RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555638.5

TMEM229B-205, Transcript of transmembrane protein 229B, humanhuman

TSL 2

Gene TMEM229B, Length 2,812 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM229B-205ENST00000555638 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.3■■□□□ 1.32
TMEM229B-205ENST00000555638 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.29■■□□□ 1.32
TMEM229B-205ENST00000555638 RCAN3Q9UKA8 241 aa23.29■■□□□ 1.32
TMEM229B-205ENST00000555638 CLCN1P35523 988 aa23.25■■□□□ 1.31
TMEM229B-205ENST00000555638 POGKQ9P215 609 aa23.25■■□□□ 1.31
TMEM229B-205ENST00000555638 SKAP1Q86WV1 359 aa23.25■■□□□ 1.31
TMEM229B-205ENST00000555638 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
TMEM229B-205ENST00000555638 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
TMEM229B-205ENST00000555638 NAIPQ13075 1403 aa23.23■■□□□ 1.31
TMEM229B-205ENST00000555638 FMN1Q68DA7 1419 aa23.22■■□□□ 1.31
TMEM229B-205ENST00000555638 PTPRKQ15262 1439 aa23.22■■□□□ 1.31
TMEM229B-205ENST00000555638 FGD6Q6ZV73 1430 aa23.22■■□□□ 1.31
TMEM229B-205ENST00000555638 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
TMEM229B-205ENST00000555638 L3MBTL2Q969R5 705 aa23.18■■□□□ 1.3
TMEM229B-205ENST00000555638 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
TMEM229B-205ENST00000555638 TMC1Q8TDI8 760 aa23.17■■□□□ 1.3
TMEM229B-205ENST00000555638 FAM161AQ3B820 660 aa23.16■■□□□ 1.3
TMEM229B-205ENST00000555638 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
TMEM229B-205ENST00000555638 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa23.16■■□□□ 1.3
TMEM229B-205ENST00000555638 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
TMEM229B-205ENST00000555638 C8orf34Q49A92 452 aa23.13■■□□□ 1.29
TMEM229B-205ENST00000555638 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
TMEM229B-205ENST00000555638 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
TMEM229B-205ENST00000555638 NBPF8Q3BBV2 869 aa23.09■■□□□ 1.29
TMEM229B-205ENST00000555638 CRBNQ96SW2 442 aa23.09■■□□□ 1.29
TMEM229B-205ENST00000555638 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
TMEM229B-205ENST00000555638 PDE3BQ13370 1112 aa23.08■■□□□ 1.28
TMEM229B-205ENST00000555638 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP23.07■■□□□ 1.28
TMEM229B-205ENST00000555638 RBM10P98175 930 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
TMEM229B-205ENST00000555638 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
TMEM229B-205ENST00000555638 KDM2BQ8NHM5 1336 aa23.06■■□□□ 1.28
TMEM229B-205ENST00000555638 PLIN1O60240 522 aa23.05■■□□□ 1.28
TMEM229B-205ENST00000555638 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa23.04■■□□□ 1.28
TMEM229B-205ENST00000555638 FYCO1Q9BQS8 1478 aa23.04■■□□□ 1.28
TMEM229B-205ENST00000555638 HECW1Q76N89 1606 aa23.04■■□□□ 1.28
TMEM229B-205ENST00000555638 PDCL3Q9H2J4 239 aa23.04■■□□□ 1.28
TMEM229B-205ENST00000555638 CUX1P39880 1505 aa23.03■■□□□ 1.28
TMEM229B-205ENST00000555638 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
TMEM229B-205ENST00000555638 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
TMEM229B-205ENST00000555638 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
TMEM229B-205ENST00000555638 ARXQ96QS3 562 aa23.02■■□□□ 1.28
TMEM229B-205ENST00000555638 MIA2Q96PC5 1412 aa23.01■■□□□ 1.27
TMEM229B-205ENST00000555638 POLR3GLQ9BT43 218 aa23.01■■□□□ 1.27
TMEM229B-205ENST00000555638 FSD2A1L4K1 749 aa23■■□□□ 1.27
TMEM229B-205ENST00000555638 P3H3Q8IVL6 736 aa23■■□□□ 1.27
TMEM229B-205ENST00000555638 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
TMEM229B-205ENST00000555638 TPM2P07951 284 aa22.99■■□□□ 1.27
TMEM229B-205ENST00000555638 AAMPQ13685 434 aa22.99■■□□□ 1.27
TMEM229B-205ENST00000555638 PANK2Q9BZ23 570 aa22.99■■□□□ 1.27
TMEM229B-205ENST00000555638 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.98■■□□□ 1.27
TMEM229B-205ENST00000555638 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.97■■□□□ 1.27
TMEM229B-205ENST00000555638 PRDM4Q9UKN5 801 aa22.97■■□□□ 1.27
TMEM229B-205ENST00000555638 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.96■■□□□ 1.27
TMEM229B-205ENST00000555638 IGF1RP08069 1367 aa22.95■■□□□ 1.27
TMEM229B-205ENST00000555638 MPHOSPH9Q99550 1183 aa22.95■■□□□ 1.27
TMEM229B-205ENST00000555638 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.94■■□□□ 1.26
TMEM229B-205ENST00000555638 BECN1Q14457 450 aa22.94■■□□□ 1.26
TMEM229B-205ENST00000555638 TEX14Q8IWB6 1497 aa22.94■■□□□ 1.26
TMEM229B-205ENST00000555638 CDCA7LQ96GN5 454 aa22.93■■□□□ 1.26
TMEM229B-205ENST00000555638 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
TMEM229B-205ENST00000555638 ESPNB1AK53 854 aa22.93■■□□□ 1.26
TMEM229B-205ENST00000555638 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
TMEM229B-205ENST00000555638 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
TMEM229B-205ENST00000555638 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
TMEM229B-205ENST00000555638 KIF15Q9NS87 1388 aa22.91■■□□□ 1.26
TMEM229B-205ENST00000555638 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.91■■□□□ 1.26
TMEM229B-205ENST00000555638 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.9■■□□□ 1.26
TMEM229B-205ENST00000555638 FOXD1Q16676 465 aa22.9■■□□□ 1.26
TMEM229B-205ENST00000555638 UNC13AQ9UPW8 1703 aa22.9■■□□□ 1.26
TMEM229B-205ENST00000555638 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.9■■□□□ 1.26
TMEM229B-205ENST00000555638 FGD1P98174 961 aa22.9■■□□□ 1.26
TMEM229B-205ENST00000555638 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.26
TMEM229B-205ENST00000555638 RGS3P49796 1198 aa22.89■■□□□ 1.25
TMEM229B-205ENST00000555638 C20orf194Q5TEA3 1177 aa22.88■■□□□ 1.25
TMEM229B-205ENST00000555638 MRE11P49959 708 aa22.88■■□□□ 1.25
TMEM229B-205ENST00000555638 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.87■■□□□ 1.25
TMEM229B-205ENST00000555638 RALBP1Q15311 655 aa22.87■■□□□ 1.25
TMEM229B-205ENST00000555638 ANTXR1Q9H6X2 564 aa22.86■■□□□ 1.25
TMEM229B-205ENST00000555638 USP19O94966 1318 aa22.86■■□□□ 1.25
TMEM229B-205ENST00000555638 BCORL1Q5H9F3 1711 aa22.86■■□□□ 1.25
TMEM229B-205ENST00000555638 ERBB4Q15303 1308 aa22.86■■□□□ 1.25
TMEM229B-205ENST00000555638 GCC2Q8IWJ2 1684 aa22.86■■□□□ 1.25
TMEM229B-205ENST00000555638 USP47Q96K76 1375 aa22.85■■□□□ 1.25
TMEM229B-205ENST00000555638 MYH16Q9H6N6 1097 aa22.85■■□□□ 1.25
TMEM229B-205ENST00000555638 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa22.85■■□□□ 1.25
TMEM229B-205ENST00000555638 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
TMEM229B-205ENST00000555638 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.84■■□□□ 1.25
TMEM229B-205ENST00000555638 KDM6BO15054 1643 aa22.81■■□□□ 1.24
TMEM229B-205ENST00000555638 MCM4P33991 863 aa22.79■■□□□ 1.24
TMEM229B-205ENST00000555638 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
TMEM229B-205ENST00000555638 PDE4CQ08493 712 aa22.77■■□□□ 1.24
TMEM229B-205ENST00000555638 GRPEL1Q9HAV7 217 aa22.77■■□□□ 1.24
TMEM229B-205ENST00000555638 NLRP13Q86W25 1043 aa22.77■■□□□ 1.24
TMEM229B-205ENST00000555638 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.77■■□□□ 1.24
TMEM229B-205ENST00000555638 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa22.77■■□□□ 1.23
TMEM229B-205ENST00000555638 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
TMEM229B-205ENST00000555638 TRAK2O60296 914 aa22.73■■□□□ 1.23
TMEM229B-205ENST00000555638 SEC24BO95487 1268 aa22.71■■□□□ 1.23
TMEM229B-205ENST00000555638 MAP7D2Q96T17 732 aa22.71■■□□□ 1.23
TMEM229B-205ENST00000555638 KDM5CP41229 1560 aa22.7■■□□□ 1.22
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