RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498524.5

ANKRD28-213, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD28, Length 4,289 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-213ENST00000498524 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
ANKRD28-213ENST00000498524 ABCC2Q92887 1545 aa5.63□□□□□ -1.51
ANKRD28-213ENST00000498524 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
ANKRD28-213ENST00000498524 CNTLNQ9NXG0 1405 aa5.63□□□□□ -1.51
ANKRD28-213ENST00000498524 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
ANKRD28-213ENST00000498524 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
ANKRD28-213ENST00000498524 ERCC6L2Q5T890 1561 aa5.62□□□□□ -1.51
ANKRD28-213ENST00000498524 FMN1Q68DA7 1419 aa5.61□□□□□ -1.51
ANKRD28-213ENST00000498524 MTUS2Q5JR59 1369 aa5.61□□□□□ -1.51
ANKRD28-213ENST00000498524 CEP170Q5SW79 1584 aa5.61□□□□□ -1.51
ANKRD28-213ENST00000498524 WDR7Q9Y4E6 1490 aa5.6□□□□□ -1.51
ANKRD28-213ENST00000498524 GGT6Q6P531 493 aa5.6□□□□□ -1.51
ANKRD28-213ENST00000498524 PIP4K2BP78356 416 aa5.6□□□□□ -1.51
ANKRD28-213ENST00000498524 NEUROD1Q13562 356 aa5.6□□□□□ -1.51
ANKRD28-213ENST00000498524 SOCS7O14512 581 aa5.59□□□□□ -1.51
ANKRD28-213ENST00000498524 ADGRL1O94910 1474 aa5.59□□□□□ -1.52
ANKRD28-213ENST00000498524 IGF1RP08069 1367 aa5.59□□□□□ -1.52
ANKRD28-213ENST00000498524 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.52
ANKRD28-213ENST00000498524 CHGAP10645 457 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.52
ANKRD28-213ENST00000498524 CCNB3Q8WWL7 1395 aa5.58□□□□□ -1.52
ANKRD28-213ENST00000498524 MAPKBP1O60336 1514 aa5.58□□□□□ -1.52
ANKRD28-213ENST00000498524 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa5.58□□□□□ -1.52
ANKRD28-213ENST00000498524 NEO1Q92859 1461 aa5.58□□□□□ -1.52
ANKRD28-213ENST00000498524 CUL7Q14999 1698 aa5.58□□□□□ -1.52
ANKRD28-213ENST00000498524 CHD1O14646 1710 aa5.58□□□□□ -1.52
ANKRD28-213ENST00000498524 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa5.58□□□□□ -1.52
ANKRD28-213ENST00000498524 CUX1P39880 1505 aa5.58□□□□□ -1.52
ANKRD28-213ENST00000498524 CLASP1Q7Z460 1538 aa5.58□□□□□ -1.52
ANKRD28-213ENST00000498524 TMEM132AQ24JP5 1023 aa5.57□□□□□ -1.52
ANKRD28-213ENST00000498524 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP5.57□□□□□ -1.52
ANKRD28-213ENST00000498524 PRDM2Q13029 1718 aa5.57□□□□□ -1.52
ANKRD28-213ENST00000498524 A0A0G2JS52 829 aa5.57□□□□□ -1.52
ANKRD28-213ENST00000498524 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa5.57□□□□□ -1.52
ANKRD28-213ENST00000498524 ATF3P18847 181 aa5.57□□□□□ -1.52
ANKRD28-213ENST00000498524 ADAMTS12P58397 1594 aa5.57□□□□□ -1.52
ANKRD28-213ENST00000498524 RAPGEF3O95398 923 aa5.57□□□□□ -1.52
ANKRD28-213ENST00000498524 NGLY1Q96IV0 654 aa5.56□□□□□ -1.52
ANKRD28-213ENST00000498524 IQGAP2Q13576 1575 aa5.56□□□□□ -1.52
ANKRD28-213ENST00000498524 CEP162Q5TB80 1403 aa5.55□□□□□ -1.52
ANKRD28-213ENST00000498524 MAGI2Q86UL8 1455 aa5.55□□□□□ -1.52
ANKRD28-213ENST00000498524 CLSPNQ9HAW4 1339 aa5.54□□□□□ -1.52
ANKRD28-213ENST00000498524 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
ANKRD28-213ENST00000498524 VSIG10Q8N0Z9 540 aa5.54□□□□□ -1.52
ANKRD28-213ENST00000498524 CCDC18Q5T9S5 1454 aa5.54□□□□□ -1.52
ANKRD28-213ENST00000498524 PLEKHG5O94827 1062 aa5.54□□□□□ -1.52
ANKRD28-213ENST00000498524 SCAPERQ9BY12 1400 aa5.54□□□□□ -1.52
ANKRD28-213ENST00000498524 YEATS2Q9ULM3 1422 aa5.54□□□□□ -1.52
ANKRD28-213ENST00000498524 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
ANKRD28-213ENST00000498524 BCL11AQ9H165 835 aa5.54□□□□□ -1.52
ANKRD28-213ENST00000498524 EFCAB5A4FU69 1503 aa5.53□□□□□ -1.52
ANKRD28-213ENST00000498524 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa5.53□□□□□ -1.52
ANKRD28-213ENST00000498524 HSPA2P54652 639 aa5.53□□□□□ -1.52
ANKRD28-213ENST00000498524 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
ANKRD28-213ENST00000498524 PTPRKQ15262 1439 aa5.53□□□□□ -1.52
ANKRD28-213ENST00000498524 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
ANKRD28-213ENST00000498524 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa5.53□□□□□ -1.52
ANKRD28-213ENST00000498524 NEFLP07196 543 aa5.52□□□□□ -1.53
ANKRD28-213ENST00000498524 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
ANKRD28-213ENST00000498524 KIF3BO15066 747 aa5.52□□□□□ -1.53
ANKRD28-213ENST00000498524 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
ANKRD28-213ENST00000498524 C9orf84Q5VXU9 1444 aa5.51□□□□□ -1.53
ANKRD28-213ENST00000498524 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
ANKRD28-213ENST00000498524 CFAP74Q9C0B2 1584 aa5.5□□□□□ -1.53
ANKRD28-213ENST00000498524 FKBP8Q14318 412 aa5.5□□□□□ -1.53
ANKRD28-213ENST00000498524 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
ANKRD28-213ENST00000498524 ZRANB1Q9UGI0 708 aa5.5□□□□□ -1.53
ANKRD28-213ENST00000498524 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
ANKRD28-213ENST00000498524 ATP10AO60312 1499 aa5.49□□□□□ -1.53
ANKRD28-213ENST00000498524 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
ANKRD28-213ENST00000498524 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
ANKRD28-213ENST00000498524 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
ANKRD28-213ENST00000498524 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
ANKRD28-213ENST00000498524 GLI2P10070 1586 aa5.49□□□□□ -1.53
ANKRD28-213ENST00000498524 FAM135AQ9P2D6 1515 aa5.49□□□□□ -1.53
ANKRD28-213ENST00000498524 PBRM1Q86U86 1689 aa5.48□□□□□ -1.53
ANKRD28-213ENST00000498524 MSH6P52701 1360 aa5.48□□□□□ -1.53
ANKRD28-213ENST00000498524 TXNDC2Q86VQ3 553 aa5.48□□□□□ -1.53
ANKRD28-213ENST00000498524 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa5.48□□□□□ -1.53
ANKRD28-213ENST00000498524 ARHGAP5Q13017 1502 aa5.48□□□□□ -1.53
ANKRD28-213ENST00000498524 CADPS2Q86UW7 1296 aa5.48□□□□□ -1.53
ANKRD28-213ENST00000498524 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa5.47□□□□□ -1.53
ANKRD28-213ENST00000498524 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
ANKRD28-213ENST00000498524 KDM5BQ9UGL1 1544 aa5.47□□□□□ -1.53
ANKRD28-213ENST00000498524 PTPRTO14522 1441 aa5.47□□□□□ -1.53
ANKRD28-213ENST00000498524 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
ANKRD28-213ENST00000498524 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.53
ANKRD28-213ENST00000498524 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa5.46□□□□□ -1.54
ANKRD28-213ENST00000498524 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa5.46□□□□□ -1.54
ANKRD28-213ENST00000498524 PTPRMP28827 1452 aa5.46□□□□□ -1.54
ANKRD28-213ENST00000498524 TNRQ92752 1358 aa5.46□□□□□ -1.54
ANKRD28-213ENST00000498524 UGGT2Q9NYU1 1516 aa5.46□□□□□ -1.54
ANKRD28-213ENST00000498524 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
ANKRD28-213ENST00000498524 POLR3GLQ9BT43 218 aa5.45□□□□□ -1.54
ANKRD28-213ENST00000498524 CFAP43Q8NDM7 1665 aa5.45□□□□□ -1.54
ANKRD28-213ENST00000498524 NBR1Q14596 966 aa5.45□□□□□ -1.54
ANKRD28-213ENST00000498524 MIER1Q8N108 512 aa5.45□□□□□ -1.54
ANKRD28-213ENST00000498524 TRIM52Q96A61 297 aa5.44□□□□□ -1.54
ANKRD28-213ENST00000498524 SLC52A1Q9NWF4 448 aa5.44□□□□□ -1.54
ANKRD28-213ENST00000498524 DIP2BQ9P265 1576 aa5.44□□□□□ -1.54
ANKRD28-213ENST00000498524 ARAP3Q8WWN8 1544 aa5.44□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 141.5 ms