RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519651.5

TSNARE1-204, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TSNARE1, Length 2,110 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-204ENST00000519651 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa25.43■■□□□ 1.66
TSNARE1-204ENST00000519651 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
TSNARE1-204ENST00000519651 ABCC10Q5T3U5 1492 aa25.42■■□□□ 1.66
TSNARE1-204ENST00000519651 ROCK1Q13464 1354 aa25.41■■□□□ 1.66
TSNARE1-204ENST00000519651 TRIM52Q96A61 297 aa25.41■■□□□ 1.66
TSNARE1-204ENST00000519651 GCC2Q8IWJ2 1684 aa25.4■■□□□ 1.66
TSNARE1-204ENST00000519651 ABCC2Q92887 1545 aa25.39■■□□□ 1.65
TSNARE1-204ENST00000519651 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa25.37■■□□□ 1.65
TSNARE1-204ENST00000519651 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa25.34■■□□□ 1.65
TSNARE1-204ENST00000519651 KDM6BO15054 1643 aa25.34■■□□□ 1.65
TSNARE1-204ENST00000519651 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
TSNARE1-204ENST00000519651 MPHOSPH9Q99550 1183 aa25.28■■□□□ 1.64
TSNARE1-204ENST00000519651 NCOA1Q15788 1441 aa25.28■■□□□ 1.64
TSNARE1-204ENST00000519651 KCNH8Q96L42 1107 aa25.28■■□□□ 1.64
TSNARE1-204ENST00000519651 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa25.27■■□□□ 1.64
TSNARE1-204ENST00000519651 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP25.25■■□□□ 1.634e-6■■■■□ 20.8
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TSNARE1-204ENST00000519651 TSPY4P0CV99 314 aa25.24■■□□□ 1.63
TSNARE1-204ENST00000519651 TSPY10P0CW01 314 aa25.24■■□□□ 1.63
TSNARE1-204ENST00000519651 TONSLQ96HA7 1378 aa25.24■■□□□ 1.63
TSNARE1-204ENST00000519651 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa25.24■■□□□ 1.63
TSNARE1-204ENST00000519651 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
TSNARE1-204ENST00000519651 ADGRL2O95490 1459 aa25.22■■□□□ 1.63
TSNARE1-204ENST00000519651 KDM5BQ9UGL1 1544 aa25.21■■□□□ 1.63
TSNARE1-204ENST00000519651 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
TSNARE1-204ENST00000519651 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP25.2■■□□□ 1.63
TSNARE1-204ENST00000519651 CROCC2H7BZ55 1655 aa25.19■■□□□ 1.62
TSNARE1-204ENST00000519651 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
TSNARE1-204ENST00000519651 ADGBQ8N7X0 1667 aa25.19■■□□□ 1.62
TSNARE1-204ENST00000519651 PREX2Q70Z35 1606 aa25.18■■□□□ 1.62
TSNARE1-204ENST00000519651 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa25.18■■□□□ 1.62
TSNARE1-204ENST00000519651 C9orf84Q5VXU9 1444 aa25.17■■□□□ 1.62
TSNARE1-204ENST00000519651 TTC37Q6PGP7 1564 aa25.17■■□□□ 1.62
TSNARE1-204ENST00000519651 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
TSNARE1-204ENST00000519651 FOXD1Q16676 465 aa25.16■■□□□ 1.62
TSNARE1-204ENST00000519651 RSPH4AQ5TD94 716 aa25.16■■□□□ 1.62
TSNARE1-204ENST00000519651 MBD5Q9P267 1494 aa25.15■■□□□ 1.62
TSNARE1-204ENST00000519651 SHANK2Q9UPX8 1470 aa25.15■■□□□ 1.62
TSNARE1-204ENST00000519651 ARHGAP5Q13017 1502 aa25.15■■□□□ 1.62
TSNARE1-204ENST00000519651 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa25.14■■□□□ 1.62
TSNARE1-204ENST00000519651 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa25.12■■□□□ 1.61
TSNARE1-204ENST00000519651 ARHGEF5Q12774 1597 aa25.12■■□□□ 1.61
TSNARE1-204ENST00000519651 CCDC141Q6ZP82 1450 aa25.1■■□□□ 1.61
TSNARE1-204ENST00000519651 MYO5CQ9NQX4 1742 aa25.07■■□□□ 1.6
TSNARE1-204ENST00000519651 MIER1Q8N108 512 aa25.07■■□□□ 1.6
TSNARE1-204ENST00000519651 PLCH2O75038 1416 aa25.07■■□□□ 1.6
TSNARE1-204ENST00000519651 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa25.05■■□□□ 1.6
TSNARE1-204ENST00000519651 KIF15Q9NS87 1388 aa25.05■■□□□ 1.6
TSNARE1-204ENST00000519651 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa25.05■■□□□ 1.6
TSNARE1-204ENST00000519651 SYCP2Q9BX26 1530 aa25.05■■□□□ 1.6
TSNARE1-204ENST00000519651 PZPP20742 1482 aa25.03■■□□□ 1.6
TSNARE1-204ENST00000519651 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa25.03■■□□□ 1.6
TSNARE1-204ENST00000519651 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa25.02■■□□□ 1.6
TSNARE1-204ENST00000519651 WDR7Q9Y4E6 1490 aa24.99■■□□□ 1.59
TSNARE1-204ENST00000519651 NUP155O75694 1391 aa24.99■■□□□ 1.59
TSNARE1-204ENST00000519651 PKD2Q13563 968 aa24.98■■□□□ 1.59
TSNARE1-204ENST00000519651 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP24.97■■□□□ 1.59
TSNARE1-204ENST00000519651 L3MBTL2Q969R5 705 aa24.96■■□□□ 1.59
TSNARE1-204ENST00000519651 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
TSNARE1-204ENST00000519651 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
TSNARE1-204ENST00000519651 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa24.95■■□□□ 1.58
TSNARE1-204ENST00000519651 MAST1Q9Y2H9 1570 aa24.92■■□□□ 1.58
TSNARE1-204ENST00000519651 ASXL2Q76L83 1435 aa24.91■■□□□ 1.58
TSNARE1-204ENST00000519651 ABCC1P33527 1531 aa24.87■■□□□ 1.57
TSNARE1-204ENST00000519651 ARAP3Q8WWN8 1544 aa24.87■■□□□ 1.57
TSNARE1-204ENST00000519651 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa24.86■■□□□ 1.57
TSNARE1-204ENST00000519651 KDM5DQ9BY66 1539 aa24.85■■□□□ 1.57
TSNARE1-204ENST00000519651 AFAP1Q8N556 730 aa24.83■■□□□ 1.57
TSNARE1-204ENST00000519651 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
TSNARE1-204ENST00000519651 ABCA9Q8IUA7 1624 aa24.82■■□□□ 1.56
TSNARE1-204ENST00000519651 FANCAO15360 1455 aa24.82■■□□□ 1.56
TSNARE1-204ENST00000519651 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP24.82■■□□□ 1.56
TSNARE1-204ENST00000519651 PLXNC1O60486 1568 aa24.82■■□□□ 1.56
TSNARE1-204ENST00000519651 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
TSNARE1-204ENST00000519651 TEX14Q8IWB6 1497 aa24.81■■□□□ 1.56
TSNARE1-204ENST00000519651 DUOX2Q9NRD8 1548 aa24.79■■□□□ 1.56
TSNARE1-204ENST00000519651 NBPF8Q3BBV2 869 aa24.77■■□□□ 1.56
TSNARE1-204ENST00000519651 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
TSNARE1-204ENST00000519651 FAM135AQ9P2D6 1515 aa24.77■■□□□ 1.56
TSNARE1-204ENST00000519651 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
TSNARE1-204ENST00000519651 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP24.74■■□□□ 1.552e-6■■■■■ 26.9
TSNARE1-204ENST00000519651 ERBINQ96RT1 1412 aa24.74■■□□□ 1.55
TSNARE1-204ENST00000519651 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa24.74■■□□□ 1.55
TSNARE1-204ENST00000519651 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
TSNARE1-204ENST00000519651 SCAPERQ9BY12 1400 aa24.73■■□□□ 1.55
TSNARE1-204ENST00000519651 MYT1LQ9UL68 1186 aa24.72■■□□□ 1.55
TSNARE1-204ENST00000519651 ADGRL1O94910 1474 aa24.72■■□□□ 1.55
TSNARE1-204ENST00000519651 UNC13BO14795 1591 aa24.71■■□□□ 1.55
TSNARE1-204ENST00000519651 CYB5RLQ6IPT4 315 aa24.68■■□□□ 1.54
TSNARE1-204ENST00000519651 CD109Q6YHK3 1445 aa24.67■■□□□ 1.54
TSNARE1-204ENST00000519651 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa24.67■■□□□ 1.54
TSNARE1-204ENST00000519651 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
TSNARE1-204ENST00000519651 IQGAP3Q86VI3 1631 aa24.63■■□□□ 1.53
TSNARE1-204ENST00000519651 ATP7AQ04656 1500 aa24.62■■□□□ 1.53
TSNARE1-204ENST00000519651 MAGI2Q86UL8 1455 aa24.61■■□□□ 1.53
TSNARE1-204ENST00000519651 CCDC144AA2RUR9 1427 aa24.61■■□□□ 1.53
TSNARE1-204ENST00000519651 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa24.59■■□□□ 1.53
TSNARE1-204ENST00000519651 DCAF11Q8TEB1 546 aa24.58■■□□□ 1.53
TSNARE1-204ENST00000519651 WASHC2AQ641Q2 1341 aa24.57■■□□□ 1.52
TSNARE1-204ENST00000519651 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
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