RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497453.1

UBE2Q1-207, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

TSL 5

Gene UBE2Q1, Length 830 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1-207ENST00000497453 PREX2Q70Z35 1606 aa28.21■■■□□ 2.11
UBE2Q1-207ENST00000497453 SCAPERQ9BY12 1400 aa28.21■■■□□ 2.11
UBE2Q1-207ENST00000497453 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa28.2■■■□□ 2.1
UBE2Q1-207ENST00000497453 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
UBE2Q1-207ENST00000497453 CCNB3Q8WWL7 1395 aa28.18■■■□□ 2.1
UBE2Q1-207ENST00000497453 MAP3K1Q13233 1512 aa28.18■■■□□ 2.1
UBE2Q1-207ENST00000497453 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa28.17■■■□□ 2.1
UBE2Q1-207ENST00000497453 RICTORQ6R327 1708 aa28.15■■■□□ 2.1
UBE2Q1-207ENST00000497453 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa28.15■■■□□ 2.1
UBE2Q1-207ENST00000497453 POGZQ7Z3K3 1410 aa28.14■■■□□ 2.1
UBE2Q1-207ENST00000497453 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP28.12■■■□□ 2.09
UBE2Q1-207ENST00000497453 NCOA2Q15596 1464 aa28.1■■■□□ 2.09
UBE2Q1-207ENST00000497453 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
UBE2Q1-207ENST00000497453 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
UBE2Q1-207ENST00000497453 APLP2Q06481 763 aa28.09■■■□□ 2.09
UBE2Q1-207ENST00000497453 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa28.08■■■□□ 2.09
UBE2Q1-207ENST00000497453 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
UBE2Q1-207ENST00000497453 ABCC1P33527 1531 aa28.08■■■□□ 2.08
UBE2Q1-207ENST00000497453 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa28.06■■■□□ 2.08
UBE2Q1-207ENST00000497453 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa28.06■■■□□ 2.08
UBE2Q1-207ENST00000497453 AFAP1Q8N556 730 aa28.05■■■□□ 2.08
UBE2Q1-207ENST00000497453 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa28.04■■■□□ 2.08
UBE2Q1-207ENST00000497453 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa28.04■■■□□ 2.08
UBE2Q1-207ENST00000497453 MAGI2Q86UL8 1455 aa28.03■■■□□ 2.08
UBE2Q1-207ENST00000497453 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa28.02■■■□□ 2.08
UBE2Q1-207ENST00000497453 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa28.02■■■□□ 2.08
UBE2Q1-207ENST00000497453 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa28.01■■■□□ 2.07
UBE2Q1-207ENST00000497453 YEATS2Q9ULM3 1422 aa28.01■■■□□ 2.07
UBE2Q1-207ENST00000497453 ITSN2Q9NZM3 1697 aa28■■■□□ 2.07
UBE2Q1-207ENST00000497453 KDM5CP41229 1560 aa27.99■■■□□ 2.07
UBE2Q1-207ENST00000497453 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa27.98■■■□□ 2.07
UBE2Q1-207ENST00000497453 SYCP2Q9BX26 1530 aa27.97■■■□□ 2.07
UBE2Q1-207ENST00000497453 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP27.97■■■□□ 2.07
UBE2Q1-207ENST00000497453 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP27.97■■■□□ 2.07
UBE2Q1-207ENST00000497453 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP27.97■■■□□ 2.07
UBE2Q1-207ENST00000497453 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa27.97■■■□□ 2.07
UBE2Q1-207ENST00000497453 MLH3Q9UHC1 1453 aa27.92■■■□□ 2.06
UBE2Q1-207ENST00000497453 MYT1LQ9UL68 1186 aa27.92■■■□□ 2.06
UBE2Q1-207ENST00000497453 HECW2Q9P2P5 1572 aa27.91■■■□□ 2.06
UBE2Q1-207ENST00000497453 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP27.9■■■□□ 2.06
UBE2Q1-207ENST00000497453 ATP10AO60312 1499 aa27.89■■■□□ 2.06
UBE2Q1-207ENST00000497453 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa27.88■■■□□ 2.05
UBE2Q1-207ENST00000497453 MYOM3Q5VTT5 1437 aa27.87■■■□□ 2.05
UBE2Q1-207ENST00000497453 MBD5Q9P267 1494 aa27.87■■■□□ 2.05
UBE2Q1-207ENST00000497453 C9orf84Q5VXU9 1444 aa27.85■■■□□ 2.05
UBE2Q1-207ENST00000497453 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP27.85■■■□□ 2.05
UBE2Q1-207ENST00000497453 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa27.84■■■□□ 2.05
UBE2Q1-207ENST00000497453 MIA2Q96PC5 1412 aa27.83■■■□□ 2.05
UBE2Q1-207ENST00000497453 ABCA6Q8N139 1617 aa27.81■■■□□ 2.04
UBE2Q1-207ENST00000497453 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa27.81■■■□□ 2.04
UBE2Q1-207ENST00000497453 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa27.81■■■□□ 2.04
UBE2Q1-207ENST00000497453 BCORL1Q5H9F3 1711 aa27.78■■■□□ 2.04
UBE2Q1-207ENST00000497453 ATP7AQ04656 1500 aa27.77■■■□□ 2.04
UBE2Q1-207ENST00000497453 RSPH4AQ5TD94 716 aa27.77■■■□□ 2.04
UBE2Q1-207ENST00000497453 CCDC141Q6ZP82 1450 aa27.76■■■□□ 2.04
UBE2Q1-207ENST00000497453 ADAMTSL3P82987 1691 aa27.76■■■□□ 2.03
UBE2Q1-207ENST00000497453 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP27.76■■■□□ 2.03
UBE2Q1-207ENST00000497453 REREQ9P2R6 1566 aa27.75■■■□□ 2.03
UBE2Q1-207ENST00000497453 ARHGEF5Q12774 1597 aa27.73■■■□□ 2.03
UBE2Q1-207ENST00000497453 MLECQ14165 292 aa27.72■■■□□ 2.03
UBE2Q1-207ENST00000497453 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa27.71■■■□□ 2.03
UBE2Q1-207ENST00000497453 FGD6Q6ZV73 1430 aa27.71■■■□□ 2.03
UBE2Q1-207ENST00000497453 MADDQ8WXG6 1647 aa27.68■■■□□ 2.02
UBE2Q1-207ENST00000497453 AGLP35573 1532 aa27.67■■■□□ 2.02
UBE2Q1-207ENST00000497453 PTPN23Q9H3S7 1636 aa27.67■■■□□ 2.02
UBE2Q1-207ENST00000497453 TSPY4P0CV99 314 aa27.67■■■□□ 2.02
UBE2Q1-207ENST00000497453 TSPY10P0CW01 314 aa27.67■■■□□ 2.02
UBE2Q1-207ENST00000497453 A2MP01023 1474 aa27.65■■■□□ 2.02
UBE2Q1-207ENST00000497453 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP27.65■■■□□ 2.02
UBE2Q1-207ENST00000497453 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP27.65■■■□□ 2.02
UBE2Q1-207ENST00000497453 PTPRMP28827 1452 aa27.64■■■□□ 2.01
UBE2Q1-207ENST00000497453 PLXNC1O60486 1568 aa27.6■■■□□ 2.01
UBE2Q1-207ENST00000497453 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP27.59■■■□□ 2.01
UBE2Q1-207ENST00000497453 ADGBQ8N7X0 1667 aa27.59■■■□□ 2.01
UBE2Q1-207ENST00000497453 MAST1Q9Y2H9 1570 aa27.58■■■□□ 2.01
UBE2Q1-207ENST00000497453 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP27.58■■■□□ 2.01
UBE2Q1-207ENST00000497453 ABCC5O15440 1437 aa27.58■■■□□ 2
UBE2Q1-207ENST00000497453 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa27.55■■■□□ 2
UBE2Q1-207ENST00000497453 DAPK1P53355 1430 aa27.54■■■□□ 2
UBE2Q1-207ENST00000497453 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP27.54■■■□□ 2
UBE2Q1-207ENST00000497453 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP27.52■■■□□ 2
UBE2Q1-207ENST00000497453 SHANK2Q9UPX8 1470 aa27.52■■■□□ 2
UBE2Q1-207ENST00000497453 CROCC2H7BZ55 1655 aa27.49■■□□□ 1.99
UBE2Q1-207ENST00000497453 PLPPR3Q6T4P5 718 aa27.48■■□□□ 1.99
UBE2Q1-207ENST00000497453 GGT6Q6P531 493 aa27.47■■□□□ 1.99
UBE2Q1-207ENST00000497453 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP27.47■■□□□ 1.99
UBE2Q1-207ENST00000497453 KIF3BO15066 747 aa27.45■■□□□ 1.98
UBE2Q1-207ENST00000497453 CHIC2Q9UKJ5 165 aa27.44■■□□□ 1.98
UBE2Q1-207ENST00000497453 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP27.43■■□□□ 1.98
UBE2Q1-207ENST00000497453 CNTLNQ9NXG0 1405 aa27.42■■□□□ 1.98
UBE2Q1-207ENST00000497453 KIF15Q9NS87 1388 aa27.41■■□□□ 1.98
UBE2Q1-207ENST00000497453 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa27.41■■□□□ 1.98
UBE2Q1-207ENST00000497453 PPP6R1Q9UPN7 881 aa27.4■■□□□ 1.98
UBE2Q1-207ENST00000497453 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa27.39■■□□□ 1.98
UBE2Q1-207ENST00000497453 DUOX2Q9NRD8 1548 aa27.39■■□□□ 1.98
UBE2Q1-207ENST00000497453 NCOA1Q15788 1441 aa27.36■■□□□ 1.97
UBE2Q1-207ENST00000497453 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP27.35■■□□□ 1.976e-7■■■□□ 14.6
UBE2Q1-207ENST00000497453 ADGRL2O95490 1459 aa27.35■■□□□ 1.97
UBE2Q1-207ENST00000497453 PTPRKQ15262 1439 aa27.34■■□□□ 1.97
UBE2Q1-207ENST00000497453 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.1 ms