RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489581.1

TOP3B-217, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 789 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-217ENST00000489581 SCAPERQ9BY12 1400 aa28.19■■■□□ 2.1
TOP3B-217ENST00000489581 HECW1Q76N89 1606 aa28.19■■■□□ 2.1
TOP3B-217ENST00000489581 MLECQ14165 292 aa28.18■■■□□ 2.1
TOP3B-217ENST00000489581 MAGI2Q86UL8 1455 aa28.17■■■□□ 2.1
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TOP3B-217ENST00000489581 FMN1Q68DA7 1419 aa28.14■■■□□ 2.1
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TOP3B-217ENST00000489581 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP27.41■■□□□ 1.98
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TOP3B-217ENST00000489581 TIAM1Q13009 1591 aa27.37■■□□□ 1.97
TOP3B-217ENST00000489581 ADGBQ8N7X0 1667 aa27.36■■□□□ 1.97
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TOP3B-217ENST00000489581 MYO3AQ8NEV4 1616 aa27.35■■□□□ 1.97
TOP3B-217ENST00000489581 ILDR2Q71H61 639 aa27.34■■□□□ 1.97
TOP3B-217ENST00000489581 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.97
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TOP3B-217ENST00000489581 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa27.32■■□□□ 1.96
TOP3B-217ENST00000489581 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
TOP3B-217ENST00000489581 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP27.31■■□□□ 1.96
TOP3B-217ENST00000489581 PPP6R1Q9UPN7 881 aa27.31■■□□□ 1.96
TOP3B-217ENST00000489581 PKD2Q13563 968 aa27.3■■□□□ 1.96
TOP3B-217ENST00000489581 PLA2R1Q13018 1463 aa27.28■■□□□ 1.96
TOP3B-217ENST00000489581 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa27.27■■□□□ 1.96
TOP3B-217ENST00000489581 CEP162Q5TB80 1403 aa27.27■■□□□ 1.96
TOP3B-217ENST00000489581 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP27.25■■□□□ 1.95
TOP3B-217ENST00000489581 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP27.25■■□□□ 1.95
TOP3B-217ENST00000489581 KIF3BO15066 747 aa27.22■■□□□ 1.95
TOP3B-217ENST00000489581 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa27.22■■□□□ 1.95
TOP3B-217ENST00000489581 UBAP1LF5GYI3 381 aa27.21■■□□□ 1.95
TOP3B-217ENST00000489581 A2ML1A8K2U0 1454 aa27.2■■□□□ 1.95
TOP3B-217ENST00000489581 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP27.19■■□□□ 1.94
TOP3B-217ENST00000489581 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP27.19■■□□□ 1.94
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