RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524325.5

TSNARE1-208, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,963 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-208ENST00000524325 PREX2Q70Z35 1606 aa34.75■■■■□ 3.15
TSNARE1-208ENST00000524325 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa34.75■■■■□ 3.15
TSNARE1-208ENST00000524325 MYO5CQ9NQX4 1742 aa34.74■■■■□ 3.15
TSNARE1-208ENST00000524325 MIA2Q96PC5 1412 aa34.74■■■■□ 3.15
TSNARE1-208ENST00000524325 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP34.74■■■■□ 3.15
TSNARE1-208ENST00000524325 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa34.74■■■■□ 3.15
TSNARE1-208ENST00000524325 FANCAO15360 1455 aa34.72■■■■□ 3.15
TSNARE1-208ENST00000524325 ITGAEP38570 1179 aa34.71■■■■□ 3.15
TSNARE1-208ENST00000524325 ITSN2Q9NZM3 1697 aa34.7■■■■□ 3.15
TSNARE1-208ENST00000524325 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP34.69■■■■□ 3.144e-6■■■■□ 20.8
TSNARE1-208ENST00000524325 PTPN23Q9H3S7 1636 aa34.68■■■■□ 3.14
TSNARE1-208ENST00000524325 TSPOAP1O95153 1857 aa34.68■■■■□ 3.14
TSNARE1-208ENST00000524325 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP34.67■■■■□ 3.14
TSNARE1-208ENST00000524325 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa34.67■■■■□ 3.14
TSNARE1-208ENST00000524325 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa34.64■■■■□ 3.14
TSNARE1-208ENST00000524325 ARAP3Q8WWN8 1544 aa34.62■■■■□ 3.13
TSNARE1-208ENST00000524325 AKNAQ7Z591 1439 aa34.62■■■■□ 3.13
TSNARE1-208ENST00000524325 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP34.61■■■■□ 3.13
TSNARE1-208ENST00000524325 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP34.59■■■■□ 3.13
TSNARE1-208ENST00000524325 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa34.59■■■■□ 3.13
TSNARE1-208ENST00000524325 ADGRL1O94910 1474 aa34.55■■■■□ 3.12
TSNARE1-208ENST00000524325 SCAPERQ9BY12 1400 aa34.55■■■■□ 3.12
TSNARE1-208ENST00000524325 SYCP2Q9BX26 1530 aa34.55■■■■□ 3.12
TSNARE1-208ENST00000524325 PCGF6Q9BYE7 350 aa34.54■■■■□ 3.12
TSNARE1-208ENST00000524325 AFAP1Q8N556 730 aa34.53■■■■□ 3.12
TSNARE1-208ENST00000524325 TEX14Q8IWB6 1497 aa34.52■■■■□ 3.12
TSNARE1-208ENST00000524325 NEO1Q92859 1461 aa34.52■■■■□ 3.12
TSNARE1-208ENST00000524325 MBD5Q9P267 1494 aa34.52■■■■□ 3.12
TSNARE1-208ENST00000524325 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa34.51■■■■□ 3.12
TSNARE1-208ENST00000524325 RAPGEF3O95398 923 aa34.51■■■■□ 3.12
TSNARE1-208ENST00000524325 CHIC2Q9UKJ5 165 aa34.51■■■■□ 3.11
TSNARE1-208ENST00000524325 ABCC1P33527 1531 aa34.51■■■■□ 3.11
TSNARE1-208ENST00000524325 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP34.5■■■■□ 3.111e-9■■■□□ 18.2
TSNARE1-208ENST00000524325 PTPRKQ15262 1439 aa34.49■■■■□ 3.11
TSNARE1-208ENST00000524325 ABCC5O15440 1437 aa34.48■■■■□ 3.11
TSNARE1-208ENST00000524325 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa34.48■■■■□ 3.11
TSNARE1-208ENST00000524325 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa34.46■■■■□ 3.11
TSNARE1-208ENST00000524325 DAPK1P53355 1430 aa34.45■■■■□ 3.11
TSNARE1-208ENST00000524325 CFAP74Q9C0B2 1584 aa34.43■■■■□ 3.1
TSNARE1-208ENST00000524325 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP34.43■■■■□ 3.1
TSNARE1-208ENST00000524325 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP34.38■■■■□ 3.09
TSNARE1-208ENST00000524325 CCDC141Q6ZP82 1450 aa34.38■■■■□ 3.09
TSNARE1-208ENST00000524325 TSPY4P0CV99 314 aa34.38■■■■□ 3.09
TSNARE1-208ENST00000524325 TSPY10P0CW01 314 aa34.38■■■■□ 3.09
TSNARE1-208ENST00000524325 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP34.36■■■■□ 3.09
TSNARE1-208ENST00000524325 POGZQ7Z3K3 1410 aa34.36■■■■□ 3.09
TSNARE1-208ENST00000524325 RSPH4AQ5TD94 716 aa34.36■■■■□ 3.09
TSNARE1-208ENST00000524325 MYT1LQ9UL68 1186 aa34.34■■■■□ 3.09
TSNARE1-208ENST00000524325 ARHGEF5Q12774 1597 aa34.34■■■■□ 3.09
TSNARE1-208ENST00000524325 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa34.33■■■■□ 3.09
TSNARE1-208ENST00000524325 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP34.32■■■■□ 3.08
TSNARE1-208ENST00000524325 C9orf84Q5VXU9 1444 aa34.31■■■■□ 3.08
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa34.29■■■■□ 3.08
TSNARE1-208ENST00000524325 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa34.24■■■■□ 3.07
TSNARE1-208ENST00000524325 SHANK2Q9UPX8 1470 aa34.2■■■■□ 3.07
TSNARE1-208ENST00000524325 RICTORQ6R327 1708 aa34.19■■■■□ 3.06
TSNARE1-208ENST00000524325 CROCC2H7BZ55 1655 aa34.19■■■■□ 3.06
TSNARE1-208ENST00000524325 NCOA1Q15788 1441 aa34.19■■■■□ 3.06
TSNARE1-208ENST00000524325 KDM5CP41229 1560 aa34.18■■■■□ 3.06
TSNARE1-208ENST00000524325 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa34.17■■■■□ 3.06
TSNARE1-208ENST00000524325 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa34.15■■■■□ 3.06
TSNARE1-208ENST00000524325 KDM6BO15054 1643 aa34.15■■■■□ 3.06
TSNARE1-208ENST00000524325 YEATS2Q9ULM3 1422 aa34.15■■■■□ 3.06
TSNARE1-208ENST00000524325 ROCK1Q13464 1354 aa34.13■■■■□ 3.05
TSNARE1-208ENST00000524325 ATP7AQ04656 1500 aa34.13■■■■□ 3.05
TSNARE1-208ENST00000524325 KIF15Q9NS87 1388 aa34.13■■■■□ 3.05
TSNARE1-208ENST00000524325 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa34.12■■■■□ 3.05
TSNARE1-208ENST00000524325 ADGRL2O95490 1459 aa34.12■■■■□ 3.05
TSNARE1-208ENST00000524325 MLH3Q9UHC1 1453 aa34.12■■■■□ 3.05
TSNARE1-208ENST00000524325 MAST1Q9Y2H9 1570 aa34.11■■■■□ 3.05
TSNARE1-208ENST00000524325 NAIPQ13075 1403 aa34.1■■■■□ 3.05
TSNARE1-208ENST00000524325 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP34.09■■■■□ 3.05
TSNARE1-208ENST00000524325 HECW2Q9P2P5 1572 aa34.08■■■■□ 3.05
TSNARE1-208ENST00000524325 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa34.07■■■■□ 3.05
TSNARE1-208ENST00000524325 HFM1A2PYH4 1435 aa34.07■■■■□ 3.04
TSNARE1-208ENST00000524325 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa34.05■■■■□ 3.04
TSNARE1-208ENST00000524325 SETD5Q9C0A6 1442 aa34.02■■■■□ 3.04
TSNARE1-208ENST00000524325 ADGBQ8N7X0 1667 aa34.02■■■■□ 3.04
TSNARE1-208ENST00000524325 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa34■■■■□ 3.03
TSNARE1-208ENST00000524325 ABCA6Q8N139 1617 aa33.99■■■■□ 3.03
TSNARE1-208ENST00000524325 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa33.98■■■■□ 3.03
TSNARE1-208ENST00000524325 PLXNC1O60486 1568 aa33.98■■■■□ 3.03
TSNARE1-208ENST00000524325 MAGI2Q86UL8 1455 aa33.98■■■■□ 3.03
TSNARE1-208ENST00000524325 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa33.96■■■■□ 3.03
TSNARE1-208ENST00000524325 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP33.94■■■■□ 3.02
TSNARE1-208ENST00000524325 A2MP01023 1474 aa33.94■■■■□ 3.02
TSNARE1-208ENST00000524325 DUOX2Q9NRD8 1548 aa33.92■■■■□ 3.02
TSNARE1-208ENST00000524325 ATP10AO60312 1499 aa33.91■■■■□ 3.02
TSNARE1-208ENST00000524325 KIF3BO15066 747 aa33.9■■■■□ 3.02
TSNARE1-208ENST00000524325 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa33.87■■■■□ 3.01
TSNARE1-208ENST00000524325 GCC2Q8IWJ2 1684 aa33.87■■■■□ 3.01
TSNARE1-208ENST00000524325 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP33.86■■■■□ 3.01
TSNARE1-208ENST00000524325 TRIM52Q96A61 297 aa33.85■■■■□ 3.01
TSNARE1-208ENST00000524325 ERBINQ96RT1 1412 aa33.84■■■■□ 3.01
TSNARE1-208ENST00000524325 GGT6Q6P531 493 aa33.81■■■■□ 3
TSNARE1-208ENST00000524325 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP33.81■■■■□ 3
TSNARE1-208ENST00000524325 MLECQ14165 292 aa33.8■■■■□ 3
TSNARE1-208ENST00000524325 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa33.77■■■■□ 3
TSNARE1-208ENST00000524325 NUP155O75694 1391 aa33.73■■■□□ 2.99
TSNARE1-208ENST00000524325 HRCP23327 699 aa33.72■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 6.9 ms