RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540486.5

TRAPPC1-202, Transcript of trafficking protein particle complex 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene TRAPPC1, Length 759 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1-202ENST00000540486 ARID3CA6NKF2 412 aa15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC1-202ENST00000540486 MLECQ14165 292 aa15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC1-202ENST00000540486 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC1-202ENST00000540486 TTC37Q6PGP7 1564 aa15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC1-202ENST00000540486 MAGI2Q86UL8 1455 aa15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC1-202ENST00000540486 STRCQ7RTU9 1775 aa15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC1-202ENST00000540486 PREX1Q8TCU6 1659 aa15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC1-202ENST00000540486 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC1-202ENST00000540486 DCAF8L1A6NGE4 600 aa15.2■□□□□ 0.02
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TRAPPC1-202ENST00000540486 LTBP4Q8N2S1 1624 aa15.19■□□□□ 0.02
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TRAPPC1-202ENST00000540486 EFCAB5A4FU69 1503 aa15.18■□□□□ 0.02
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TRAPPC1-202ENST00000540486 RICTORQ6R327 1708 aa15.17■□□□□ 0.02
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TRAPPC1-202ENST00000540486 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa15.16■□□□□ 0.02
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TRAPPC1-202ENST00000540486 P3H3Q8IVL6 736 aa15.12■□□□□ 0.01
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TRAPPC1-202ENST00000540486 CFAP74Q9C0B2 1584 aa15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC1-202ENST00000540486 C9orf84Q5VXU9 1444 aa15.09■□□□□ 0.01
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TRAPPC1-202ENST00000540486 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa15.03■□□□□ -0
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TRAPPC1-202ENST00000540486 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP15.02□□□□□ -0.01
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TRAPPC1-202ENST00000540486 HSPA1LP34931 641 aa15.01□□□□□ -0.01
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TRAPPC1-202ENST00000540486 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC1-202ENST00000540486 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC1-202ENST00000540486 SLC4A2P04920 1241 aa14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC1-202ENST00000540486 PIP4K2BP78356 416 aa14.93□□□□□ -0.02
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TRAPPC1-202ENST00000540486 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC1-202ENST00000540486 C3P01024 1663 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC1-202ENST00000540486 AFAP1Q8N556 730 aa14.91□□□□□ -0.02
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TRAPPC1-202ENST00000540486 PLA2R1Q13018 1463 aa14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC1-202ENST00000540486 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP14.87□□□□□ -0.039e-8■□□□□ 10.2
TRAPPC1-202ENST00000540486 KDM5CP41229 1560 aa14.85□□□□□ -0.03
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TRAPPC1-202ENST00000540486 MLH3Q9UHC1 1453 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC1-202ENST00000540486 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC1-202ENST00000540486 ZMYM3Q14202 1370 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC1-202ENST00000540486 PTPRKQ15262 1439 aa14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC1-202ENST00000540486 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC1-202ENST00000540486 CPS1P31327 1500 aa14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC1-202ENST00000540486 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
TRAPPC1-202ENST00000540486 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC1-202ENST00000540486 FOXD4L1Q9NU39 408 aa14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC1-202ENST00000540486 MYO5CQ9NQX4 1742 aa14.76□□□□□ -0.05
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TRAPPC1-202ENST00000540486 SHANK2Q9UPX8 1470 aa14.76□□□□□ -0.05
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TRAPPC1-202ENST00000540486 ARHGAP5Q13017 1502 aa14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC1-202ENST00000540486 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC1-202ENST00000540486 RNF39Q9H2S5 420 aa14.74□□□□□ -0.05
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TRAPPC1-202ENST00000540486 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
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TRAPPC1-202ENST00000540486 A2ML1A8K2U0 1454 aa14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC1-202ENST00000540486 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC1-202ENST00000540486 ALKQ9UM73 1620 aa14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC1-202ENST00000540486 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC1-202ENST00000540486 POTEAQ6S8J7 498 aa14.67□□□□□ -0.06
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TRAPPC1-202ENST00000540486 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC1-202ENST00000540486 CLIP1P30622 1438 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC1-202ENST00000540486 KIF14Q15058 1648 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC1-202ENST00000540486 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC1-202ENST00000540486 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC1-202ENST00000540486 ABCC1P33527 1531 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC1-202ENST00000540486 GGT6Q6P531 493 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC1-202ENST00000540486 FMN1Q68DA7 1419 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC1-202ENST00000540486 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC1-202ENST00000540486 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
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