RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513069.1

SH3BP2-225, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 866 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-225ENST00000513069 TIAM1Q13009 1591 aa24.07■■□□□ 1.44
SH3BP2-225ENST00000513069 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa24.07■■□□□ 1.44
SH3BP2-225ENST00000513069 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24.05■■□□□ 1.44
SH3BP2-225ENST00000513069 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
SH3BP2-225ENST00000513069 PREX2Q70Z35 1606 aa24.04■■□□□ 1.44
SH3BP2-225ENST00000513069 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa24.03■■□□□ 1.44
SH3BP2-225ENST00000513069 RICTORQ6R327 1708 aa24.03■■□□□ 1.44
SH3BP2-225ENST00000513069 MAP3K1Q13233 1512 aa24.03■■□□□ 1.44
SH3BP2-225ENST00000513069 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa24.02■■□□□ 1.44
SH3BP2-225ENST00000513069 CCNB3Q8WWL7 1395 aa24.02■■□□□ 1.44
SH3BP2-225ENST00000513069 POGZQ7Z3K3 1410 aa24.01■■□□□ 1.43
SH3BP2-225ENST00000513069 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa24.01■■□□□ 1.43
SH3BP2-225ENST00000513069 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa24■■□□□ 1.43
SH3BP2-225ENST00000513069 AFAP1Q8N556 730 aa23.99■■□□□ 1.43
SH3BP2-225ENST00000513069 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
SH3BP2-225ENST00000513069 NCOA2Q15596 1464 aa23.97■■□□□ 1.43
SH3BP2-225ENST00000513069 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa23.96■■□□□ 1.43
SH3BP2-225ENST00000513069 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
SH3BP2-225ENST00000513069 ABCC1P33527 1531 aa23.94■■□□□ 1.42
SH3BP2-225ENST00000513069 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa23.94■■□□□ 1.42
SH3BP2-225ENST00000513069 YEATS2Q9ULM3 1422 aa23.93■■□□□ 1.42
SH3BP2-225ENST00000513069 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa23.93■■□□□ 1.42
SH3BP2-225ENST00000513069 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
SH3BP2-225ENST00000513069 MAGI2Q86UL8 1455 aa23.92■■□□□ 1.42
SH3BP2-225ENST00000513069 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP23.91■■□□□ 1.42
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SH3BP2-225ENST00000513069 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa23.89■■□□□ 1.41
SH3BP2-225ENST00000513069 KDM5CP41229 1560 aa23.89■■□□□ 1.41
SH3BP2-225ENST00000513069 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa23.89■■□□□ 1.41
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SH3BP2-225ENST00000513069 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa23.87■■□□□ 1.41
SH3BP2-225ENST00000513069 ITSN2Q9NZM3 1697 aa23.86■■□□□ 1.41
SH3BP2-225ENST00000513069 SYCP2Q9BX26 1530 aa23.85■■□□□ 1.41
SH3BP2-225ENST00000513069 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP23.85■■□□□ 1.41
SH3BP2-225ENST00000513069 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa23.84■■□□□ 1.41
SH3BP2-225ENST00000513069 MLH3Q9UHC1 1453 aa23.84■■□□□ 1.41
SH3BP2-225ENST00000513069 MBD5Q9P267 1494 aa23.82■■□□□ 1.4
SH3BP2-225ENST00000513069 ATP10AO60312 1499 aa23.81■■□□□ 1.4
SH3BP2-225ENST00000513069 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa23.79■■□□□ 1.4
SH3BP2-225ENST00000513069 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP23.78■■□□□ 1.4
SH3BP2-225ENST00000513069 HECW2Q9P2P5 1572 aa23.78■■□□□ 1.4
SH3BP2-225ENST00000513069 MYOM3Q5VTT5 1437 aa23.76■■□□□ 1.39
SH3BP2-225ENST00000513069 MYT1LQ9UL68 1186 aa23.76■■□□□ 1.39
SH3BP2-225ENST00000513069 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
SH3BP2-225ENST00000513069 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa23.75■■□□□ 1.39
SH3BP2-225ENST00000513069 C9orf84Q5VXU9 1444 aa23.75■■□□□ 1.39
SH3BP2-225ENST00000513069 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa23.74■■□□□ 1.39
SH3BP2-225ENST00000513069 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa23.74■■□□□ 1.39
SH3BP2-225ENST00000513069 MIA2Q96PC5 1412 aa23.73■■□□□ 1.39
SH3BP2-225ENST00000513069 ABCA6Q8N139 1617 aa23.73■■□□□ 1.39
SH3BP2-225ENST00000513069 ADAMTSL3P82987 1691 aa23.71■■□□□ 1.39
SH3BP2-225ENST00000513069 BCORL1Q5H9F3 1711 aa23.7■■□□□ 1.39
SH3BP2-225ENST00000513069 RSPH4AQ5TD94 716 aa23.69■■□□□ 1.38
SH3BP2-225ENST00000513069 REREQ9P2R6 1566 aa23.67■■□□□ 1.38
SH3BP2-225ENST00000513069 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
SH3BP2-225ENST00000513069 ATP7AQ04656 1500 aa23.67■■□□□ 1.38
SH3BP2-225ENST00000513069 MLECQ14165 292 aa23.66■■□□□ 1.38
SH3BP2-225ENST00000513069 CCDC141Q6ZP82 1450 aa23.66■■□□□ 1.38
SH3BP2-225ENST00000513069 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa23.65■■□□□ 1.38
SH3BP2-225ENST00000513069 FGD6Q6ZV73 1430 aa23.64■■□□□ 1.37
SH3BP2-225ENST00000513069 ARHGEF5Q12774 1597 aa23.64■■□□□ 1.37
SH3BP2-225ENST00000513069 AGLP35573 1532 aa23.63■■□□□ 1.37
SH3BP2-225ENST00000513069 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
SH3BP2-225ENST00000513069 MADDQ8WXG6 1647 aa23.61■■□□□ 1.37
SH3BP2-225ENST00000513069 PTPRMP28827 1452 aa23.61■■□□□ 1.37
SH3BP2-225ENST00000513069 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
SH3BP2-225ENST00000513069 A2MP01023 1474 aa23.58■■□□□ 1.37
SH3BP2-225ENST00000513069 TSPY4P0CV99 314 aa23.58■■□□□ 1.37
SH3BP2-225ENST00000513069 TSPY10P0CW01 314 aa23.58■■□□□ 1.37
SH3BP2-225ENST00000513069 PTPN23Q9H3S7 1636 aa23.58■■□□□ 1.36
SH3BP2-225ENST00000513069 ABCC5O15440 1437 aa23.56■■□□□ 1.36
SH3BP2-225ENST00000513069 PLXNC1O60486 1568 aa23.56■■□□□ 1.36
SH3BP2-225ENST00000513069 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
SH3BP2-225ENST00000513069 MAST1Q9Y2H9 1570 aa23.52■■□□□ 1.36
SH3BP2-225ENST00000513069 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
SH3BP2-225ENST00000513069 ADGBQ8N7X0 1667 aa23.5■■□□□ 1.35
SH3BP2-225ENST00000513069 DAPK1P53355 1430 aa23.49■■□□□ 1.35
SH3BP2-225ENST00000513069 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
SH3BP2-225ENST00000513069 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa23.46■■□□□ 1.35
SH3BP2-225ENST00000513069 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
SH3BP2-225ENST00000513069 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
SH3BP2-225ENST00000513069 SHANK2Q9UPX8 1470 aa23.45■■□□□ 1.34
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SH3BP2-225ENST00000513069 PLPPR3Q6T4P5 718 aa23.43■■□□□ 1.34
SH3BP2-225ENST00000513069 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa23.41■■□□□ 1.34
SH3BP2-225ENST00000513069 CHIC2Q9UKJ5 165 aa23.41■■□□□ 1.34
SH3BP2-225ENST00000513069 CROCC2H7BZ55 1655 aa23.41■■□□□ 1.34
SH3BP2-225ENST00000513069 PPP6R1Q9UPN7 881 aa23.39■■□□□ 1.33
SH3BP2-225ENST00000513069 PTPRKQ15262 1439 aa23.39■■□□□ 1.33
SH3BP2-225ENST00000513069 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
SH3BP2-225ENST00000513069 CNTLNQ9NXG0 1405 aa23.38■■□□□ 1.33
SH3BP2-225ENST00000513069 KIF15Q9NS87 1388 aa23.38■■□□□ 1.33
SH3BP2-225ENST00000513069 NCOA1Q15788 1441 aa23.37■■□□□ 1.33
SH3BP2-225ENST00000513069 ZMYM3Q14202 1370 aa23.36■■□□□ 1.33
SH3BP2-225ENST00000513069 DUOX2Q9NRD8 1548 aa23.35■■□□□ 1.33
SH3BP2-225ENST00000513069 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP23.35■■□□□ 1.33
SH3BP2-225ENST00000513069 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa23.34■■□□□ 1.33
SH3BP2-225ENST00000513069 ADGRL2O95490 1459 aa23.33■■□□□ 1.33
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