RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525127.1

BRMS1-204, Transcript of BRMS1, transcriptional repressor and anoikis regulator, humanhuman

TSL 2

Gene BRMS1, Length 750 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1-204ENST00000525127 MAGI2Q86UL8 1455 aa23.31■■□□□ 1.32
BRMS1-204ENST00000525127 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa23.31■■□□□ 1.32
BRMS1-204ENST00000525127 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa23.3■■□□□ 1.32
BRMS1-204ENST00000525127 ARHGAP5Q13017 1502 aa23.3■■□□□ 1.32
BRMS1-204ENST00000525127 POGZQ7Z3K3 1410 aa23.3■■□□□ 1.32
BRMS1-204ENST00000525127 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa23.29■■□□□ 1.32
BRMS1-204ENST00000525127 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa23.27■■□□□ 1.32
BRMS1-204ENST00000525127 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa23.23■■□□□ 1.31
BRMS1-204ENST00000525127 YEATS2Q9ULM3 1422 aa23.22■■□□□ 1.31
BRMS1-204ENST00000525127 ADAMTSL3P82987 1691 aa23.21■■□□□ 1.31
BRMS1-204ENST00000525127 BCORL1Q5H9F3 1711 aa23.2■■□□□ 1.3
BRMS1-204ENST00000525127 MAP3K1Q13233 1512 aa23.2■■□□□ 1.3
BRMS1-204ENST00000525127 MYT1LQ9UL68 1186 aa23.2■■□□□ 1.3
BRMS1-204ENST00000525127 PTPRMP28827 1452 aa23.19■■□□□ 1.3
BRMS1-204ENST00000525127 MTUS2Q5JR59 1369 aa23.17■■□□□ 1.3
BRMS1-204ENST00000525127 AFAP1Q8N556 730 aa23.17■■□□□ 1.3
BRMS1-204ENST00000525127 PREX2Q70Z35 1606 aa23.17■■□□□ 1.3
BRMS1-204ENST00000525127 ATP10AO60312 1499 aa23.17■■□□□ 1.3
BRMS1-204ENST00000525127 HECW2Q9P2P5 1572 aa23.15■■□□□ 1.3
BRMS1-204ENST00000525127 C9orf84Q5VXU9 1444 aa23.15■■□□□ 1.3
BRMS1-204ENST00000525127 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa23.14■■□□□ 1.3
BRMS1-204ENST00000525127 MADDQ8WXG6 1647 aa23.13■■□□□ 1.29
BRMS1-204ENST00000525127 TIAM1Q13009 1591 aa23.13■■□□□ 1.29
BRMS1-204ENST00000525127 KDM5CP41229 1560 aa23.12■■□□□ 1.29
BRMS1-204ENST00000525127 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
BRMS1-204ENST00000525127 MLECQ14165 292 aa23.11■■□□□ 1.29
BRMS1-204ENST00000525127 CCNB3Q8WWL7 1395 aa23.11■■□□□ 1.29
BRMS1-204ENST00000525127 ABCC1P33527 1531 aa23.1■■□□□ 1.29
BRMS1-204ENST00000525127 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
BRMS1-204ENST00000525127 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
BRMS1-204ENST00000525127 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa23.08■■□□□ 1.29
BRMS1-204ENST00000525127 MLH3Q9UHC1 1453 aa23.08■■□□□ 1.29
BRMS1-204ENST00000525127 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa23.08■■□□□ 1.28
BRMS1-204ENST00000525127 APLP2Q06481 763 aa23.06■■□□□ 1.28
BRMS1-204ENST00000525127 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa23.06■■□□□ 1.28
BRMS1-204ENST00000525127 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
BRMS1-204ENST00000525127 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa23.04■■□□□ 1.28
BRMS1-204ENST00000525127 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa23.04■■□□□ 1.28
BRMS1-204ENST00000525127 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa23.04■■□□□ 1.28
BRMS1-204ENST00000525127 ITSN2Q9NZM3 1697 aa23.03■■□□□ 1.28
BRMS1-204ENST00000525127 PLPPR3Q6T4P5 718 aa23.02■■□□□ 1.28
BRMS1-204ENST00000525127 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa23.02■■□□□ 1.28
BRMS1-204ENST00000525127 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa23.01■■□□□ 1.27
BRMS1-204ENST00000525127 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa23.01■■□□□ 1.27
BRMS1-204ENST00000525127 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP23■■□□□ 1.27
BRMS1-204ENST00000525127 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa23■■□□□ 1.27
BRMS1-204ENST00000525127 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
BRMS1-204ENST00000525127 SYCP2Q9BX26 1530 aa22.99■■□□□ 1.27
BRMS1-204ENST00000525127 REREQ9P2R6 1566 aa22.99■■□□□ 1.27
BRMS1-204ENST00000525127 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
BRMS1-204ENST00000525127 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa22.96■■□□□ 1.27
BRMS1-204ENST00000525127 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
BRMS1-204ENST00000525127 ABCA6Q8N139 1617 aa22.96■■□□□ 1.27
BRMS1-204ENST00000525127 AGLP35573 1532 aa22.93■■□□□ 1.26
BRMS1-204ENST00000525127 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa22.92■■□□□ 1.26
BRMS1-204ENST00000525127 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
BRMS1-204ENST00000525127 LMTK3Q96Q04 1460 aa22.91■■□□□ 1.26
BRMS1-204ENST00000525127 NCOA2Q15596 1464 aa22.9■■□□□ 1.26
BRMS1-204ENST00000525127 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
BRMS1-204ENST00000525127 ATP7AQ04656 1500 aa22.87■■□□□ 1.25
BRMS1-204ENST00000525127 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
BRMS1-204ENST00000525127 RSPH4AQ5TD94 716 aa22.85■■□□□ 1.25
BRMS1-204ENST00000525127 CNTLNQ9NXG0 1405 aa22.84■■□□□ 1.25
BRMS1-204ENST00000525127 MBD5Q9P267 1494 aa22.83■■□□□ 1.25
BRMS1-204ENST00000525127 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
BRMS1-204ENST00000525127 A2MP01023 1474 aa22.82■■□□□ 1.24
BRMS1-204ENST00000525127 HSPA2P54652 639 aa22.82■■□□□ 1.24
BRMS1-204ENST00000525127 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa22.81■■□□□ 1.24
BRMS1-204ENST00000525127 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa22.79■■□□□ 1.24
BRMS1-204ENST00000525127 CCDC141Q6ZP82 1450 aa22.78■■□□□ 1.24
BRMS1-204ENST00000525127 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.77■■□□□ 1.24
BRMS1-204ENST00000525127 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa22.77■■□□□ 1.24
BRMS1-204ENST00000525127 TSPY4P0CV99 314 aa22.76■■□□□ 1.23
BRMS1-204ENST00000525127 TSPY10P0CW01 314 aa22.76■■□□□ 1.23
BRMS1-204ENST00000525127 MIA2Q96PC5 1412 aa22.75■■□□□ 1.23
BRMS1-204ENST00000525127 PREX1Q8TCU6 1659 aa22.75■■□□□ 1.23
BRMS1-204ENST00000525127 GGT6Q6P531 493 aa22.75■■□□□ 1.23
BRMS1-204ENST00000525127 PLXNC1O60486 1568 aa22.75■■□□□ 1.23
BRMS1-204ENST00000525127 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
BRMS1-204ENST00000525127 PPP6R1Q9UPN7 881 aa22.74■■□□□ 1.23
BRMS1-204ENST00000525127 ADGBQ8N7X0 1667 aa22.74■■□□□ 1.23
BRMS1-204ENST00000525127 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
BRMS1-204ENST00000525127 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
BRMS1-204ENST00000525127 C3P01024 1663 aa22.71■■□□□ 1.23
BRMS1-204ENST00000525127 ZMYM3Q14202 1370 aa22.7■■□□□ 1.22
BRMS1-204ENST00000525127 ARHGEF5Q12774 1597 aa22.69■■□□□ 1.22
BRMS1-204ENST00000525127 MROH2AA6NES4 1674 aa22.68■■□□□ 1.22
BRMS1-204ENST00000525127 NPATQ14207 1427 aa22.67■■□□□ 1.22
BRMS1-204ENST00000525127 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.67■■□□□ 1.22
BRMS1-204ENST00000525127 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
BRMS1-204ENST00000525127 DMRT2Q9Y5R5 561 aa22.67■■□□□ 1.22
BRMS1-204ENST00000525127 KIF3BO15066 747 aa22.65■■□□□ 1.22
BRMS1-204ENST00000525127 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
BRMS1-204ENST00000525127 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
BRMS1-204ENST00000525127 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.6■■□□□ 1.21
BRMS1-204ENST00000525127 FBXO41Q8TF61 875 aa22.59■■□□□ 1.21
BRMS1-204ENST00000525127 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
BRMS1-204ENST00000525127 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP22.58■■□□□ 1.21
BRMS1-204ENST00000525127 FAM135AQ9P2D6 1515 aa22.57■■□□□ 1.2
BRMS1-204ENST00000525127 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa22.57■■□□□ 1.2
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