RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564630.5

CCNDBP1-205, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 2,079 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-205ENST00000564630 CCDC18Q5T9S5 1454 aa29.31■■■□□ 2.28
CCNDBP1-205ENST00000564630 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP29.31■■■□□ 2.28
CCNDBP1-205ENST00000564630 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa29.27■■■□□ 2.28
CCNDBP1-205ENST00000564630 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa29.23■■■□□ 2.27
CCNDBP1-205ENST00000564630 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP29.23■■■□□ 2.27
CCNDBP1-205ENST00000564630 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP29.22■■■□□ 2.27
CCNDBP1-205ENST00000564630 ABCA9Q8IUA7 1624 aa29.2■■■□□ 2.27
CCNDBP1-205ENST00000564630 FGD6Q6ZV73 1430 aa29.19■■■□□ 2.26
CCNDBP1-205ENST00000564630 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP29.19■■■□□ 2.26
CCNDBP1-205ENST00000564630 KIF14Q15058 1648 aa29.19■■■□□ 2.26
CCNDBP1-205ENST00000564630 CD109Q6YHK3 1445 aa29.18■■■□□ 2.26
CCNDBP1-205ENST00000564630 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP29.17■■■□□ 2.261e-13■□□□□ 8.8
CCNDBP1-205ENST00000564630 TTC37Q6PGP7 1564 aa29.17■■■□□ 2.26
CCNDBP1-205ENST00000564630 MTUS2Q5JR59 1369 aa29.14■■■□□ 2.26
CCNDBP1-205ENST00000564630 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
CCNDBP1-205ENST00000564630 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa29.07■■■□□ 2.24
CCNDBP1-205ENST00000564630 SIN3AQ96ST3 1273 aa29.07■■■□□ 2.24
CCNDBP1-205ENST00000564630 NCOA2Q15596 1464 aa29.06■■■□□ 2.24
CCNDBP1-205ENST00000564630 TEX14Q8IWB6 1497 aa29.06■■■□□ 2.24
CCNDBP1-205ENST00000564630 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa29.05■■■□□ 2.24
CCNDBP1-205ENST00000564630 MYOM3Q5VTT5 1437 aa29.03■■■□□ 2.24
CCNDBP1-205ENST00000564630 MYO5CQ9NQX4 1742 aa29■■■□□ 2.23
CCNDBP1-205ENST00000564630 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
CCNDBP1-205ENST00000564630 PTPN23Q9H3S7 1636 aa29■■■□□ 2.23
CCNDBP1-205ENST00000564630 HFM1A2PYH4 1435 aa29■■■□□ 2.23
CCNDBP1-205ENST00000564630 KDM6BO15054 1643 aa28.99■■■□□ 2.23
CCNDBP1-205ENST00000564630 PTPRKQ15262 1439 aa28.99■■■□□ 2.23
CCNDBP1-205ENST00000564630 PLCH2O75038 1416 aa28.95■■■□□ 2.22
CCNDBP1-205ENST00000564630 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
CCNDBP1-205ENST00000564630 FANCAO15360 1455 aa28.93■■■□□ 2.22
CCNDBP1-205ENST00000564630 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa28.93■■■□□ 2.22
CCNDBP1-205ENST00000564630 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa28.91■■■□□ 2.22
CCNDBP1-205ENST00000564630 PREX2Q70Z35 1606 aa28.9■■■□□ 2.22
CCNDBP1-205ENST00000564630 ARHGAP5Q13017 1502 aa28.9■■■□□ 2.22
CCNDBP1-205ENST00000564630 NEO1Q92859 1461 aa28.89■■■□□ 2.22
CCNDBP1-205ENST00000564630 NAIPQ13075 1403 aa28.89■■■□□ 2.21
CCNDBP1-205ENST00000564630 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP28.87■■■□□ 2.21
CCNDBP1-205ENST00000564630 CFAP74Q9C0B2 1584 aa28.87■■■□□ 2.21
CCNDBP1-205ENST00000564630 AKNAQ7Z591 1439 aa28.85■■■□□ 2.21
CCNDBP1-205ENST00000564630 ARAP3Q8WWN8 1544 aa28.85■■■□□ 2.21
CCNDBP1-205ENST00000564630 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP28.85■■■□□ 2.21
CCNDBP1-205ENST00000564630 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP28.84■■■□□ 2.21
CCNDBP1-205ENST00000564630 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa28.82■■■□□ 2.2
CCNDBP1-205ENST00000564630 GCC2Q8IWJ2 1684 aa28.8■■■□□ 2.2
CCNDBP1-205ENST00000564630 ADGRL1O94910 1474 aa28.79■■■□□ 2.2
CCNDBP1-205ENST00000564630 TONSLQ96HA7 1378 aa28.78■■■□□ 2.2
CCNDBP1-205ENST00000564630 RAPGEF3O95398 923 aa28.78■■■□□ 2.2
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP28.78■■■□□ 2.2
CCNDBP1-205ENST00000564630 ITSN2Q9NZM3 1697 aa28.77■■■□□ 2.2
CCNDBP1-205ENST00000564630 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP28.75■■■□□ 2.19
CCNDBP1-205ENST00000564630 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa28.75■■■□□ 2.19
CCNDBP1-205ENST00000564630 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP28.74■■■□□ 2.19
CCNDBP1-205ENST00000564630 SCAPERQ9BY12 1400 aa28.74■■■□□ 2.19
CCNDBP1-205ENST00000564630 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa28.74■■■□□ 2.19
CCNDBP1-205ENST00000564630 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP28.72■■■□□ 2.19
CCNDBP1-205ENST00000564630 RICTORQ6R327 1708 aa28.72■■■□□ 2.19
CCNDBP1-205ENST00000564630 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa28.71■■■□□ 2.19
CCNDBP1-205ENST00000564630 MIA2Q96PC5 1412 aa28.7■■■□□ 2.19
CCNDBP1-205ENST00000564630 ABCC1P33527 1531 aa28.7■■■□□ 2.19
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP28.68■■■□□ 2.18
CCNDBP1-205ENST00000564630 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa28.68■■■□□ 2.18
CCNDBP1-205ENST00000564630 POGZQ7Z3K3 1410 aa28.66■■■□□ 2.18
CCNDBP1-205ENST00000564630 SYCP2Q9BX26 1530 aa28.66■■■□□ 2.18
CCNDBP1-205ENST00000564630 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa28.63■■■□□ 2.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP28.62■■■□□ 2.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa28.62■■■□□ 2.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP28.62■■■□□ 2.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 AFAP1Q8N556 730 aa28.61■■■□□ 2.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 CHIC2Q9UKJ5 165 aa28.6■■■□□ 2.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa28.6■■■□□ 2.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa28.58■■■□□ 2.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa28.56■■■□□ 2.16
CCNDBP1-205ENST00000564630 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa28.56■■■□□ 2.16
CCNDBP1-205ENST00000564630 ANP32EQ9BTT0 268 aa28.55■■■□□ 2.16
CCNDBP1-205ENST00000564630 KDM5CP41229 1560 aa28.54■■■□□ 2.16
CCNDBP1-205ENST00000564630 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa28.54■■■□□ 2.16
CCNDBP1-205ENST00000564630 YEATS2Q9ULM3 1422 aa28.52■■■□□ 2.16
CCNDBP1-205ENST00000564630 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 MBD5Q9P267 1494 aa28.51■■■□□ 2.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 CCER2I3L3R5 266 aa28.5■■■□□ 2.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 MYT1LQ9UL68 1186 aa28.5■■■□□ 2.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa28.5■■■□□ 2.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 HECW2Q9P2P5 1572 aa28.49■■■□□ 2.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa28.49■■■□□ 2.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 TRIM52Q96A61 297 aa28.49■■■□□ 2.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 ANP32CO43423 234 aa28.48■■■□□ 2.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 DAPK1P53355 1430 aa28.48■■■□□ 2.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 ROCK1Q13464 1354 aa28.47■■■□□ 2.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 MAGI2Q86UL8 1455 aa28.44■■■□□ 2.14
CCNDBP1-205ENST00000564630 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa28.43■■■□□ 2.14
CCNDBP1-205ENST00000564630 MPHOSPH9Q99550 1183 aa28.43■■■□□ 2.14
CCNDBP1-205ENST00000564630 CCDC141Q6ZP82 1450 aa28.43■■■□□ 2.14
CCNDBP1-205ENST00000564630 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP28.42■■■□□ 2.14
CCNDBP1-205ENST00000564630 MLH3Q9UHC1 1453 aa28.42■■■□□ 2.14
CCNDBP1-205ENST00000564630 ABCC5O15440 1437 aa28.42■■■□□ 2.14
CCNDBP1-205ENST00000564630 ABCA6Q8N139 1617 aa28.42■■■□□ 2.14
CCNDBP1-205ENST00000564630 ARHGEF5Q12774 1597 aa28.41■■■□□ 2.14
CCNDBP1-205ENST00000564630 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP28.39■■■□□ 2.14
CCNDBP1-205ENST00000564630 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa28.39■■■□□ 2.14
CCNDBP1-205ENST00000564630 ATP7AQ04656 1500 aa28.39■■■□□ 2.14
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