RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495702.5

CEP41-215, Transcript of centrosomal protein 41, human

TSL 1 (best)

Gene CEP41, Length 733 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CEP41-215	ENST00000495702	ARID3C	A6NKF2	412 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CEP41-215	ENST00000495702	AKT1S1	Q96B36	256 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CEP41-215	ENST00000495702	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CEP41-215	ENST00000495702	P3H3	Q8IVL6	736 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CEP41-215	ENST00000495702	GOLGA3	Q08378	1498 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CEP41-215	ENST00000495702	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		11.6	□□□□□ -0.55
CEP41-215	ENST00000495702	ABCA8	O94911	1581 aa		11.57	□□□□□ -0.56
CEP41-215	ENST00000495702	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		11.56	□□□□□ -0.56
CEP41-215	ENST00000495702	RAPGEF3	O95398	923 aa		11.56	□□□□□ -0.56
CEP41-215	ENST00000495702	FBXO41	Q8TF61	875 aa		11.54	□□□□□ -0.56
CEP41-215	ENST00000495702	ATP10B	O94823	1461 aa		11.54	□□□□□ -0.56
CEP41-215	ENST00000495702	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		11.54	□□□□□ -0.56
CEP41-215	ENST00000495702	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	11.54	□□□□□ -0.56
CEP41-215	ENST00000495702	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		11.53	□□□□□ -0.56
CEP41-215	ENST00000495702	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	11.52	□□□□□ -0.57
CEP41-215	ENST00000495702	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		11.52	□□□□□ -0.57
CEP41-215	ENST00000495702	PRX	Q9BXM0	1461 aa		11.51	□□□□□ -0.57
CEP41-215	ENST00000495702	KIF21B	O75037	1637 aa		11.51	□□□□□ -0.57
CEP41-215	ENST00000495702	CHRDL2	Q6WN34	429 aa		11.49	□□□□□ -0.57
CEP41-215	ENST00000495702	PTPRM	P28827	1452 aa		11.48	□□□□□ -0.57
CEP41-215	ENST00000495702	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		11.47	□□□□□ -0.57
CEP41-215	ENST00000495702	REM2	Q8IYK8	340 aa	Predicted RBP	11.47	□□□□□ -0.57
CEP41-215	ENST00000495702	FBXO3	Q9UK99	471 aa		11.47	□□□□□ -0.57
CEP41-215	ENST00000495702	NEO1	Q92859	1461 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CEP41-215	ENST00000495702	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CEP41-215	ENST00000495702	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CEP41-215	ENST00000495702	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CEP41-215	ENST00000495702	HSPA2	P54652	639 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CEP41-215	ENST00000495702	SPDYE1	Q8NFV5	336 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
CEP41-215	ENST00000495702	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CEP41-215	ENST00000495702	MLEC	Q14165	292 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CEP41-215	ENST00000495702	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	11.39	□□□□□ -0.59
CEP41-215	ENST00000495702	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		11.39	□□□□□ -0.59
CEP41-215	ENST00000495702	AKNA	Q7Z591	1439 aa		11.39	□□□□□ -0.59
CEP41-215	ENST00000495702	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	11.38	□□□□□ -0.59
CEP41-215	ENST00000495702	MADD	Q8WXG6	1647 aa		11.38	□□□□□ -0.59
CEP41-215	ENST00000495702	SAMD9	Q5K651	1589 aa		11.37	□□□□□ -0.59
CEP41-215	ENST00000495702	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		11.37	□□□□□ -0.59
CEP41-215	ENST00000495702	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	11.37	□□□□□ -0.59
CEP41-215	ENST00000495702	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	11.37	□□□□□ -0.59
CEP41-215	ENST00000495702	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		11.36	□□□□□ -0.59
CEP41-215	ENST00000495702	FANCA	O15360	1455 aa		11.36	□□□□□ -0.59
CEP41-215	ENST00000495702	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		11.36	□□□□□ -0.59
CEP41-215	ENST00000495702	CERK	Q8TCT0	537 aa		11.35	□□□□□ -0.59
CEP41-215	ENST00000495702	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		11.35	□□□□□ -0.59
CEP41-215	ENST00000495702	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
CEP41-215	ENST00000495702	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	11.32	□□□□□ -0.6
CEP41-215	ENST00000495702	PITPNM1	O00562	1244 aa		11.32	□□□□□ -0.6
CEP41-215	ENST00000495702	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		11.32	□□□□□ -0.6
CEP41-215	ENST00000495702	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
CEP41-215	ENST00000495702	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		11.31	□□□□□ -0.6
CEP41-215	ENST00000495702	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		11.31	□□□□□ -0.6
CEP41-215	ENST00000495702	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		11.31	□□□□□ -0.6
CEP41-215	ENST00000495702	RICTOR	Q6R327	1708 aa		11.31	□□□□□ -0.6
CEP41-215	ENST00000495702	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CEP41-215	ENST00000495702	EEA1	Q15075	1411 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CEP41-215	ENST00000495702	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
CEP41-215	ENST00000495702	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CEP41-215	ENST00000495702	PLCH2	O75038	1416 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CEP41-215	ENST00000495702	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
CEP41-215	ENST00000495702	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CEP41-215	ENST00000495702	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CEP41-215	ENST00000495702	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CEP41-215	ENST00000495702	ATP10A	O60312	1499 aa		11.27	□□□□□ -0.6
CEP41-215	ENST00000495702	VASP	P50552	380 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
CEP41-215	ENST00000495702	AFAP1	Q8N556	730 aa		11.27	□□□□□ -0.61
CEP41-215	ENST00000495702	HECW1	Q76N89	1606 aa		11.27	□□□□□ -0.61
CEP41-215	ENST00000495702	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CEP41-215	ENST00000495702	SP7	Q8TDD2	431 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
CEP41-215	ENST00000495702	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
CEP41-215	ENST00000495702	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		11.25	□□□□□ -0.61
CEP41-215	ENST00000495702	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		11.24	□□□□□ -0.61
CEP41-215	ENST00000495702	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
CEP41-215	ENST00000495702	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		11.23	□□□□□ -0.61
CEP41-215	ENST00000495702	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		11.22	□□□□□ -0.61
CEP41-215	ENST00000495702	PIP4P2	Q8N4L2	257 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CEP41-215	ENST00000495702	FMN1	Q68DA7	1419 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CEP41-215	ENST00000495702	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CEP41-215	ENST00000495702	PRR29	P0C7W0	189 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CEP41-215	ENST00000495702	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CEP41-215	ENST00000495702	ILDR2	Q71H61	639 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CEP41-215	ENST00000495702	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CEP41-215	ENST00000495702	FXR2	P51116	673 aa	Known RBP eCLIP	11.18	□□□□□ -0.62
CEP41-215	ENST00000495702	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CEP41-215	ENST00000495702	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CEP41-215	ENST00000495702	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CEP41-215	ENST00000495702	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
CEP41-215	ENST00000495702	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CEP41-215	ENST00000495702	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CEP41-215	ENST00000495702	CLIP1	P30622	1438 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CEP41-215	ENST00000495702	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
CEP41-215	ENST00000495702	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CEP41-215	ENST00000495702	KIF14	Q15058	1648 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CEP41-215	ENST00000495702	STRC	Q7RTU9	1775 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CEP41-215	ENST00000495702	SOCS7	O14512	581 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CEP41-215	ENST00000495702	CREBZF	Q9NS37	354 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CEP41-215	ENST00000495702	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
CEP41-215	ENST00000495702	IFNLR1	Q8IU57	520 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
CEP41-215	ENST00000495702	PTPRT	O14522	1441 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CEP41-215	ENST00000495702	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		11.12	□□□□□ -0.63

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