RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517728.1

IGHVII-44-2-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable (II)-44-2 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene IGHVII-44-2, Length 250 nt, Biotype IG V pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 FHOD3Q2V2M9 1422 aa8.43□□□□□ -1.06
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 TEX14Q8IWB6 1497 aa8.43□□□□□ -1.06
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa8.43□□□□□ -1.06
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 CLEC11AQ9Y240 323 aa8.42□□□□□ -1.06
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 KDM6BO15054 1643 aa8.42□□□□□ -1.06
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa8.4□□□□□ -1.06
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 ATP10BO94823 1461 aa8.4□□□□□ -1.06
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 FMN1Q68DA7 1419 aa8.4□□□□□ -1.06
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 STAG3Q9UJ98 1225 aa8.39□□□□□ -1.07
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 TSPOAP1O95153 1857 aa8.38□□□□□ -1.07
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 CFAP43Q8NDM7 1665 aa8.38□□□□□ -1.07
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 ARID3CA6NKF2 412 aa8.38□□□□□ -1.07
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 KCNH8Q96L42 1107 aa8.38□□□□□ -1.07
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa8.38□□□□□ -1.07
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa8.38□□□□□ -1.07
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 CD109Q6YHK3 1445 aa8.37□□□□□ -1.07
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 PLEKHD1A6NEE1 506 aa8.36□□□□□ -1.07
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 HECW1Q76N89 1606 aa8.36□□□□□ -1.07
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 ABCA9Q8IUA7 1624 aa8.35□□□□□ -1.07
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 VASPP50552 380 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 PHLDB1Q86UU1 1377 aa8.34□□□□□ -1.07
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 PITPNM1O00562 1244 aa8.33□□□□□ -1.08
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 CLIP1P30622 1438 aa8.32□□□□□ -1.08
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 PRR29P0C7W0 189 aa8.32□□□□□ -1.08
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 PLCD3Q8N3E9 789 aa8.32□□□□□ -1.08
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 MIER1Q8N108 512 aa8.31□□□□□ -1.08
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 CCDC18Q5T9S5 1454 aa8.31□□□□□ -1.08
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 NEO1Q92859 1461 aa8.31□□□□□ -1.08
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa8.3□□□□□ -1.08
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 ARAP3Q8WWN8 1544 aa8.3□□□□□ -1.08
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 FYCO1Q9BQS8 1478 aa8.29□□□□□ -1.08
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 CFAP74Q9C0B2 1584 aa8.29□□□□□ -1.08
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP8.28□□□□□ -1.08
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 KIF14Q15058 1648 aa8.27□□□□□ -1.09
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 TTC37Q6PGP7 1564 aa8.27□□□□□ -1.09
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 FANCAO15360 1455 aa8.26□□□□□ -1.09
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 KLHL34Q8N239 644 aa8.26□□□□□ -1.09
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 CEP162Q5TB80 1403 aa8.26□□□□□ -1.09
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 PLEKHG5O94827 1062 aa8.25□□□□□ -1.09
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 PLCH2O75038 1416 aa8.25□□□□□ -1.09
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 AKNAQ7Z591 1439 aa8.25□□□□□ -1.09
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa8.23□□□□□ -1.09
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 ADGRL1O94910 1474 aa8.23□□□□□ -1.09
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 MYO5CQ9NQX4 1742 aa8.23□□□□□ -1.09
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 RAPGEF3O95398 923 aa8.22□□□□□ -1.09
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 CHRDL2Q6WN34 429 aa8.22□□□□□ -1.09
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa8.22□□□□□ -1.09
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 ARHGAP5Q13017 1502 aa8.21□□□□□ -1.1
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa8.21□□□□□ -1.1
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa8.21□□□□□ -1.1
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 SCAPERQ9BY12 1400 aa8.2□□□□□ -1.1
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 MAGI2Q86UL8 1455 aa8.2□□□□□ -1.1
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa8.2□□□□□ -1.1
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 MTUS2Q5JR59 1369 aa8.2□□□□□ -1.1
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 POGZQ7Z3K3 1410 aa8.2□□□□□ -1.1
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa8.19□□□□□ -1.1
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 PREX2Q70Z35 1606 aa8.19□□□□□ -1.1
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 CHADLQ6NUI6 762 aa8.19□□□□□ -1.1
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 RICTORQ6R327 1708 aa8.19□□□□□ -1.1
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa8.19□□□□□ -1.1
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa8.19□□□□□ -1.1
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 CREBZFQ9NS37 354 aa8.18□□□□□ -1.1
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 VPS8Q8N3P4 1428 aa8.18□□□□□ -1.1
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa8.18□□□□□ -1.1
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa8.17□□□□□ -1.1
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 ABCC1P33527 1531 aa8.16□□□□□ -1.1
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 CCNB3Q8WWL7 1395 aa8.16□□□□□ -1.1
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa8.15□□□□□ -1.1
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa8.15□□□□□ -1.11
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 KDM5CP41229 1560 aa8.14□□□□□ -1.11
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa8.14□□□□□ -1.11
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 TIAM1Q13009 1591 aa8.14□□□□□ -1.11
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 HECW2Q9P2P5 1572 aa8.14□□□□□ -1.11
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 ATP10AO60312 1499 aa8.13□□□□□ -1.11
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 MLH3Q9UHC1 1453 aa8.13□□□□□ -1.11
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 C9orf84Q5VXU9 1444 aa8.13□□□□□ -1.11
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 YEATS2Q9ULM3 1422 aa8.13□□□□□ -1.11
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 PIP4P2Q8N4L2 257 aa8.13□□□□□ -1.11
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 SPOCK2Q92563 424 aa8.13□□□□□ -1.11
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 MYT1LQ9UL68 1186 aa8.13□□□□□ -1.11
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms