RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557471.5

PAPOLA-225, Transcript of poly(A) polymerase alpha, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PAPOLA, Length 1,421 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLA-225ENST00000557471 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP37.53■■■■□ 3.6
PAPOLA-225ENST00000557471 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP37.53■■■■□ 3.6
PAPOLA-225ENST00000557471 AKNAQ7Z591 1439 aa37.52■■■■□ 3.6
PAPOLA-225ENST00000557471 KDM6BO15054 1643 aa37.51■■■■□ 3.6
PAPOLA-225ENST00000557471 PREX2Q70Z35 1606 aa37.5■■■■□ 3.59
PAPOLA-225ENST00000557471 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa37.47■■■■□ 3.59
PAPOLA-225ENST00000557471 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP37.45■■■■□ 3.59
PAPOLA-225ENST00000557471 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa37.44■■■■□ 3.58
PAPOLA-225ENST00000557471 ITSN2Q9NZM3 1697 aa37.42■■■■□ 3.58
PAPOLA-225ENST00000557471 ADGRL1O94910 1474 aa37.41■■■■□ 3.58
PAPOLA-225ENST00000557471 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP37.39■■■■□ 3.58
PAPOLA-225ENST00000557471 SCAPERQ9BY12 1400 aa37.38■■■■□ 3.57
PAPOLA-225ENST00000557471 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP37.37■■■■□ 3.57
PAPOLA-225ENST00000557471 MYOM3Q5VTT5 1437 aa37.34■■■■□ 3.57
PAPOLA-225ENST00000557471 RAPGEF3O95398 923 aa37.33■■■■□ 3.57
PAPOLA-225ENST00000557471 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP37.33■■■■□ 3.57
PAPOLA-225ENST00000557471 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa37.32■■■■□ 3.56
PAPOLA-225ENST00000557471 MIA2Q96PC5 1412 aa37.3■■■■□ 3.56
PAPOLA-225ENST00000557471 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa37.25■■■■□ 3.55
PAPOLA-225ENST00000557471 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa37.24■■■■□ 3.55
PAPOLA-225ENST00000557471 ABCC1P33527 1531 aa37.24■■■■□ 3.55
PAPOLA-225ENST00000557471 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP37.23■■■■□ 3.55
PAPOLA-225ENST00000557471 POGZQ7Z3K3 1410 aa37.23■■■■□ 3.55
PAPOLA-225ENST00000557471 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP37.22■■■■□ 3.55
PAPOLA-225ENST00000557471 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa37.21■■■■□ 3.55
PAPOLA-225ENST00000557471 AFAP1Q8N556 730 aa37.19■■■■□ 3.54
PAPOLA-225ENST00000557471 RSPH4AQ5TD94 716 aa37.18■■■■□ 3.54
PAPOLA-225ENST00000557471 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa37.17■■■■□ 3.54
PAPOLA-225ENST00000557471 SYCP2Q9BX26 1530 aa37.16■■■■□ 3.54
PAPOLA-225ENST00000557471 FGD6Q6ZV73 1430 aa37.16■■■■□ 3.54
PAPOLA-225ENST00000557471 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa37.16■■■■□ 3.54
PAPOLA-225ENST00000557471 RICTORQ6R327 1708 aa37.15■■■■□ 3.54
PAPOLA-225ENST00000557471 MYT1LQ9UL68 1186 aa37.15■■■■□ 3.54
PAPOLA-225ENST00000557471 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa37.13■■■■□ 3.53
PAPOLA-225ENST00000557471 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa37.12■■■■□ 3.53
PAPOLA-225ENST00000557471 MAGI2Q86UL8 1455 aa37.09■■■■□ 3.53
PAPOLA-225ENST00000557471 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa37.07■■■■□ 3.53
PAPOLA-225ENST00000557471 MBD5Q9P267 1494 aa37.07■■■■□ 3.52
PAPOLA-225ENST00000557471 PTPN23Q9H3S7 1636 aa37.07■■■■□ 3.52
PAPOLA-225ENST00000557471 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP37.05■■■■□ 3.52
PAPOLA-225ENST00000557471 TSPY4P0CV99 314 aa37.04■■■■□ 3.52
PAPOLA-225ENST00000557471 TSPY10P0CW01 314 aa37.04■■■■□ 3.52
PAPOLA-225ENST00000557471 KDM5CP41229 1560 aa37.04■■■■□ 3.52
PAPOLA-225ENST00000557471 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP37.03■■■■□ 3.52
PAPOLA-225ENST00000557471 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP37.02■■■■□ 3.52
PAPOLA-225ENST00000557471 CCDC141Q6ZP82 1450 aa37.02■■■■□ 3.52
PAPOLA-225ENST00000557471 MLH3Q9UHC1 1453 aa37■■■■□ 3.51
PAPOLA-225ENST00000557471 ARHGEF5Q12774 1597 aa36.98■■■■□ 3.51
PAPOLA-225ENST00000557471 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa36.98■■■■□ 3.51
PAPOLA-225ENST00000557471 HECW2Q9P2P5 1572 aa36.96■■■■□ 3.51
PAPOLA-225ENST00000557471 YEATS2Q9ULM3 1422 aa36.92■■■■□ 3.5
PAPOLA-225ENST00000557471 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa36.9■■■■□ 3.5
PAPOLA-225ENST00000557471 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa36.9■■■■□ 3.5
PAPOLA-225ENST00000557471 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP36.87■■■■□ 3.49
PAPOLA-225ENST00000557471 ATP10AO60312 1499 aa36.87■■■■□ 3.49
PAPOLA-225ENST00000557471 ATP7AQ04656 1500 aa36.86■■■■□ 3.49
PAPOLA-225ENST00000557471 DAPK1P53355 1430 aa36.84■■■■□ 3.49
PAPOLA-225ENST00000557471 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP36.84■■■■□ 3.49
PAPOLA-225ENST00000557471 ABCC5O15440 1437 aa36.83■■■■□ 3.49
PAPOLA-225ENST00000557471 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa36.83■■■■□ 3.49
PAPOLA-225ENST00000557471 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP36.82■■■■□ 3.48
PAPOLA-225ENST00000557471 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP36.82■■■■□ 3.48
PAPOLA-225ENST00000557471 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP36.81■■■■□ 3.48
PAPOLA-225ENST00000557471 C9orf84Q5VXU9 1444 aa36.81■■■■□ 3.48
PAPOLA-225ENST00000557471 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa36.78■■■■□ 3.48
PAPOLA-225ENST00000557471 SHANK2Q9UPX8 1470 aa36.78■■■■□ 3.48
PAPOLA-225ENST00000557471 MAST1Q9Y2H9 1570 aa36.76■■■■□ 3.48
PAPOLA-225ENST00000557471 ABCA6Q8N139 1617 aa36.76■■■■□ 3.47
PAPOLA-225ENST00000557471 CHIC2Q9UKJ5 165 aa36.73■■■■□ 3.47
PAPOLA-225ENST00000557471 ITGAEP38570 1179 aa36.72■■■■□ 3.47
PAPOLA-225ENST00000557471 CROCC2H7BZ55 1655 aa36.7■■■■□ 3.47
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PAPOLA-225ENST00000557471 A2MP01023 1474 aa36.69■■■■□ 3.46
PAPOLA-225ENST00000557471 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa36.69■■■■□ 3.46
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PAPOLA-225ENST00000557471 AGLP35573 1532 aa36.6■■■■□ 3.45
PAPOLA-225ENST00000557471 NCOA1Q15788 1441 aa36.59■■■■□ 3.45
PAPOLA-225ENST00000557471 MLECQ14165 292 aa36.58■■■■□ 3.45
PAPOLA-225ENST00000557471 ADGRL2O95490 1459 aa36.57■■■■□ 3.45
PAPOLA-225ENST00000557471 PTPRKQ15262 1439 aa36.56■■■■□ 3.44
PAPOLA-225ENST00000557471 ROCK1Q13464 1354 aa36.55■■■■□ 3.44
PAPOLA-225ENST00000557471 DUOX2Q9NRD8 1548 aa36.54■■■■□ 3.44
PAPOLA-225ENST00000557471 KIF3BO15066 747 aa36.52■■■■□ 3.44
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PAPOLA-225ENST00000557471 BCORL1Q5H9F3 1711 aa36.49■■■■□ 3.43
PAPOLA-225ENST00000557471 GGT6Q6P531 493 aa36.48■■■■□ 3.43
PAPOLA-225ENST00000557471 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP36.48■■■■□ 3.43
PAPOLA-225ENST00000557471 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa36.47■■■■□ 3.43
PAPOLA-225ENST00000557471 ERBINQ96RT1 1412 aa36.46■■■■□ 3.43
PAPOLA-225ENST00000557471 PPP6R1Q9UPN7 881 aa36.42■■■■□ 3.42
PAPOLA-225ENST00000557471 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa36.39■■■■□ 3.42
PAPOLA-225ENST00000557471 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP36.39■■■■□ 3.42
PAPOLA-225ENST00000557471 ADAMTSL3P82987 1691 aa36.38■■■■□ 3.41
PAPOLA-225ENST00000557471 MADDQ8WXG6 1647 aa36.3■■■■□ 3.4
PAPOLA-225ENST00000557471 CNTLNQ9NXG0 1405 aa36.3■■■■□ 3.4
PAPOLA-225ENST00000557471 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa36.28■■■■□ 3.4
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