RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489638.5

LTA-216, Transcript of lymphotoxin alpha, humanhuman

TSL 5

Gene LTA, Length 1,377 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTA-216ENST00000489638 MYO5CQ9NQX4 1742 aa21.58■■□□□ 1.04
LTA-216ENST00000489638 KIF14Q15058 1648 aa21.56■■□□□ 1.04
LTA-216ENST00000489638 UBTFP17480 764 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
LTA-216ENST00000489638 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa21.55■■□□□ 1.04
LTA-216ENST00000489638 HSPA2P54652 639 aa21.55■■□□□ 1.04
LTA-216ENST00000489638 EHMT2Q96KQ7 1210 aa21.55■■□□□ 1.04
LTA-216ENST00000489638 PLPPR3Q6T4P5 718 aa21.54■■□□□ 1.04
LTA-216ENST00000489638 ATP10AO60312 1499 aa21.54■■□□□ 1.04
LTA-216ENST00000489638 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa21.54■■□□□ 1.04
LTA-216ENST00000489638 MLECQ14165 292 aa21.53■■□□□ 1.04
LTA-216ENST00000489638 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
LTA-216ENST00000489638 C9orf84Q5VXU9 1444 aa21.53■■□□□ 1.04
LTA-216ENST00000489638 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa21.52■■□□□ 1.04
LTA-216ENST00000489638 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
LTA-216ENST00000489638 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
LTA-216ENST00000489638 KDM5CP41229 1560 aa21.49■■□□□ 1.03
LTA-216ENST00000489638 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa21.49■■□□□ 1.03
LTA-216ENST00000489638 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa21.49■■□□□ 1.03
LTA-216ENST00000489638 ARHGAP5Q13017 1502 aa21.48■■□□□ 1.03
LTA-216ENST00000489638 CLIP1P30622 1438 aa21.46■■□□□ 1.03
LTA-216ENST00000489638 CHIC1Q5VXU3 224 aa21.43■■□□□ 1.02
LTA-216ENST00000489638 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa21.42■■□□□ 1.02
LTA-216ENST00000489638 PREX1Q8TCU6 1659 aa21.42■■□□□ 1.02
LTA-216ENST00000489638 AFAP1Q8N556 730 aa21.42■■□□□ 1.02
LTA-216ENST00000489638 REREQ9P2R6 1566 aa21.41■■□□□ 1.02
LTA-216ENST00000489638 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa21.4■■□□□ 1.02
LTA-216ENST00000489638 PREX2Q70Z35 1606 aa21.39■■□□□ 1.01
LTA-216ENST00000489638 ABCA6Q8N139 1617 aa21.39■■□□□ 1.01
LTA-216ENST00000489638 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
LTA-216ENST00000489638 ABCC1P33527 1531 aa21.38■■□□□ 1.01
LTA-216ENST00000489638 MLH3Q9UHC1 1453 aa21.38■■□□□ 1.01
LTA-216ENST00000489638 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa21.37■■□□□ 1.01
LTA-216ENST00000489638 CCDC18Q5T9S5 1454 aa21.36■■□□□ 1.01
LTA-216ENST00000489638 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa21.35■■□□□ 1.01
LTA-216ENST00000489638 CERKQ8TCT0 537 aa21.35■■□□□ 1.01
LTA-216ENST00000489638 ITSN2Q9NZM3 1697 aa21.34■■□□□ 1.01
LTA-216ENST00000489638 AGLP35573 1532 aa21.33■■□□□ 1
LTA-216ENST00000489638 MYT1LQ9UL68 1186 aa21.32■■□□□ 1
LTA-216ENST00000489638 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa21.31■■□□□ 1
LTA-216ENST00000489638 STRCQ7RTU9 1775 aa21.3■■□□□ 1
LTA-216ENST00000489638 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa21.29■■□□□ 1
LTA-216ENST00000489638 C3P01024 1663 aa21.29■■□□□ 1
LTA-216ENST00000489638 FYCO1Q9BQS8 1478 aa21.28■■□□□ 1
LTA-216ENST00000489638 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa21.28■■□□□ 1
LTA-216ENST00000489638 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
LTA-216ENST00000489638 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa21.24■□□□□ 0.99
LTA-216ENST00000489638 DMRT2Q9Y5R5 561 aa21.23■□□□□ 0.99
LTA-216ENST00000489638 SYCP2Q9BX26 1530 aa21.21■□□□□ 0.99
LTA-216ENST00000489638 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP21.21■□□□□ 0.99
LTA-216ENST00000489638 CNTLNQ9NXG0 1405 aa21.21■□□□□ 0.99
LTA-216ENST00000489638 PTPRTO14522 1441 aa21.19■□□□□ 0.98
LTA-216ENST00000489638 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP21.19■□□□□ 0.98
LTA-216ENST00000489638 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
LTA-216ENST00000489638 MROH2AA6NES4 1674 aa21.15■□□□□ 0.98
LTA-216ENST00000489638 ATP7AQ04656 1500 aa21.14■□□□□ 0.97
LTA-216ENST00000489638 NCOA1Q15788 1441 aa21.14■□□□□ 0.97
LTA-216ENST00000489638 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa21.14■□□□□ 0.97
LTA-216ENST00000489638 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.97
LTA-216ENST00000489638 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
LTA-216ENST00000489638 NPATQ14207 1427 aa21.13■□□□□ 0.97
LTA-216ENST00000489638 PLXNC1O60486 1568 aa21.13■□□□□ 0.97
LTA-216ENST00000489638 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa21.12■□□□□ 0.97
LTA-216ENST00000489638 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP21.11■□□□□ 0.97
LTA-216ENST00000489638 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
LTA-216ENST00000489638 LTBP4Q8N2S1 1624 aa21.11■□□□□ 0.97
LTA-216ENST00000489638 ZMYM3Q14202 1370 aa21.09■□□□□ 0.97
LTA-216ENST00000489638 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
LTA-216ENST00000489638 CCNB3Q8WWL7 1395 aa21.08■□□□□ 0.97
LTA-216ENST00000489638 A2MP01023 1474 aa21.08■□□□□ 0.97
LTA-216ENST00000489638 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa21.07■□□□□ 0.96
LTA-216ENST00000489638 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
LTA-216ENST00000489638 MTUS2Q5JR59 1369 aa21.05■□□□□ 0.96
LTA-216ENST00000489638 MYO3AQ8NEV4 1616 aa21.04■□□□□ 0.96
LTA-216ENST00000489638 TIAM1Q13009 1591 aa21.04■□□□□ 0.96
LTA-216ENST00000489638 IQSEC2Q5JU85 1478 aa21.04■□□□□ 0.96
LTA-216ENST00000489638 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP21.03■□□□□ 0.96
LTA-216ENST00000489638 PTPRKQ15262 1439 aa21.02■□□□□ 0.96
LTA-216ENST00000489638 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa21.01■□□□□ 0.95
LTA-216ENST00000489638 MBD5Q9P267 1494 aa21.01■□□□□ 0.95
LTA-216ENST00000489638 ADGBQ8N7X0 1667 aa21.01■□□□□ 0.95
LTA-216ENST00000489638 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP21■□□□□ 0.95
LTA-216ENST00000489638 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP21■□□□□ 0.95
LTA-216ENST00000489638 PLA2R1Q13018 1463 aa20.99■□□□□ 0.95
LTA-216ENST00000489638 DISP3Q9P2K9 1392 aa20.99■□□□□ 0.95
LTA-216ENST00000489638 GGT6Q6P531 493 aa20.97■□□□□ 0.95
LTA-216ENST00000489638 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa20.97■□□□□ 0.95
LTA-216ENST00000489638 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
LTA-216ENST00000489638 CEP162Q5TB80 1403 aa20.96■□□□□ 0.95
LTA-216ENST00000489638 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa20.94■□□□□ 0.94
LTA-216ENST00000489638 ILDR2Q71H61 639 aa20.94■□□□□ 0.94
LTA-216ENST00000489638 PPP6R1Q9UPN7 881 aa20.94■□□□□ 0.94
LTA-216ENST00000489638 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP20.93■□□□□ 0.94
LTA-216ENST00000489638 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa20.93■□□□□ 0.94
LTA-216ENST00000489638 PKD2Q13563 968 aa20.92■□□□□ 0.94
LTA-216ENST00000489638 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
LTA-216ENST00000489638 A2ML1A8K2U0 1454 aa20.9■□□□□ 0.94
LTA-216ENST00000489638 CCDC141Q6ZP82 1450 aa20.88■□□□□ 0.93
LTA-216ENST00000489638 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
LTA-216ENST00000489638 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa20.87■□□□□ 0.93
LTA-216ENST00000489638 NCOA2Q15596 1464 aa20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.6 ms