RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529566.1

TSPAN4-218, Transcript of tetraspanin 4, humanhuman

TSL 2

Gene TSPAN4, Length 706 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4-218ENST00000529566 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.54■■□□□ 1.68
TSPAN4-218ENST00000529566 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
TSPAN4-218ENST00000529566 SCAPERQ9BY12 1400 aa25.54■■□□□ 1.68
TSPAN4-218ENST00000529566 PREX2Q70Z35 1606 aa25.53■■□□□ 1.68
TSPAN4-218ENST00000529566 MAP3K1Q13233 1512 aa25.53■■□□□ 1.68
TSPAN4-218ENST00000529566 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa25.52■■□□□ 1.68
TSPAN4-218ENST00000529566 RICTORQ6R327 1708 aa25.52■■□□□ 1.68
TSPAN4-218ENST00000529566 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.48■■□□□ 1.67
TSPAN4-218ENST00000529566 POGZQ7Z3K3 1410 aa25.48■■□□□ 1.67
TSPAN4-218ENST00000529566 CCNB3Q8WWL7 1395 aa25.48■■□□□ 1.67
TSPAN4-218ENST00000529566 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
TSPAN4-218ENST00000529566 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa25.45■■□□□ 1.66
TSPAN4-218ENST00000529566 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa25.44■■□□□ 1.66
TSPAN4-218ENST00000529566 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa25.44■■□□□ 1.66
TSPAN4-218ENST00000529566 NCOA2Q15596 1464 aa25.44■■□□□ 1.66
TSPAN4-218ENST00000529566 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
TSPAN4-218ENST00000529566 ABCC1P33527 1531 aa25.42■■□□□ 1.66
TSPAN4-218ENST00000529566 AFAP1Q8N556 730 aa25.41■■□□□ 1.66
TSPAN4-218ENST00000529566 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
TSPAN4-218ENST00000529566 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
TSPAN4-218ENST00000529566 MAGI2Q86UL8 1455 aa25.4■■□□□ 1.66
TSPAN4-218ENST00000529566 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa25.39■■□□□ 1.66
TSPAN4-218ENST00000529566 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa25.39■■□□□ 1.66
TSPAN4-218ENST00000529566 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa25.39■■□□□ 1.65
TSPAN4-218ENST00000529566 YEATS2Q9ULM3 1422 aa25.37■■□□□ 1.65
TSPAN4-218ENST00000529566 KDM5CP41229 1560 aa25.36■■□□□ 1.65
TSPAN4-218ENST00000529566 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa25.36■■□□□ 1.65
TSPAN4-218ENST00000529566 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa25.36■■□□□ 1.65
TSPAN4-218ENST00000529566 APLP2Q06481 763 aa25.35■■□□□ 1.65
TSPAN4-218ENST00000529566 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
TSPAN4-218ENST00000529566 ITSN2Q9NZM3 1697 aa25.34■■□□□ 1.65
TSPAN4-218ENST00000529566 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa25.33■■□□□ 1.65
TSPAN4-218ENST00000529566 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP25.33■■□□□ 1.65
TSPAN4-218ENST00000529566 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa25.31■■□□□ 1.64
TSPAN4-218ENST00000529566 SYCP2Q9BX26 1530 aa25.31■■□□□ 1.64
TSPAN4-218ENST00000529566 MLH3Q9UHC1 1453 aa25.3■■□□□ 1.64
TSPAN4-218ENST00000529566 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
TSPAN4-218ENST00000529566 MBD5Q9P267 1494 aa25.27■■□□□ 1.64
TSPAN4-218ENST00000529566 ATP10AO60312 1499 aa25.26■■□□□ 1.63
TSPAN4-218ENST00000529566 HECW2Q9P2P5 1572 aa25.25■■□□□ 1.63
TSPAN4-218ENST00000529566 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa25.24■■□□□ 1.63
TSPAN4-218ENST00000529566 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25.22■■□□□ 1.63
TSPAN4-218ENST00000529566 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa25.21■■□□□ 1.63
TSPAN4-218ENST00000529566 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
TSPAN4-218ENST00000529566 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa25.21■■□□□ 1.63
TSPAN4-218ENST00000529566 C9orf84Q5VXU9 1444 aa25.2■■□□□ 1.63
TSPAN4-218ENST00000529566 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
TSPAN4-218ENST00000529566 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa25.2■■□□□ 1.62
TSPAN4-218ENST00000529566 MIA2Q96PC5 1412 aa25.2■■□□□ 1.62
TSPAN4-218ENST00000529566 MYT1LQ9UL68 1186 aa25.18■■□□□ 1.62
TSPAN4-218ENST00000529566 ABCA6Q8N139 1617 aa25.18■■□□□ 1.62
TSPAN4-218ENST00000529566 BCORL1Q5H9F3 1711 aa25.17■■□□□ 1.62
TSPAN4-218ENST00000529566 ADAMTSL3P82987 1691 aa25.17■■□□□ 1.62
TSPAN4-218ENST00000529566 RSPH4AQ5TD94 716 aa25.15■■□□□ 1.62
TSPAN4-218ENST00000529566 REREQ9P2R6 1566 aa25.14■■□□□ 1.62
TSPAN4-218ENST00000529566 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.61
TSPAN4-218ENST00000529566 ATP7AQ04656 1500 aa25.12■■□□□ 1.61
TSPAN4-218ENST00000529566 ARHGEF5Q12774 1597 aa25.11■■□□□ 1.61
TSPAN4-218ENST00000529566 CCDC141Q6ZP82 1450 aa25.11■■□□□ 1.61
TSPAN4-218ENST00000529566 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa25.11■■□□□ 1.61
TSPAN4-218ENST00000529566 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.08■■□□□ 1.61
TSPAN4-218ENST00000529566 AGLP35573 1532 aa25.07■■□□□ 1.6
TSPAN4-218ENST00000529566 MLECQ14165 292 aa25.06■■□□□ 1.6
TSPAN4-218ENST00000529566 MADDQ8WXG6 1647 aa25.05■■□□□ 1.6
TSPAN4-218ENST00000529566 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
TSPAN4-218ENST00000529566 PTPN23Q9H3S7 1636 aa25.04■■□□□ 1.6
TSPAN4-218ENST00000529566 PTPRMP28827 1452 aa25.03■■□□□ 1.6
TSPAN4-218ENST00000529566 TSPY4P0CV99 314 aa25.02■■□□□ 1.6
TSPAN4-218ENST00000529566 TSPY10P0CW01 314 aa25.02■■□□□ 1.6
TSPAN4-218ENST00000529566 A2MP01023 1474 aa25.02■■□□□ 1.6
TSPAN4-218ENST00000529566 PLXNC1O60486 1568 aa25.01■■□□□ 1.59
TSPAN4-218ENST00000529566 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
TSPAN4-218ENST00000529566 ABCC5O15440 1437 aa24.98■■□□□ 1.59
TSPAN4-218ENST00000529566 ADGBQ8N7X0 1667 aa24.97■■□□□ 1.59
TSPAN4-218ENST00000529566 MAST1Q9Y2H9 1570 aa24.97■■□□□ 1.59
TSPAN4-218ENST00000529566 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
TSPAN4-218ENST00000529566 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
TSPAN4-218ENST00000529566 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa24.93■■□□□ 1.58
TSPAN4-218ENST00000529566 DAPK1P53355 1430 aa24.93■■□□□ 1.58
TSPAN4-218ENST00000529566 SHANK2Q9UPX8 1470 aa24.91■■□□□ 1.58
TSPAN4-218ENST00000529566 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
TSPAN4-218ENST00000529566 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
TSPAN4-218ENST00000529566 CROCC2H7BZ55 1655 aa24.88■■□□□ 1.57
TSPAN4-218ENST00000529566 GGT6Q6P531 493 aa24.85■■□□□ 1.57
TSPAN4-218ENST00000529566 KIF3BO15066 747 aa24.84■■□□□ 1.57
TSPAN4-218ENST00000529566 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
TSPAN4-218ENST00000529566 PPP6R1Q9UPN7 881 aa24.83■■□□□ 1.57
TSPAN4-218ENST00000529566 CNTLNQ9NXG0 1405 aa24.82■■□□□ 1.56
TSPAN4-218ENST00000529566 PLPPR3Q6T4P5 718 aa24.81■■□□□ 1.56
TSPAN4-218ENST00000529566 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa24.81■■□□□ 1.56
TSPAN4-218ENST00000529566 CHIC2Q9UKJ5 165 aa24.81■■□□□ 1.56
TSPAN4-218ENST00000529566 KIF15Q9NS87 1388 aa24.8■■□□□ 1.56
TSPAN4-218ENST00000529566 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
TSPAN4-218ENST00000529566 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP24.8■■□□□ 1.56
TSPAN4-218ENST00000529566 PTPRKQ15262 1439 aa24.79■■□□□ 1.56
TSPAN4-218ENST00000529566 NCOA1Q15788 1441 aa24.79■■□□□ 1.56
TSPAN4-218ENST00000529566 DUOX2Q9NRD8 1548 aa24.79■■□□□ 1.56
TSPAN4-218ENST00000529566 ZMYM3Q14202 1370 aa24.77■■□□□ 1.56
TSPAN4-218ENST00000529566 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa24.77■■□□□ 1.56
TSPAN4-218ENST00000529566 ADGRL2O95490 1459 aa24.77■■□□□ 1.56
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