RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521452.1

TMEM200B-202, Transcript of transmembrane protein 200B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMEM200B, Length 2,501 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200B-202ENST00000521452 NCOA1Q15788 1441 aa29.72■■■□□ 2.35
TMEM200B-202ENST00000521452 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa29.71■■■□□ 2.35
TMEM200B-202ENST00000521452 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP29.71■■■□□ 2.35
TMEM200B-202ENST00000521452 WDR62O43379 1518 aa29.7■■■□□ 2.35
TMEM200B-202ENST00000521452 MRS2Q9HD23 443 aa29.68■■■□□ 2.34
TMEM200B-202ENST00000521452 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP29.67■■■□□ 2.34
TMEM200B-202ENST00000521452 DAPK1P53355 1430 aa29.67■■■□□ 2.34
TMEM200B-202ENST00000521452 PBRM1Q86U86 1689 aa29.67■■■□□ 2.34
TMEM200B-202ENST00000521452 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP29.66■■■□□ 2.34
TMEM200B-202ENST00000521452 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP29.65■■■□□ 2.34
TMEM200B-202ENST00000521452 MSH5O43196 834 aa29.65■■■□□ 2.34
TMEM200B-202ENST00000521452 ABCC5O15440 1437 aa29.63■■■□□ 2.33
TMEM200B-202ENST00000521452 ADAMTS12P58397 1594 aa29.63■■■□□ 2.33
TMEM200B-202ENST00000521452 ROCK1Q13464 1354 aa29.63■■■□□ 2.33
TMEM200B-202ENST00000521452 KIF7Q2M1P5 1343 aa29.62■■■□□ 2.33
TMEM200B-202ENST00000521452 TEX14Q8IWB6 1497 aa29.61■■■□□ 2.33
TMEM200B-202ENST00000521452 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa29.57■■■□□ 2.32
TMEM200B-202ENST00000521452 PPP4R2Q9NY27 417 aa29.57■■■□□ 2.32
TMEM200B-202ENST00000521452 ERICH6BQ5W0A0 696 aa29.55■■■□□ 2.32
TMEM200B-202ENST00000521452 ZBED9Q6R2W3 1325 aa29.55■■■□□ 2.32
TMEM200B-202ENST00000521452 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP29.53■■■□□ 2.32
TMEM200B-202ENST00000521452 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP29.51■■■□□ 2.31
TMEM200B-202ENST00000521452 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP29.5■■■□□ 2.31
TMEM200B-202ENST00000521452 FANCIQ9NVI1 1328 aa29.5■■■□□ 2.31
TMEM200B-202ENST00000521452 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa29.49■■■□□ 2.31
TMEM200B-202ENST00000521452 DISP1Q96F81 1524 aa29.48■■■□□ 2.31
TMEM200B-202ENST00000521452 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP29.47■■■□□ 2.31
TMEM200B-202ENST00000521452 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP29.44■■■□□ 2.3
TMEM200B-202ENST00000521452 KIAA0556O60303 1618 aa29.44■■■□□ 2.3
TMEM200B-202ENST00000521452 POLR3GLQ9BT43 218 aa29.43■■■□□ 2.3
TMEM200B-202ENST00000521452 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa29.43■■■□□ 2.3
TMEM200B-202ENST00000521452 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP29.43■■■□□ 2.3
TMEM200B-202ENST00000521452 PZPP20742 1482 aa29.43■■■□□ 2.3
TMEM200B-202ENST00000521452 MRC2Q9UBG0 1479 aa29.42■■■□□ 2.3
TMEM200B-202ENST00000521452 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP29.42■■■□□ 2.3
TMEM200B-202ENST00000521452 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP29.41■■■□□ 2.3
TMEM200B-202ENST00000521452 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa29.37■■■□□ 2.29
TMEM200B-202ENST00000521452 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa29.36■■■□□ 2.29
TMEM200B-202ENST00000521452 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP29.36■■■□□ 2.29
TMEM200B-202ENST00000521452 USP47Q96K76 1375 aa29.35■■■□□ 2.29
TMEM200B-202ENST00000521452 PKD2Q13563 968 aa29.35■■■□□ 2.29
TMEM200B-202ENST00000521452 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP29.33■■■□□ 2.29
TMEM200B-202ENST00000521452 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP29.33■■■□□ 2.29
TMEM200B-202ENST00000521452 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa29.31■■■□□ 2.28
TMEM200B-202ENST00000521452 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa29.31■■■□□ 2.28
TMEM200B-202ENST00000521452 ERICH6Q7L0X2 663 aa29.31■■■□□ 2.28
TMEM200B-202ENST00000521452 IFT140Q96RY7 1462 aa29.31■■■□□ 2.28
TMEM200B-202ENST00000521452 MBD5Q9P267 1494 aa29.31■■■□□ 2.28
TMEM200B-202ENST00000521452 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP29.29■■■□□ 2.28
TMEM200B-202ENST00000521452 BCL11AQ9H165 835 aa29.29■■■□□ 2.28
TMEM200B-202ENST00000521452 GRIN2AQ12879 1464 aa29.27■■■□□ 2.28
TMEM200B-202ENST00000521452 PLB1Q6P1J6 1458 aa29.27■■■□□ 2.28
TMEM200B-202ENST00000521452 BCORL1Q5H9F3 1711 aa29.27■■■□□ 2.28
TMEM200B-202ENST00000521452 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP29.24■■■□□ 2.27
TMEM200B-202ENST00000521452 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa29.22■■■□□ 2.27
TMEM200B-202ENST00000521452 NUDCQ9Y266 331 aa29.21■■■□□ 2.27
TMEM200B-202ENST00000521452 KIF14Q15058 1648 aa29.21■■■□□ 2.27
TMEM200B-202ENST00000521452 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa29.2■■■□□ 2.26
TMEM200B-202ENST00000521452 ADGRL2O95490 1459 aa29.2■■■□□ 2.26
TMEM200B-202ENST00000521452 ADGBQ8N7X0 1667 aa29.17■■■□□ 2.26
TMEM200B-202ENST00000521452 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.17■■■□□ 2.26
TMEM200B-202ENST00000521452 ITSN2Q9NZM3 1697 aa29.16■■■□□ 2.26
TMEM200B-202ENST00000521452 KDM5CP41229 1560 aa29.16■■■□□ 2.26
TMEM200B-202ENST00000521452 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP29.16■■■□□ 2.26
TMEM200B-202ENST00000521452 CARD11Q9BXL7 1154 aa29.16■■■□□ 2.26
TMEM200B-202ENST00000521452 NUP155O75694 1391 aa29.16■■■□□ 2.26
TMEM200B-202ENST00000521452 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP29.15■■■□□ 2.26
TMEM200B-202ENST00000521452 FBLN2P98095 1184 aa29.15■■■□□ 2.26
TMEM200B-202ENST00000521452 TMC1Q8TDI8 760 aa29.15■■■□□ 2.26
TMEM200B-202ENST00000521452 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa29.14■■■□□ 2.25
TMEM200B-202ENST00000521452 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP29.12■■■□□ 2.25
TMEM200B-202ENST00000521452 RNF123Q5XPI4 1314 aa29.11■■■□□ 2.25
TMEM200B-202ENST00000521452 CROCC2H7BZ55 1655 aa29.1■■■□□ 2.25
TMEM200B-202ENST00000521452 CCDC136Q96JN2 1154 aa29.1■■■□□ 2.25
TMEM200B-202ENST00000521452 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa29.09■■■□□ 2.25
TMEM200B-202ENST00000521452 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa29.09■■■□□ 2.25
TMEM200B-202ENST00000521452 RALGAPBQ86X10 1494 aa29.07■■■□□ 2.24
TMEM200B-202ENST00000521452 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
TMEM200B-202ENST00000521452 PLEKHD1A6NEE1 506 aa29.07■■■□□ 2.24
TMEM200B-202ENST00000521452 JPH4Q96JJ6 628 aa29.07■■■□□ 2.24
TMEM200B-202ENST00000521452 CEP170Q5SW79 1584 aa29.06■■■□□ 2.24
TMEM200B-202ENST00000521452 ADCY10Q96PN6 1610 aa29.06■■■□□ 2.24
TMEM200B-202ENST00000521452 DCAF11Q8TEB1 546 aa29.05■■■□□ 2.24
TMEM200B-202ENST00000521452 C9orf84Q5VXU9 1444 aa29.05■■■□□ 2.24
TMEM200B-202ENST00000521452 KIF15Q9NS87 1388 aa29.03■■■□□ 2.24
TMEM200B-202ENST00000521452 TSPY4P0CV99 314 aa29.01■■■□□ 2.24
TMEM200B-202ENST00000521452 TSPY10P0CW01 314 aa29.01■■■□□ 2.24
TMEM200B-202ENST00000521452 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa29.01■■■□□ 2.24
TMEM200B-202ENST00000521452 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP28.99■■■□□ 2.23
TMEM200B-202ENST00000521452 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP28.98■■■□□ 2.23
TMEM200B-202ENST00000521452 SYNJ2O15056 1496 aa28.98■■■□□ 2.23
TMEM200B-202ENST00000521452 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa28.96■■■□□ 2.23
TMEM200B-202ENST00000521452 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.23
TMEM200B-202ENST00000521452 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.23
TMEM200B-202ENST00000521452 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.23
TMEM200B-202ENST00000521452 ABCC10Q5T3U5 1492 aa28.95■■■□□ 2.22
TMEM200B-202ENST00000521452 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa28.94■■■□□ 2.22
TMEM200B-202ENST00000521452 SHANK2Q9UPX8 1470 aa28.94■■■□□ 2.22
TMEM200B-202ENST00000521452 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
TMEM200B-202ENST00000521452 ATP10BO94823 1461 aa28.93■■■□□ 2.22
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