RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506438.5

PITX1-205, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX1, Length 1,305 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-205ENST00000506438 LMTK3Q96Q04 1460 aa34.41■■■■□ 3.1
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PITX1-205ENST00000506438 MLECQ14165 292 aa34.34■■■■□ 3.09
PITX1-205ENST00000506438 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa34.32■■■■□ 3.09
PITX1-205ENST00000506438 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa34.32■■■■□ 3.09
PITX1-205ENST00000506438 MYO5CQ9NQX4 1742 aa34.32■■■■□ 3.08
PITX1-205ENST00000506438 KIF14Q15058 1648 aa34.29■■■■□ 3.08
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PITX1-205ENST00000506438 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa34.24■■■■□ 3.07
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PITX1-205ENST00000506438 C9orf84Q5VXU9 1444 aa34.23■■■■□ 3.07
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PITX1-205ENST00000506438 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa34.15■■■■□ 3.06
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PITX1-205ENST00000506438 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP33.34■■■□□ 2.93
PITX1-205ENST00000506438 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa33.32■■■□□ 2.92
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PITX1-205ENST00000506438 PLA2R1Q13018 1463 aa33.31■■■□□ 2.92
PITX1-205ENST00000506438 PKD2Q13563 968 aa33.29■■■□□ 2.92
PITX1-205ENST00000506438 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP33.27■■■□□ 2.92
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PITX1-205ENST00000506438 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP33.26■■■□□ 2.91
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