RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541434.5

CADM1-211, Transcript of cell adhesion molecule 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CADM1, Length 1,112 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CADM1-211ENST00000541434 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
CADM1-211ENST00000541434 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
CADM1-211ENST00000541434 ITSN2Q9NZM3 1697 aa24.05■■□□□ 1.44
CADM1-211ENST00000541434 ARHGAP5Q13017 1502 aa24.04■■□□□ 1.44
CADM1-211ENST00000541434 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa24.04■■□□□ 1.44
CADM1-211ENST00000541434 KIF13AQ9H1H9 1805 aa24.03■■□□□ 1.44
CADM1-211ENST00000541434 PREX2Q70Z35 1606 aa24.02■■□□□ 1.44
CADM1-211ENST00000541434 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa24.02■■□□□ 1.44
CADM1-211ENST00000541434 ARAP3Q8WWN8 1544 aa24.01■■□□□ 1.43
CADM1-211ENST00000541434 PTPN23Q9H3S7 1636 aa23.99■■□□□ 1.43
CADM1-211ENST00000541434 FANCAO15360 1455 aa23.98■■□□□ 1.43
CADM1-211ENST00000541434 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
CADM1-211ENST00000541434 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP23.97■■□□□ 1.43
CADM1-211ENST00000541434 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP23.95■■□□□ 1.423e-7■■■■□ 26.2
CADM1-211ENST00000541434 TSPOAP1O95153 1857 aa23.94■■□□□ 1.42
CADM1-211ENST00000541434 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa23.94■■□□□ 1.42
CADM1-211ENST00000541434 AKNAQ7Z591 1439 aa23.93■■□□□ 1.42
CADM1-211ENST00000541434 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa23.92■■□□□ 1.42
CADM1-211ENST00000541434 ITGAEP38570 1179 aa23.92■■□□□ 1.42
CADM1-211ENST00000541434 RSPH4AQ5TD94 716 aa23.91■■□□□ 1.42
CADM1-211ENST00000541434 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa23.91■■□□□ 1.42
CADM1-211ENST00000541434 TEX14Q8IWB6 1497 aa23.91■■□□□ 1.42
CADM1-211ENST00000541434 NEO1Q92859 1461 aa23.91■■□□□ 1.42
CADM1-211ENST00000541434 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa23.91■■□□□ 1.42
CADM1-211ENST00000541434 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
CADM1-211ENST00000541434 CFAP74Q9C0B2 1584 aa23.87■■□□□ 1.41
CADM1-211ENST00000541434 SCAPERQ9BY12 1400 aa23.87■■□□□ 1.41
CADM1-211ENST00000541434 PCGF6Q9BYE7 350 aa23.87■■□□□ 1.41
CADM1-211ENST00000541434 ADGRL1O94910 1474 aa23.87■■□□□ 1.41
CADM1-211ENST00000541434 MBD5Q9P267 1494 aa23.86■■□□□ 1.41
CADM1-211ENST00000541434 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa23.85■■□□□ 1.41
CADM1-211ENST00000541434 TSPY4P0CV99 314 aa23.84■■□□□ 1.41
CADM1-211ENST00000541434 TSPY10P0CW01 314 aa23.84■■□□□ 1.41
CADM1-211ENST00000541434 ABCC1P33527 1531 aa23.84■■□□□ 1.41
CADM1-211ENST00000541434 ABCC5O15440 1437 aa23.84■■□□□ 1.41
CADM1-211ENST00000541434 AFAP1Q8N556 730 aa23.83■■□□□ 1.41
CADM1-211ENST00000541434 SYCP2Q9BX26 1530 aa23.83■■□□□ 1.41
CADM1-211ENST00000541434 DAPK1P53355 1430 aa23.81■■□□□ 1.4
CADM1-211ENST00000541434 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa23.81■■□□□ 1.4
CADM1-211ENST00000541434 CHIC2Q9UKJ5 165 aa23.8■■□□□ 1.4
CADM1-211ENST00000541434 ARHGEF5Q12774 1597 aa23.79■■□□□ 1.4
CADM1-211ENST00000541434 PTPRKQ15262 1439 aa23.79■■□□□ 1.4
CADM1-211ENST00000541434 RAPGEF3O95398 923 aa23.79■■□□□ 1.4
CADM1-211ENST00000541434 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP23.78■■□□□ 1.4
CADM1-211ENST00000541434 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP23.78■■□□□ 1.4
CADM1-211ENST00000541434 CCDC141Q6ZP82 1450 aa23.78■■□□□ 1.4
CADM1-211ENST00000541434 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
CADM1-211ENST00000541434 POGZQ7Z3K3 1410 aa23.73■■□□□ 1.39
CADM1-211ENST00000541434 MYT1LQ9UL68 1186 aa23.72■■□□□ 1.39
CADM1-211ENST00000541434 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa23.71■■□□□ 1.39
CADM1-211ENST00000541434 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
CADM1-211ENST00000541434 C9orf84Q5VXU9 1444 aa23.71■■□□□ 1.39
CADM1-211ENST00000541434 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa23.7■■□□□ 1.38
CADM1-211ENST00000541434 SHANK2Q9UPX8 1470 aa23.68■■□□□ 1.38
CADM1-211ENST00000541434 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa23.67■■□□□ 1.38
CADM1-211ENST00000541434 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa23.67■■□□□ 1.38
CADM1-211ENST00000541434 ROCK1Q13464 1354 aa23.66■■□□□ 1.38
CADM1-211ENST00000541434 CROCC2H7BZ55 1655 aa23.66■■□□□ 1.38
CADM1-211ENST00000541434 NCOA1Q15788 1441 aa23.66■■□□□ 1.38
CADM1-211ENST00000541434 MAST1Q9Y2H9 1570 aa23.64■■□□□ 1.37
CADM1-211ENST00000541434 RICTORQ6R327 1708 aa23.64■■□□□ 1.37
CADM1-211ENST00000541434 KDM5CP41229 1560 aa23.63■■□□□ 1.37
CADM1-211ENST00000541434 ADGRL2O95490 1459 aa23.62■■□□□ 1.37
CADM1-211ENST00000541434 MLH3Q9UHC1 1453 aa23.62■■□□□ 1.37
CADM1-211ENST00000541434 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa23.6■■□□□ 1.37
CADM1-211ENST00000541434 ATP7AQ04656 1500 aa23.59■■□□□ 1.37
CADM1-211ENST00000541434 KIF15Q9NS87 1388 aa23.58■■□□□ 1.37
CADM1-211ENST00000541434 KDM6BO15054 1643 aa23.58■■□□□ 1.36
CADM1-211ENST00000541434 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa23.58■■□□□ 1.36
CADM1-211ENST00000541434 HFM1A2PYH4 1435 aa23.58■■□□□ 1.36
CADM1-211ENST00000541434 SETD5Q9C0A6 1442 aa23.58■■□□□ 1.36
CADM1-211ENST00000541434 ADGBQ8N7X0 1667 aa23.57■■□□□ 1.36
CADM1-211ENST00000541434 NAIPQ13075 1403 aa23.57■■□□□ 1.36
CADM1-211ENST00000541434 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
CADM1-211ENST00000541434 MAGI2Q86UL8 1455 aa23.56■■□□□ 1.36
CADM1-211ENST00000541434 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa23.56■■□□□ 1.36
CADM1-211ENST00000541434 HECW2Q9P2P5 1572 aa23.56■■□□□ 1.36
CADM1-211ENST00000541434 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa23.55■■□□□ 1.36
CADM1-211ENST00000541434 PLXNC1O60486 1568 aa23.52■■□□□ 1.36
CADM1-211ENST00000541434 YEATS2Q9ULM3 1422 aa23.52■■□□□ 1.36
CADM1-211ENST00000541434 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa23.5■■□□□ 1.35
CADM1-211ENST00000541434 HRCP23327 699 aa23.5■■□□□ 1.35
CADM1-211ENST00000541434 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
CADM1-211ENST00000541434 DUOX2Q9NRD8 1548 aa23.49■■□□□ 1.35
CADM1-211ENST00000541434 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa23.49■■□□□ 1.35
CADM1-211ENST00000541434 ATP10AO60312 1499 aa23.47■■□□□ 1.35
CADM1-211ENST00000541434 A2MP01023 1474 aa23.46■■□□□ 1.35
CADM1-211ENST00000541434 GCC2Q8IWJ2 1684 aa23.45■■□□□ 1.34
CADM1-211ENST00000541434 ABCA6Q8N139 1617 aa23.45■■□□□ 1.34
CADM1-211ENST00000541434 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa23.44■■□□□ 1.34
CADM1-211ENST00000541434 ERBINQ96RT1 1412 aa23.42■■□□□ 1.34
CADM1-211ENST00000541434 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
CADM1-211ENST00000541434 KIF3BO15066 747 aa23.42■■□□□ 1.34
CADM1-211ENST00000541434 TRIM52Q96A61 297 aa23.41■■□□□ 1.34
CADM1-211ENST00000541434 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa23.38■■□□□ 1.33
CADM1-211ENST00000541434 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP23.37■■□□□ 1.33
CADM1-211ENST00000541434 GGT6Q6P531 493 aa23.34■■□□□ 1.33
CADM1-211ENST00000541434 REREQ9P2R6 1566 aa23.34■■□□□ 1.33
CADM1-211ENST00000541434 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
CADM1-211ENST00000541434 NUP155O75694 1391 aa23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.9 ms