RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550044.1

CS-217, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 546 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-217ENST00000550044 KIF27Q86VH2 1401 aa16.32■□□□□ 0.2
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CS-217ENST00000550044 KIF21BO75037 1637 aa16.27■□□□□ 0.2
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CS-217ENST00000550044 SSUH2Q9Y2M2 353 aa16.26■□□□□ 0.19
CS-217ENST00000550044 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa16.26■□□□□ 0.19
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CS-217ENST00000550044 CFAP43Q8NDM7 1665 aa16.2■□□□□ 0.18
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CS-217ENST00000550044 CSRNP3Q8WYN3 585 aa16.05■□□□□ 0.16
CS-217ENST00000550044 BCORL1Q5H9F3 1711 aa16.04■□□□□ 0.16
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CS-217ENST00000550044 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa15.96■□□□□ 0.14
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CS-217ENST00000550044 DISP3Q9P2K9 1392 aa15.94■□□□□ 0.14
CS-217ENST00000550044 ILDR2Q71H61 639 aa15.93■□□□□ 0.14
CS-217ENST00000550044 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
CS-217ENST00000550044 PHLDB1Q86UU1 1377 aa15.92■□□□□ 0.14
CS-217ENST00000550044 CERKQ8TCT0 537 aa15.92■□□□□ 0.14
CS-217ENST00000550044 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa15.91■□□□□ 0.14
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CS-217ENST00000550044 NEO1Q92859 1461 aa15.91■□□□□ 0.14
CS-217ENST00000550044 POTEIP0CG38 1075 aa15.9■□□□□ 0.14
CS-217ENST00000550044 ATP10BO94823 1461 aa15.9■□□□□ 0.14
CS-217ENST00000550044 DCBLD2Q96PD2 775 aa15.89■□□□□ 0.13
CS-217ENST00000550044 PLSCR2Q9NRY7 297 aa15.86■□□□□ 0.13
CS-217ENST00000550044 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
CS-217ENST00000550044 RICTORQ6R327 1708 aa15.84■□□□□ 0.13
CS-217ENST00000550044 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa15.83■□□□□ 0.12
CS-217ENST00000550044 P3H3Q8IVL6 736 aa15.82■□□□□ 0.12
CS-217ENST00000550044 FANCAO15360 1455 aa15.82■□□□□ 0.12
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CS-217ENST00000550044 POGZQ7Z3K3 1410 aa15.8■□□□□ 0.12
CS-217ENST00000550044 AKNAQ7Z591 1439 aa15.78■□□□□ 0.12
CS-217ENST00000550044 MLECQ14165 292 aa15.77■□□□□ 0.12
CS-217ENST00000550044 TTC37Q6PGP7 1564 aa15.77■□□□□ 0.11
CS-217ENST00000550044 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa15.77■□□□□ 0.11
CS-217ENST00000550044 CFAP74Q9C0B2 1584 aa15.76■□□□□ 0.11
CS-217ENST00000550044 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa15.76■□□□□ 0.11
CS-217ENST00000550044 PREX1Q8TCU6 1659 aa15.76■□□□□ 0.11
CS-217ENST00000550044 FHOD3Q2V2M9 1422 aa15.76■□□□□ 0.11
CS-217ENST00000550044 YEATS2Q9ULM3 1422 aa15.76■□□□□ 0.11
CS-217ENST00000550044 EFCAB5A4FU69 1503 aa15.75■□□□□ 0.11
CS-217ENST00000550044 SAMD9Q5K651 1589 aa15.73■□□□□ 0.11
CS-217ENST00000550044 STRCQ7RTU9 1775 aa15.72■□□□□ 0.11
CS-217ENST00000550044 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP15.71■□□□□ 0.11
CS-217ENST00000550044 HECW1Q76N89 1606 aa15.7■□□□□ 0.1
CS-217ENST00000550044 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP15.7■□□□□ 0.1
CS-217ENST00000550044 ZRANB1Q9UGI0 708 aa15.7■□□□□ 0.1
CS-217ENST00000550044 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP15.68■□□□□ 0.12e-20■□□□□ 10.1
CS-217ENST00000550044 MAGI2Q86UL8 1455 aa15.68■□□□□ 0.1
CS-217ENST00000550044 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa15.68■□□□□ 0.1
CS-217ENST00000550044 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP15.66■□□□□ 0.1
CS-217ENST00000550044 PLEKHD1A6NEE1 506 aa15.64■□□□□ 0.09
CS-217ENST00000550044 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa15.63■□□□□ 0.09
CS-217ENST00000550044 C9orf84Q5VXU9 1444 aa15.62■□□□□ 0.09
CS-217ENST00000550044 ATP10AO60312 1499 aa15.61■□□□□ 0.09
CS-217ENST00000550044 SCAPERQ9BY12 1400 aa15.6■□□□□ 0.09
CS-217ENST00000550044 STAG3Q9UJ98 1225 aa15.59■□□□□ 0.09
CS-217ENST00000550044 LTBP4Q8N2S1 1624 aa15.58■□□□□ 0.09
CS-217ENST00000550044 PTPRTO14522 1441 aa15.58■□□□□ 0.08
CS-217ENST00000550044 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa15.57■□□□□ 0.08
CS-217ENST00000550044 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
CS-217ENST00000550044 C3P01024 1663 aa15.55■□□□□ 0.08
CS-217ENST00000550044 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
CS-217ENST00000550044 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
CS-217ENST00000550044 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
CS-217ENST00000550044 IQSEC2Q5JU85 1478 aa15.54■□□□□ 0.08
CS-217ENST00000550044 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa15.54■□□□□ 0.08
CS-217ENST00000550044 MYO5CQ9NQX4 1742 aa15.54■□□□□ 0.08
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