RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542663.1

CLSTN3-214, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 2

Gene CLSTN3, Length 390 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-214ENST00000542663 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa29.84■■■□□ 2.37
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CLSTN3-214ENST00000542663 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa29.78■■■□□ 2.36
CLSTN3-214ENST00000542663 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa29.77■■■□□ 2.36
CLSTN3-214ENST00000542663 PREX1Q8TCU6 1659 aa29.76■■■□□ 2.36
CLSTN3-214ENST00000542663 MLECQ14165 292 aa29.76■■■□□ 2.35
CLSTN3-214ENST00000542663 FMN1Q68DA7 1419 aa29.76■■■□□ 2.35
CLSTN3-214ENST00000542663 ATP10AO60312 1499 aa29.75■■■□□ 2.35
CLSTN3-214ENST00000542663 C9orf84Q5VXU9 1444 aa29.73■■■□□ 2.35
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CLSTN3-214ENST00000542663 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa29.64■■■□□ 2.33
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CLSTN3-214ENST00000542663 PREX2Q70Z35 1606 aa29.6■■■□□ 2.33
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CLSTN3-214ENST00000542663 AFAP1Q8N556 730 aa29.57■■■□□ 2.32
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CLSTN3-214ENST00000542663 AGLP35573 1532 aa29.46■■■□□ 2.31
CLSTN3-214ENST00000542663 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa29.45■■■□□ 2.31
CLSTN3-214ENST00000542663 CCDC18Q5T9S5 1454 aa29.44■■■□□ 2.3
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CLSTN3-214ENST00000542663 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa29.43■■■□□ 2.3
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CLSTN3-214ENST00000542663 LTBP4Q8N2S1 1624 aa29.27■■■□□ 2.28
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CLSTN3-214ENST00000542663 PLXNC1O60486 1568 aa29.2■■■□□ 2.26
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CLSTN3-214ENST00000542663 A2MP01023 1474 aa29.09■■■□□ 2.25
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CLSTN3-214ENST00000542663 MBD5Q9P267 1494 aa28.96■■■□□ 2.23
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CLSTN3-214ENST00000542663 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP28.92■■■□□ 2.22
CLSTN3-214ENST00000542663 SOCS7O14512 581 aa28.92■■■□□ 2.22
CLSTN3-214ENST00000542663 PKD2Q13563 968 aa28.9■■■□□ 2.22
CLSTN3-214ENST00000542663 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa28.88■■■□□ 2.21
CLSTN3-214ENST00000542663 PPP6R1Q9UPN7 881 aa28.88■■■□□ 2.21
CLSTN3-214ENST00000542663 A2ML1A8K2U0 1454 aa28.87■■■□□ 2.21
CLSTN3-214ENST00000542663 CEP162Q5TB80 1403 aa28.86■■■□□ 2.21
CLSTN3-214ENST00000542663 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
CLSTN3-214ENST00000542663 NEURL4Q96JN8 1562 aa28.83■■■□□ 2.21
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