RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513815.1

LINC00491-204, long intergenic non-protein coding RNA 491, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene LINC00491, Length 582 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00491-204ENST00000513815 EFCAB5A4FU69 1503 aa7.93□□□□□ -1.14
LINC00491-204ENST00000513815 RICTORQ6R327 1708 aa7.93□□□□□ -1.14
LINC00491-204ENST00000513815 TOM1O60784 492 aa7.92□□□□□ -1.14
LINC00491-204ENST00000513815 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
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LINC00491-204ENST00000513815 ABCA8O94911 1581 aa7.91□□□□□ -1.14
LINC00491-204ENST00000513815 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
LINC00491-204ENST00000513815 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa7.89□□□□□ -1.15
LINC00491-204ENST00000513815 KIF27Q86VH2 1401 aa7.89□□□□□ -1.15
LINC00491-204ENST00000513815 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa7.89□□□□□ -1.15
LINC00491-204ENST00000513815 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa7.89□□□□□ -1.15
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LINC00491-204ENST00000513815 CFAP74Q9C0B2 1584 aa7.88□□□□□ -1.15
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LINC00491-204ENST00000513815 PKD2Q13563 968 aa7.87□□□□□ -1.15
LINC00491-204ENST00000513815 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
LINC00491-204ENST00000513815 PLA2R1Q13018 1463 aa7.86□□□□□ -1.15
LINC00491-204ENST00000513815 PTPRKQ15262 1439 aa7.86□□□□□ -1.15
LINC00491-204ENST00000513815 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa7.86□□□□□ -1.15
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LINC00491-204ENST00000513815 ATP10AO60312 1499 aa7.85□□□□□ -1.15
LINC00491-204ENST00000513815 C9orf84Q5VXU9 1444 aa7.85□□□□□ -1.15
LINC00491-204ENST00000513815 GOLGA3Q08378 1498 aa7.84□□□□□ -1.15
LINC00491-204ENST00000513815 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
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LINC00491-204ENST00000513815 C3P01024 1663 aa7.83□□□□□ -1.16
LINC00491-204ENST00000513815 ATP10BO94823 1461 aa7.82□□□□□ -1.16
LINC00491-204ENST00000513815 MLECQ14165 292 aa7.82□□□□□ -1.16
LINC00491-204ENST00000513815 NPATQ14207 1427 aa7.82□□□□□ -1.16
LINC00491-204ENST00000513815 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
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LINC00491-204ENST00000513815 HECW1Q76N89 1606 aa7.81□□□□□ -1.16
LINC00491-204ENST00000513815 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa7.81□□□□□ -1.16
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LINC00491-204ENST00000513815 AGLP35573 1532 aa7.8□□□□□ -1.16
LINC00491-204ENST00000513815 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP7.8□□□□□ -1.16
LINC00491-204ENST00000513815 REREQ9P2R6 1566 aa7.8□□□□□ -1.16
LINC00491-204ENST00000513815 POTEAQ6S8J7 498 aa7.78□□□□□ -1.16
LINC00491-204ENST00000513815 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP7.78□□□□□ -1.16
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LINC00491-204ENST00000513815 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP7.77□□□□□ -1.17
LINC00491-204ENST00000513815 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa7.76□□□□□ -1.17
LINC00491-204ENST00000513815 SHANK2Q9UPX8 1470 aa7.75□□□□□ -1.17
LINC00491-204ENST00000513815 MROH2AA6NES4 1674 aa7.75□□□□□ -1.17
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LINC00491-204ENST00000513815 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa7.72□□□□□ -1.17
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LINC00491-204ENST00000513815 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP7.7□□□□□ -1.18
LINC00491-204ENST00000513815 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP7.7□□□□□ -1.18
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LINC00491-204ENST00000513815 PLCH2O75038 1416 aa7.69□□□□□ -1.18
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LINC00491-204ENST00000513815 MYO3AQ8NEV4 1616 aa7.68□□□□□ -1.18
LINC00491-204ENST00000513815 PLEKHD1A6NEE1 506 aa7.68□□□□□ -1.18
LINC00491-204ENST00000513815 IFFO2Q5TF58 517 aa7.68□□□□□ -1.18
LINC00491-204ENST00000513815 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
LINC00491-204ENST00000513815 FAM135BQ49AJ0 1406 aa7.68□□□□□ -1.18
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LINC00491-204ENST00000513815 VWDEQ8N2E2 1590 aa7.67□□□□□ -1.18
LINC00491-204ENST00000513815 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa7.67□□□□□ -1.18
LINC00491-204ENST00000513815 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa7.67□□□□□ -1.18
LINC00491-204ENST00000513815 ZMYM3Q14202 1370 aa7.67□□□□□ -1.18
LINC00491-204ENST00000513815 MLH3Q9UHC1 1453 aa7.67□□□□□ -1.18
LINC00491-204ENST00000513815 A2ML1A8K2U0 1454 aa7.65□□□□□ -1.18
LINC00491-204ENST00000513815 MED14O60244 1454 aa7.65□□□□□ -1.18
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LINC00491-204ENST00000513815 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP7.64□□□□□ -1.19
LINC00491-204ENST00000513815 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP7.63□□□□□ -1.19
LINC00491-204ENST00000513815 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP7.63□□□□□ -1.19
LINC00491-204ENST00000513815 DEPDC5O75140 1603 aa7.63□□□□□ -1.19
LINC00491-204ENST00000513815 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP7.62□□□□□ -1.19
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LINC00491-204ENST00000513815 ABCA6Q8N139 1617 aa7.61□□□□□ -1.19
LINC00491-204ENST00000513815 ARID3CA6NKF2 412 aa7.61□□□□□ -1.19
LINC00491-204ENST00000513815 ANKLE2Q86XL3 938 aa7.61□□□□□ -1.19
LINC00491-204ENST00000513815 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP7.61□□□□□ -1.19
LINC00491-204ENST00000513815 MYO5CQ9NQX4 1742 aa7.59□□□□□ -1.19
LINC00491-204ENST00000513815 SAMD9Q5K651 1589 aa7.59□□□□□ -1.2
LINC00491-204ENST00000513815 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP7.59□□□□□ -1.2
LINC00491-204ENST00000513815 JCADQ9P266 1359 aa7.59□□□□□ -1.2
LINC00491-204ENST00000513815 RXRBP28702 533 aa7.58□□□□□ -1.2
LINC00491-204ENST00000513815 AFAP1Q8N556 730 aa7.58□□□□□ -1.2
LINC00491-204ENST00000513815 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
LINC00491-204ENST00000513815 STRCP1A6NGW2 1772 aa7.58□□□□□ -1.2
LINC00491-204ENST00000513815 KDM5DQ9BY66 1539 aa7.57□□□□□ -1.2
LINC00491-204ENST00000513815 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
LINC00491-204ENST00000513815 IQGAP1P46940 1657 aa7.57□□□□□ -1.2
LINC00491-204ENST00000513815 LRP5O75197 1615 aa7.56□□□□□ -1.2
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