RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495879.1

PTPRG-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type G, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRG, Length 3,011 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Dendrite, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRG-207ENST00000495879 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
PTPRG-207ENST00000495879 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.49■■□□□ 1.67
PTPRG-207ENST00000495879 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
PTPRG-207ENST00000495879 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.48■■□□□ 1.67
PTPRG-207ENST00000495879 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
PTPRG-207ENST00000495879 ERICH6BQ5W0A0 696 aa25.46■■□□□ 1.67
PTPRG-207ENST00000495879 SAMD9Q5K651 1589 aa25.46■■□□□ 1.67
PTPRG-207ENST00000495879 DEKP35659 375 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
PTPRG-207ENST00000495879 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa25.4■■□□□ 1.66
PTPRG-207ENST00000495879 CCDC136Q96JN2 1154 aa25.39■■□□□ 1.65
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PTPRG-207ENST00000495879 ARHGEF11O15085 1522 aa25.37■■□□□ 1.65
PTPRG-207ENST00000495879 HECW1Q76N89 1606 aa25.37■■□□□ 1.65
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PTPRG-207ENST00000495879 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
PTPRG-207ENST00000495879 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
PTPRG-207ENST00000495879 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
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PTPRG-207ENST00000495879 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
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PTPRG-207ENST00000495879 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa25.3■■□□□ 1.64
PTPRG-207ENST00000495879 TEX14Q8IWB6 1497 aa25.3■■□□□ 1.64
PTPRG-207ENST00000495879 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.28■■□□□ 1.64
PTPRG-207ENST00000495879 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.28■■□□□ 1.64
PTPRG-207ENST00000495879 DAPK1P53355 1430 aa25.27■■□□□ 1.64
PTPRG-207ENST00000495879 ABCC5O15440 1437 aa25.26■■□□□ 1.63
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PTPRG-207ENST00000495879 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa25.25■■□□□ 1.63
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PTPRG-207ENST00000495879 MIA2Q96PC5 1412 aa25.23■■□□□ 1.63
PTPRG-207ENST00000495879 PKD2Q13563 968 aa25.23■■□□□ 1.63
PTPRG-207ENST00000495879 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
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PTPRG-207ENST00000495879 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.17■■□□□ 1.62
PTPRG-207ENST00000495879 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
PTPRG-207ENST00000495879 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
PTPRG-207ENST00000495879 CARD11Q9BXL7 1154 aa25.14■■□□□ 1.61
PTPRG-207ENST00000495879 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
PTPRG-207ENST00000495879 EXOC6Q8TAG9 804 aa25.13■■□□□ 1.61
PTPRG-207ENST00000495879 IQGAP2Q13576 1575 aa25.12■■□□□ 1.61
PTPRG-207ENST00000495879 ROCK1Q13464 1354 aa25.12■■□□□ 1.61
PTPRG-207ENST00000495879 BCORL1Q5H9F3 1711 aa25.11■■□□□ 1.61
PTPRG-207ENST00000495879 WDR62O43379 1518 aa25.11■■□□□ 1.61
PTPRG-207ENST00000495879 PZPP20742 1482 aa25.11■■□□□ 1.61
PTPRG-207ENST00000495879 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa25.1■■□□□ 1.61
PTPRG-207ENST00000495879 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
PTPRG-207ENST00000495879 RNF123Q5XPI4 1314 aa25.09■■□□□ 1.61
PTPRG-207ENST00000495879 SKAP1Q86WV1 359 aa25.09■■□□□ 1.61
PTPRG-207ENST00000495879 MYT1LQ9UL68 1186 aa25.05■■□□□ 1.6
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PTPRG-207ENST00000495879 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa25.01■■□□□ 1.59
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PTPRG-207ENST00000495879 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.98■■□□□ 1.59
PTPRG-207ENST00000495879 NUP155O75694 1391 aa24.98■■□□□ 1.59
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PTPRG-207ENST00000495879 FBLN2P98095 1184 aa24.97■■□□□ 1.59
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PTPRG-207ENST00000495879 MBD5Q9P267 1494 aa24.96■■□□□ 1.59
PTPRG-207ENST00000495879 RGL3Q3MIN7 710 aa24.94■■□□□ 1.58
PTPRG-207ENST00000495879 KIF15Q9NS87 1388 aa24.94■■□□□ 1.58
PTPRG-207ENST00000495879 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
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PTPRG-207ENST00000495879 PDE4AP27815 886 aa24.92■■□□□ 1.58
PTPRG-207ENST00000495879 DISP1Q96F81 1524 aa24.91■■□□□ 1.58
PTPRG-207ENST00000495879 ADAMTS12P58397 1594 aa24.9■■□□□ 1.58
PTPRG-207ENST00000495879 KDM5CP41229 1560 aa24.9■■□□□ 1.58
PTPRG-207ENST00000495879 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa24.9■■□□□ 1.58
PTPRG-207ENST00000495879 PBRM1Q86U86 1689 aa24.9■■□□□ 1.58
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PTPRG-207ENST00000495879 PLB1Q6P1J6 1458 aa24.89■■□□□ 1.58
PTPRG-207ENST00000495879 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa24.88■■□□□ 1.57
PTPRG-207ENST00000495879 IL27Q8NEV9 243 aa24.87■■□□□ 1.57
PTPRG-207ENST00000495879 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
PTPRG-207ENST00000495879 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
PTPRG-207ENST00000495879 NBPF1Q3BBV0 1214 aa24.86■■□□□ 1.57
PTPRG-207ENST00000495879 NEFMP07197 916 aa24.86■■□□□ 1.57
PTPRG-207ENST00000495879 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP24.86■■□□□ 1.571e-6■■■■□ 22.6
PTPRG-207ENST00000495879 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
PTPRG-207ENST00000495879 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
PTPRG-207ENST00000495879 RALBP1Q15311 655 aa24.84■■□□□ 1.57
PTPRG-207ENST00000495879 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
PTPRG-207ENST00000495879 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
PTPRG-207ENST00000495879 KIAA0556O60303 1618 aa24.82■■□□□ 1.56
PTPRG-207ENST00000495879 KIF14Q15058 1648 aa24.82■■□□□ 1.56
PTPRG-207ENST00000495879 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
PTPRG-207ENST00000495879 SLC4A3P48751 1232 aa24.8■■□□□ 1.56
PTPRG-207ENST00000495879 NLRP13Q86W25 1043 aa24.8■■□□□ 1.56
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