556-208ENST00000568622 PKD2Q13563 968 aa17.98■□□□□ 0.47
KIAA0556-208ENST00000568622 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa17.98■□□□□ 0.47
KIAA0556-208ENST00000568622 NCOA2Q15596 1464 aa17.97■□□□□ 0.47
KIAA0556-208ENST00000568622 CCDC141Q6ZP82 1450 aa17.97■□□□□ 0.47
KIAA0556-208ENST00000568622 A2ML1A8K2U0 1454 aa17.96■□□□□ 0.47
KIAA0556-208ENST00000568622 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.2 ms