RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548220.1

PTPRR-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRR, Length 1,374 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-207ENST00000548220 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
PTPRR-207ENST00000548220 KIAA0556O60303 1618 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRR-207ENST00000548220 PLSCR2Q9NRY7 297 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRR-207ENST00000548220 ARAP1Q96P48 1450 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRR-207ENST00000548220 PTPRGP23470 1445 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRR-207ENST00000548220 VPS8Q8N3P4 1428 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRR-207ENST00000548220 MAP3K1Q13233 1512 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRR-207ENST00000548220 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRR-207ENST00000548220 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRR-207ENST00000548220 ARHGEF11O15085 1522 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRR-207ENST00000548220 FYCO1Q9BQS8 1478 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRR-207ENST00000548220 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
PTPRR-207ENST00000548220 CYB5RLQ6IPT4 315 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRR-207ENST00000548220 ABCA8O94911 1581 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRR-207ENST00000548220 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
PTPRR-207ENST00000548220 FHOD3Q2V2M9 1422 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRR-207ENST00000548220 UACAQ9BZF9 1416 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRR-207ENST00000548220 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRR-207ENST00000548220 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRR-207ENST00000548220 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRR-207ENST00000548220 PHF12Q96QT6 1004 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRR-207ENST00000548220 ERCC6L2Q5T890 1561 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRR-207ENST00000548220 CCDC18Q5T9S5 1454 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRR-207ENST00000548220 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRR-207ENST00000548220 HECW1Q76N89 1606 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRR-207ENST00000548220 ABCC2Q92887 1545 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRR-207ENST00000548220 P3H3Q8IVL6 736 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRR-207ENST00000548220 PROM2Q8N271 834 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRR-207ENST00000548220 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
PTPRR-207ENST00000548220 KDM5BQ9UGL1 1544 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRR-207ENST00000548220 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
PTPRR-207ENST00000548220 PLB1Q6P1J6 1458 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRR-207ENST00000548220 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
PTPRR-207ENST00000548220 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
PTPRR-207ENST00000548220 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
PTPRR-207ENST00000548220 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
PTPRR-207ENST00000548220 ATP10BO94823 1461 aa9.71□□□□□ -0.85
PTPRR-207ENST00000548220 ADCY10Q96PN6 1610 aa9.71□□□□□ -0.85
PTPRR-207ENST00000548220 CFAP43Q8NDM7 1665 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRR-207ENST00000548220 TIAM1Q13009 1591 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRR-207ENST00000548220 PLEKHG5O94827 1062 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRR-207ENST00000548220 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRR-207ENST00000548220 MAPKBP1O60336 1514 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRR-207ENST00000548220 PLEKHD1A6NEE1 506 aa9.67□□□□□ -0.86
PTPRR-207ENST00000548220 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
PTPRR-207ENST00000548220 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRR-207ENST00000548220 MS4A3Q96HJ5 214 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRR-207ENST00000548220 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
PTPRR-207ENST00000548220 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRR-207ENST00000548220 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
PTPRR-207ENST00000548220 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
PTPRR-207ENST00000548220 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
PTPRR-207ENST00000548220 MTUS2Q5JR59 1369 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRR-207ENST00000548220 WDR7Q9Y4E6 1490 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRR-207ENST00000548220 SLC39A7Q92504 469 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRR-207ENST00000548220 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
PTPRR-207ENST00000548220 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
PTPRR-207ENST00000548220 OTUD5Q96G74 571 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRR-207ENST00000548220 ARAP3Q8WWN8 1544 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRR-207ENST00000548220 ASXL2Q76L83 1435 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRR-207ENST00000548220 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
PTPRR-207ENST00000548220 C7P10643 843 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRR-207ENST00000548220 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
PTPRR-207ENST00000548220 METRNQ9UJH8 293 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRR-207ENST00000548220 CCDC61Q9Y6R9 512 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRR-207ENST00000548220 KIF14Q15058 1648 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRR-207ENST00000548220 GLI2P10070 1586 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRR-207ENST00000548220 MIER1Q8N108 512 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRR-207ENST00000548220 POTEB2H3BUK9 544 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRR-207ENST00000548220 MIA2Q96PC5 1412 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRR-207ENST00000548220 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRR-207ENST00000548220 ABCA9Q8IUA7 1624 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRR-207ENST00000548220 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
PTPRR-207ENST00000548220 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP9.58□□□□□ -0.88
PTPRR-207ENST00000548220 NCOA2Q15596 1464 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRR-207ENST00000548220 ABCC10Q5T3U5 1492 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRR-207ENST00000548220 PHLDB1Q86UU1 1377 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRR-207ENST00000548220 ARID3CA6NKF2 412 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRR-207ENST00000548220 ITSN2Q9NZM3 1697 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRR-207ENST00000548220 KIF12Q96FN5 646 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRR-207ENST00000548220 MYOM3Q5VTT5 1437 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRR-207ENST00000548220 MYO5CQ9NQX4 1742 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRR-207ENST00000548220 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP9.54□□□□□ -0.88
PTPRR-207ENST00000548220 MAMSTRQ6ZN01 415 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRR-207ENST00000548220 PLCH2O75038 1416 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRR-207ENST00000548220 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
PTPRR-207ENST00000548220 CCNB3Q8WWL7 1395 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRR-207ENST00000548220 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRR-207ENST00000548220 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
PTPRR-207ENST00000548220 RSPH4AQ5TD94 716 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRR-207ENST00000548220 PLCD3Q8N3E9 789 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRR-207ENST00000548220 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
PTPRR-207ENST00000548220 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRR-207ENST00000548220 DIP2BQ9P265 1576 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRR-207ENST00000548220 PREX2Q70Z35 1606 aa9.52□□□□□ -0.88
PTPRR-207ENST00000548220 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRR-207ENST00000548220 CFAP74Q9C0B2 1584 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRR-207ENST00000548220 KIF13AQ9H1H9 1805 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRR-207ENST00000548220 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRR-207ENST00000548220 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa9.51□□□□□ -0.89
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