RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519815.5

TRPS1-210, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 3

Gene TRPS1, Length 584 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-210ENST00000519815 ADCY10Q96PN6 1610 aa15.8■□□□□ 0.12
TRPS1-210ENST00000519815 CYB5RLQ6IPT4 315 aa15.79■□□□□ 0.12
TRPS1-210ENST00000519815 FGD6Q6ZV73 1430 aa15.78■□□□□ 0.12
TRPS1-210ENST00000519815 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
TRPS1-210ENST00000519815 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa15.78■□□□□ 0.12
TRPS1-210ENST00000519815 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa15.78■□□□□ 0.12
TRPS1-210ENST00000519815 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa15.78■□□□□ 0.12
TRPS1-210ENST00000519815 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP15.77■□□□□ 0.12
TRPS1-210ENST00000519815 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.12
TRPS1-210ENST00000519815 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
TRPS1-210ENST00000519815 MIA2Q96PC5 1412 aa15.76■□□□□ 0.11
TRPS1-210ENST00000519815 KCNH8Q96L42 1107 aa15.75■□□□□ 0.11
TRPS1-210ENST00000519815 KIF14Q15058 1648 aa15.74■□□□□ 0.11
TRPS1-210ENST00000519815 ABCC10Q5T3U5 1492 aa15.72■□□□□ 0.11
TRPS1-210ENST00000519815 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP15.72■□□□□ 0.11
TRPS1-210ENST00000519815 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP15.72■□□□□ 0.11
TRPS1-210ENST00000519815 ITGAEP38570 1179 aa15.71■□□□□ 0.11
TRPS1-210ENST00000519815 WDR7Q9Y4E6 1490 aa15.71■□□□□ 0.1
TRPS1-210ENST00000519815 ASXL2Q76L83 1435 aa15.7■□□□□ 0.1
TRPS1-210ENST00000519815 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP15.69■□□□□ 0.1
TRPS1-210ENST00000519815 PTPN23Q9H3S7 1636 aa15.68■□□□□ 0.1
TRPS1-210ENST00000519815 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP15.66■□□□□ 0.1
TRPS1-210ENST00000519815 ITSN2Q9NZM3 1697 aa15.65■□□□□ 0.1
TRPS1-210ENST00000519815 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP15.65■□□□□ 0.1
TRPS1-210ENST00000519815 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP15.65■□□□□ 0.1
TRPS1-210ENST00000519815 PLCH2O75038 1416 aa15.62■□□□□ 0.09
TRPS1-210ENST00000519815 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa15.61■□□□□ 0.09
TRPS1-210ENST00000519815 TTC37Q6PGP7 1564 aa15.61■□□□□ 0.09
TRPS1-210ENST00000519815 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa15.6■□□□□ 0.09
TRPS1-210ENST00000519815 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa15.6■□□□□ 0.09
TRPS1-210ENST00000519815 MAPKBP1O60336 1514 aa15.59■□□□□ 0.09
TRPS1-210ENST00000519815 ARHGAP5Q13017 1502 aa15.58■□□□□ 0.09
TRPS1-210ENST00000519815 RSPH4AQ5TD94 716 aa15.58■□□□□ 0.08
TRPS1-210ENST00000519815 PTPRKQ15262 1439 aa15.58■□□□□ 0.08
TRPS1-210ENST00000519815 PREX2Q70Z35 1606 aa15.57■□□□□ 0.08
TRPS1-210ENST00000519815 ABCA9Q8IUA7 1624 aa15.57■□□□□ 0.08
TRPS1-210ENST00000519815 ABCC5O15440 1437 aa15.56■□□□□ 0.08
TRPS1-210ENST00000519815 DAPK1P53355 1430 aa15.56■□□□□ 0.08
TRPS1-210ENST00000519815 MYO5CQ9NQX4 1742 aa15.55■□□□□ 0.08
TRPS1-210ENST00000519815 ARAP3Q8WWN8 1544 aa15.55■□□□□ 0.08
TRPS1-210ENST00000519815 SETD5Q9C0A6 1442 aa15.55■□□□□ 0.08
TRPS1-210ENST00000519815 CHIC2Q9UKJ5 165 aa15.55■□□□□ 0.08
TRPS1-210ENST00000519815 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa15.54■□□□□ 0.08
TRPS1-210ENST00000519815 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa15.54■□□□□ 0.08
TRPS1-210ENST00000519815 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP15.54■□□□□ 0.08
TRPS1-210ENST00000519815 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa15.54■□□□□ 0.08
TRPS1-210ENST00000519815 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa15.53■□□□□ 0.08
TRPS1-210ENST00000519815 HRCP23327 699 aa15.53■□□□□ 0.08
TRPS1-210ENST00000519815 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
TRPS1-210ENST00000519815 CD109Q6YHK3 1445 aa15.52■□□□□ 0.08
TRPS1-210ENST00000519815 TSPY4P0CV99 314 aa15.52■□□□□ 0.08
TRPS1-210ENST00000519815 TSPY10P0CW01 314 aa15.52■□□□□ 0.08
TRPS1-210ENST00000519815 HFM1A2PYH4 1435 aa15.51■□□□□ 0.07
TRPS1-210ENST00000519815 ROCK1Q13464 1354 aa15.51■□□□□ 0.07
TRPS1-210ENST00000519815 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa15.51■□□□□ 0.07
TRPS1-210ENST00000519815 MBD5Q9P267 1494 aa15.51■□□□□ 0.07
TRPS1-210ENST00000519815 AKNAQ7Z591 1439 aa15.51■□□□□ 0.07
TRPS1-210ENST00000519815 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa15.5■□□□□ 0.07
TRPS1-210ENST00000519815 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
TRPS1-210ENST00000519815 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa15.5■□□□□ 0.07
TRPS1-210ENST00000519815 FANCAO15360 1455 aa15.5■□□□□ 0.07
TRPS1-210ENST00000519815 FAM69CQ0P6D2 419 aa15.49■□□□□ 0.07
TRPS1-210ENST00000519815 ARHGEF5Q12774 1597 aa15.49■□□□□ 0.07
TRPS1-210ENST00000519815 NAIPQ13075 1403 aa15.48■□□□□ 0.07
TRPS1-210ENST00000519815 GLI2P10070 1586 aa15.48■□□□□ 0.07
TRPS1-210ENST00000519815 CCDC141Q6ZP82 1450 aa15.47■□□□□ 0.07
TRPS1-210ENST00000519815 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa15.47■□□□□ 0.07
TRPS1-210ENST00000519815 SHANK2Q9UPX8 1470 aa15.46■□□□□ 0.07
TRPS1-210ENST00000519815 SYCP2Q9BX26 1530 aa15.46■□□□□ 0.07
TRPS1-210ENST00000519815 NCOA1Q15788 1441 aa15.45■□□□□ 0.06
TRPS1-210ENST00000519815 C9orf84Q5VXU9 1444 aa15.45■□□□□ 0.06
TRPS1-210ENST00000519815 ADGRL2O95490 1459 aa15.45■□□□□ 0.06
TRPS1-210ENST00000519815 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
TRPS1-210ENST00000519815 ABCC1P33527 1531 aa15.44■□□□□ 0.06
TRPS1-210ENST00000519815 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa15.44■□□□□ 0.06
TRPS1-210ENST00000519815 SCAPERQ9BY12 1400 aa15.43■□□□□ 0.06
TRPS1-210ENST00000519815 DIP2BQ9P265 1576 aa15.42■□□□□ 0.06
TRPS1-210ENST00000519815 ADGRL1O94910 1474 aa15.42■□□□□ 0.06
TRPS1-210ENST00000519815 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP15.42■□□□□ 0.06
TRPS1-210ENST00000519815 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa15.42■□□□□ 0.06
TRPS1-210ENST00000519815 CROCC2H7BZ55 1655 aa15.41■□□□□ 0.06
TRPS1-210ENST00000519815 NEO1Q92859 1461 aa15.41■□□□□ 0.06
TRPS1-210ENST00000519815 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP15.41■□□□□ 0.06
TRPS1-210ENST00000519815 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP15.41■□□□□ 0.06
TRPS1-210ENST00000519815 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa15.4■□□□□ 0.06
TRPS1-210ENST00000519815 AFAP1Q8N556 730 aa15.4■□□□□ 0.06
TRPS1-210ENST00000519815 CFAP74Q9C0B2 1584 aa15.4■□□□□ 0.06
TRPS1-210ENST00000519815 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
TRPS1-210ENST00000519815 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
TRPS1-210ENST00000519815 MAST1Q9Y2H9 1570 aa15.38■□□□□ 0.05
TRPS1-210ENST00000519815 ADGBQ8N7X0 1667 aa15.38■□□□□ 0.05
TRPS1-210ENST00000519815 KIF15Q9NS87 1388 aa15.37■□□□□ 0.05
TRPS1-210ENST00000519815 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa15.37■□□□□ 0.05
TRPS1-210ENST00000519815 CAPN15O75808 1086 aa15.37■□□□□ 0.05
TRPS1-210ENST00000519815 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
TRPS1-210ENST00000519815 GCC2Q8IWJ2 1684 aa15.37■□□□□ 0.05
TRPS1-210ENST00000519815 CLSPNQ9HAW4 1339 aa15.36■□□□□ 0.05
TRPS1-210ENST00000519815 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa15.35■□□□□ 0.05
TRPS1-210ENST00000519815 TRIM52Q96A61 297 aa15.35■□□□□ 0.05
TRPS1-210ENST00000519815 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa15.34■□□□□ 0.05
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