RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497552.5

PRRT1-211, Transcript of proline rich transmembrane protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene PRRT1, Length 543 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT1-211ENST00000497552 PLCH2O75038 1416 aa27.17■■□□□ 1.94
PRRT1-211ENST00000497552 POGZQ7Z3K3 1410 aa27.17■■□□□ 1.94
PRRT1-211ENST00000497552 SCAPERQ9BY12 1400 aa27.17■■□□□ 1.94
PRRT1-211ENST00000497552 MLECQ14165 292 aa27.16■■□□□ 1.94
PRRT1-211ENST00000497552 MAGI2Q86UL8 1455 aa27.15■■□□□ 1.94
PRRT1-211ENST00000497552 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa27.14■■□□□ 1.94
PRRT1-211ENST00000497552 KIF14Q15058 1648 aa27.12■■□□□ 1.93
PRRT1-211ENST00000497552 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa27.12■■□□□ 1.93
PRRT1-211ENST00000497552 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP27.11■■□□□ 1.93
PRRT1-211ENST00000497552 MYO5CQ9NQX4 1742 aa27.09■■□□□ 1.93
PRRT1-211ENST00000497552 UBTFP17480 764 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
PRRT1-211ENST00000497552 FMN1Q68DA7 1419 aa27.07■■□□□ 1.92
PRRT1-211ENST00000497552 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa27.06■■□□□ 1.92
PRRT1-211ENST00000497552 ATP10AO60312 1499 aa27.05■■□□□ 1.92
PRRT1-211ENST00000497552 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa27.04■■□□□ 1.92
PRRT1-211ENST00000497552 C9orf84Q5VXU9 1444 aa27.04■■□□□ 1.92
PRRT1-211ENST00000497552 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa27.02■■□□□ 1.92
PRRT1-211ENST00000497552 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP27■■□□□ 1.91
PRRT1-211ENST00000497552 ARHGAP5Q13017 1502 aa26.98■■□□□ 1.91
PRRT1-211ENST00000497552 KDM5CP41229 1560 aa26.97■■□□□ 1.91
PRRT1-211ENST00000497552 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
PRRT1-211ENST00000497552 AFAP1Q8N556 730 aa26.96■■□□□ 1.91
PRRT1-211ENST00000497552 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa26.95■■□□□ 1.91
PRRT1-211ENST00000497552 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
PRRT1-211ENST00000497552 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa26.93■■□□□ 1.9
PRRT1-211ENST00000497552 PREX1Q8TCU6 1659 aa26.92■■□□□ 1.9
PRRT1-211ENST00000497552 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa26.92■■□□□ 1.9
PRRT1-211ENST00000497552 CLIP1P30622 1438 aa26.9■■□□□ 1.9
PRRT1-211ENST00000497552 CERKQ8TCT0 537 aa26.89■■□□□ 1.9
PRRT1-211ENST00000497552 ABCA6Q8N139 1617 aa26.89■■□□□ 1.9
PRRT1-211ENST00000497552 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa26.86■■□□□ 1.89
PRRT1-211ENST00000497552 PREX2Q70Z35 1606 aa26.85■■□□□ 1.89
PRRT1-211ENST00000497552 STRCQ7RTU9 1775 aa26.84■■□□□ 1.89
PRRT1-211ENST00000497552 MYT1LQ9UL68 1186 aa26.84■■□□□ 1.89
PRRT1-211ENST00000497552 ABCC1P33527 1531 aa26.84■■□□□ 1.89
PRRT1-211ENST00000497552 REREQ9P2R6 1566 aa26.84■■□□□ 1.89
PRRT1-211ENST00000497552 ITSN2Q9NZM3 1697 aa26.82■■□□□ 1.88
PRRT1-211ENST00000497552 MLH3Q9UHC1 1453 aa26.81■■□□□ 1.88
PRRT1-211ENST00000497552 C3P01024 1663 aa26.79■■□□□ 1.88
PRRT1-211ENST00000497552 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa26.79■■□□□ 1.88
PRRT1-211ENST00000497552 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa26.79■■□□□ 1.88
PRRT1-211ENST00000497552 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa26.76■■□□□ 1.88
PRRT1-211ENST00000497552 CCDC18Q5T9S5 1454 aa26.76■■□□□ 1.87
PRRT1-211ENST00000497552 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa26.76■■□□□ 1.87
PRRT1-211ENST00000497552 AGLP35573 1532 aa26.75■■□□□ 1.87
PRRT1-211ENST00000497552 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
PRRT1-211ENST00000497552 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa26.68■■□□□ 1.86
PRRT1-211ENST00000497552 FYCO1Q9BQS8 1478 aa26.66■■□□□ 1.86
PRRT1-211ENST00000497552 SYCP2Q9BX26 1530 aa26.65■■□□□ 1.86
PRRT1-211ENST00000497552 DMRT2Q9Y5R5 561 aa26.64■■□□□ 1.86
PRRT1-211ENST00000497552 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
PRRT1-211ENST00000497552 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
PRRT1-211ENST00000497552 PTPRTO14522 1441 aa26.62■■□□□ 1.85
PRRT1-211ENST00000497552 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
PRRT1-211ENST00000497552 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP26.59■■□□□ 1.85
PRRT1-211ENST00000497552 CNTLNQ9NXG0 1405 aa26.58■■□□□ 1.85
PRRT1-211ENST00000497552 NCOA1Q15788 1441 aa26.57■■□□□ 1.84
PRRT1-211ENST00000497552 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
PRRT1-211ENST00000497552 LTBP4Q8N2S1 1624 aa26.57■■□□□ 1.84
PRRT1-211ENST00000497552 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
PRRT1-211ENST00000497552 MROH2AA6NES4 1674 aa26.54■■□□□ 1.84
PRRT1-211ENST00000497552 ATP7AQ04656 1500 aa26.54■■□□□ 1.84
PRRT1-211ENST00000497552 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
PRRT1-211ENST00000497552 PLXNC1O60486 1568 aa26.52■■□□□ 1.84
PRRT1-211ENST00000497552 ZMYM3Q14202 1370 aa26.52■■□□□ 1.84
PRRT1-211ENST00000497552 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa26.52■■□□□ 1.84
PRRT1-211ENST00000497552 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
PRRT1-211ENST00000497552 NPATQ14207 1427 aa26.5■■□□□ 1.83
PRRT1-211ENST00000497552 ILDR2Q71H61 639 aa26.5■■□□□ 1.83
PRRT1-211ENST00000497552 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa26.48■■□□□ 1.83
PRRT1-211ENST00000497552 DISP3Q9P2K9 1392 aa26.48■■□□□ 1.83
PRRT1-211ENST00000497552 A2MP01023 1474 aa26.48■■□□□ 1.83
PRRT1-211ENST00000497552 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
PRRT1-211ENST00000497552 CCNB3Q8WWL7 1395 aa26.46■■□□□ 1.83
PRRT1-211ENST00000497552 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa26.44■■□□□ 1.82
PRRT1-211ENST00000497552 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa26.44■■□□□ 1.82
PRRT1-211ENST00000497552 MYO3AQ8NEV4 1616 aa26.44■■□□□ 1.82
PRRT1-211ENST00000497552 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
PRRT1-211ENST00000497552 TIAM1Q13009 1591 aa26.42■■□□□ 1.82
PRRT1-211ENST00000497552 PTPRKQ15262 1439 aa26.42■■□□□ 1.82
PRRT1-211ENST00000497552 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
PRRT1-211ENST00000497552 MTUS2Q5JR59 1369 aa26.41■■□□□ 1.82
PRRT1-211ENST00000497552 GGT6Q6P531 493 aa26.4■■□□□ 1.82
PRRT1-211ENST00000497552 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.81
PRRT1-211ENST00000497552 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
PRRT1-211ENST00000497552 IQSEC2Q5JU85 1478 aa26.38■■□□□ 1.81
PRRT1-211ENST00000497552 MBD5Q9P267 1494 aa26.37■■□□□ 1.81
PRRT1-211ENST00000497552 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa26.37■■□□□ 1.81
PRRT1-211ENST00000497552 ADGBQ8N7X0 1667 aa26.36■■□□□ 1.81
PRRT1-211ENST00000497552 PLA2R1Q13018 1463 aa26.34■■□□□ 1.81
PRRT1-211ENST00000497552 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
PRRT1-211ENST00000497552 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa26.34■■□□□ 1.81
PRRT1-211ENST00000497552 PKD2Q13563 968 aa26.28■■□□□ 1.8
PRRT1-211ENST00000497552 CEP162Q5TB80 1403 aa26.28■■□□□ 1.8
PRRT1-211ENST00000497552 SOCS7O14512 581 aa26.26■■□□□ 1.79
PRRT1-211ENST00000497552 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
PRRT1-211ENST00000497552 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa26.25■■□□□ 1.79
PRRT1-211ENST00000497552 A2ML1A8K2U0 1454 aa26.24■■□□□ 1.79
PRRT1-211ENST00000497552 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
PRRT1-211ENST00000497552 PPP6R1Q9UPN7 881 aa26.23■■□□□ 1.79
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