RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493316.5

CFAP74-208, Transcript of cilia and flagella associated protein 74, human

TSL 4

Gene CFAP74, Length 550 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CFAP74-208	ENST00000493316	FANCA	O15360	1455 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CFAP74-208	ENST00000493316	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
CFAP74-208	ENST00000493316	AKNA	Q7Z591	1439 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CFAP74-208	ENST00000493316	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
CFAP74-208	ENST00000493316	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CFAP74-208	ENST00000493316	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CFAP74-208	ENST00000493316	STRC	Q7RTU9	1775 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CFAP74-208	ENST00000493316	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CFAP74-208	ENST00000493316	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CFAP74-208	ENST00000493316	ABCA6	Q8N139	1617 aa		12.77	□□□□□ -0.37
CFAP74-208	ENST00000493316	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CFAP74-208	ENST00000493316	MLEC	Q14165	292 aa		12.75	□□□□□ -0.37
CFAP74-208	ENST00000493316	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		12.75	□□□□□ -0.37
CFAP74-208	ENST00000493316	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		12.75	□□□□□ -0.37
CFAP74-208	ENST00000493316	C3	P01024	1663 aa		12.73	□□□□□ -0.37
CFAP74-208	ENST00000493316	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		12.73	□□□□□ -0.37
CFAP74-208	ENST00000493316	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		12.72	□□□□□ -0.37
CFAP74-208	ENST00000493316	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	12.72	□□□□□ -0.37
CFAP74-208	ENST00000493316	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		12.72	□□□□□ -0.37
CFAP74-208	ENST00000493316	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		12.72	□□□□□ -0.37
CFAP74-208	ENST00000493316	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		12.71	□□□□□ -0.37
CFAP74-208	ENST00000493316	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		12.71	□□□□□ -0.38
CFAP74-208	ENST00000493316	KDM5C	P41229	1560 aa		12.69	□□□□□ -0.38
CFAP74-208	ENST00000493316	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		12.69	□□□□□ -0.38
CFAP74-208	ENST00000493316	FMN1	Q68DA7	1419 aa		12.69	□□□□□ -0.38
CFAP74-208	ENST00000493316	PREX2	Q70Z35	1606 aa		12.69	□□□□□ -0.38
CFAP74-208	ENST00000493316	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		12.68	□□□□□ -0.38
CFAP74-208	ENST00000493316	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	12.68	□□□□□ -0.38
CFAP74-208	ENST00000493316	PLCH2	O75038	1416 aa		12.68	□□□□□ -0.38
CFAP74-208	ENST00000493316	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		12.68	□□□□□ -0.38
CFAP74-208	ENST00000493316	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		12.67	□□□□□ -0.38
CFAP74-208	ENST00000493316	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		12.66	□□□□□ -0.38
CFAP74-208	ENST00000493316	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	12.66	□□□□□ -0.38
CFAP74-208	ENST00000493316	ATP10A	O60312	1499 aa		12.65	□□□□□ -0.38
CFAP74-208	ENST00000493316	PTPRT	O14522	1441 aa		12.65	□□□□□ -0.38
CFAP74-208	ENST00000493316	ABCC1	P33527	1531 aa		12.64	□□□□□ -0.39
CFAP74-208	ENST00000493316	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	12.63	□□□□□ -0.39
CFAP74-208	ENST00000493316	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	12.62	□□□□□ -0.39
CFAP74-208	ENST00000493316	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		12.61	□□□□□ -0.39
CFAP74-208	ENST00000493316	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		12.6	□□□□□ -0.39
CFAP74-208	ENST00000493316	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	12.6	□□□□□ -0.39
CFAP74-208	ENST00000493316	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		12.6	□□□□□ -0.39
CFAP74-208	ENST00000493316	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		12.6	□□□□□ -0.39
CFAP74-208	ENST00000493316	RERE	Q9P2R6	1566 aa		12.6	□□□□□ -0.39
CFAP74-208	ENST00000493316	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	12.59	□□□□□ -0.39
CFAP74-208	ENST00000493316	AFAP1	Q8N556	730 aa		12.59	□□□□□ -0.39
CFAP74-208	ENST00000493316	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		12.58	□□□□□ -0.4
CFAP74-208	ENST00000493316	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		12.57	□□□□□ -0.4
CFAP74-208	ENST00000493316	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		12.57	□□□□□ -0.4
CFAP74-208	ENST00000493316	CLIP1	P30622	1438 aa		12.56	□□□□□ -0.4
CFAP74-208	ENST00000493316	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		12.56	□□□□□ -0.4
CFAP74-208	ENST00000493316	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		12.56	□□□□□ -0.4
CFAP74-208	ENST00000493316	MROH2A	A6NES4	1674 aa		12.55	□□□□□ -0.4
CFAP74-208	ENST00000493316	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		12.55	□□□□□ -0.4
CFAP74-208	ENST00000493316	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	12.54	□□□□□ -0.4
CFAP74-208	ENST00000493316	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	12.54	□□□□□ -0.4
CFAP74-208	ENST00000493316	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	12.53	□□□□□ -0.4
CFAP74-208	ENST00000493316	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		12.53	□□□□□ -0.4
CFAP74-208	ENST00000493316	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		12.53	□□□□□ -0.4
CFAP74-208	ENST00000493316	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		12.53	□□□□□ -0.4
CFAP74-208	ENST00000493316	AGL	P35573	1532 aa		12.52	□□□□□ -0.4
CFAP74-208	ENST00000493316	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		12.51	□□□□□ -0.41
CFAP74-208	ENST00000493316	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		12.51	□□□□□ -0.41
CFAP74-208	ENST00000493316	NCOA1	Q15788	1441 aa		12.5	□□□□□ -0.41
CFAP74-208	ENST00000493316	PLXNC1	O60486	1568 aa		12.5	□□□□□ -0.41
CFAP74-208	ENST00000493316	ATP7A	Q04656	1500 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CFAP74-208	ENST00000493316	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	12.47	□□□□□ -0.41
CFAP74-208	ENST00000493316	CEP162	Q5TB80	1403 aa		12.46	□□□□□ -0.41
CFAP74-208	ENST00000493316	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	12.46	□□□□□ -0.42
CFAP74-208	ENST00000493316	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		12.45	□□□□□ -0.42
CFAP74-208	ENST00000493316	TIAM1	Q13009	1591 aa		12.45	□□□□□ -0.42
CFAP74-208	ENST00000493316	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	12.45	□□□□□ -0.42
CFAP74-208	ENST00000493316	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		12.44	□□□□□ -0.42
CFAP74-208	ENST00000493316	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	12.43	□□□□□ -0.42
CFAP74-208	ENST00000493316	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	12.43	□□□□□ -0.42
CFAP74-208	ENST00000493316	NPAT	Q14207	1427 aa		12.43	□□□□□ -0.42
CFAP74-208	ENST00000493316	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	12.42	□□□□□ -0.42
CFAP74-208	ENST00000493316	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		12.42	□□□□□ -0.42
CFAP74-208	ENST00000493316	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		12.42	□□□□□ -0.42
CFAP74-208	ENST00000493316	PKD2	Q13563	968 aa		12.41	□□□□□ -0.42
CFAP74-208	ENST00000493316	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		12.41	□□□□□ -0.42
CFAP74-208	ENST00000493316	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	12.4	□□□□□ -0.42
CFAP74-208	ENST00000493316	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	12.4	□□□□□ -0.42
CFAP74-208	ENST00000493316	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		12.4	□□□□□ -0.42
CFAP74-208	ENST00000493316	PLA2R1	Q13018	1463 aa		12.4	□□□□□ -0.43
CFAP74-208	ENST00000493316	PTPRK	Q15262	1439 aa		12.39	□□□□□ -0.43
CFAP74-208	ENST00000493316	A2M	P01023	1474 aa		12.39	□□□□□ -0.43
CFAP74-208	ENST00000493316	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	12.39	□□□□□ -0.43
CFAP74-208	ENST00000493316	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	12.39	□□□□□ -0.43
CFAP74-208	ENST00000493316	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		12.38	□□□□□ -0.43
CFAP74-208	ENST00000493316	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	12.38	□□□□□ -0.43
CFAP74-208	ENST00000493316	TOM1	O60784	492 aa		12.37	□□□□□ -0.43
CFAP74-208	ENST00000493316	ZMYM3	Q14202	1370 aa		12.37	□□□□□ -0.43
CFAP74-208	ENST00000493316	ALK	Q9UM73	1620 aa		12.37	□□□□□ -0.43
CFAP74-208	ENST00000493316	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	12.37	□□□□□ -0.43
CFAP74-208	ENST00000493316	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	12.37	□□□□□ -0.43
CFAP74-208	ENST00000493316	CEP152	O94986	1710 aa		12.34	□□□□□ -0.43
CFAP74-208	ENST00000493316	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		12.34	□□□□□ -0.43
CFAP74-208	ENST00000493316	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	12.33	□□□□□ -0.44
CFAP74-208	ENST00000493316	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		12.33	□□□□□ -0.44

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.7 ms