RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489581.1

TOP3B-217, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 789 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-217ENST00000489581 SCAPERQ9BY12 1400 aa28.19■■■□□ 2.1
TOP3B-217ENST00000489581 HECW1Q76N89 1606 aa28.19■■■□□ 2.1
TOP3B-217ENST00000489581 MLECQ14165 292 aa28.18■■■□□ 2.1
TOP3B-217ENST00000489581 MAGI2Q86UL8 1455 aa28.17■■■□□ 2.1
TOP3B-217ENST00000489581 HSPA2P54652 639 aa28.15■■■□□ 2.1
TOP3B-217ENST00000489581 FMN1Q68DA7 1419 aa28.14■■■□□ 2.1
TOP3B-217ENST00000489581 MYO5CQ9NQX4 1742 aa28.12■■■□□ 2.09
TOP3B-217ENST00000489581 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa28.12■■■□□ 2.09
TOP3B-217ENST00000489581 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa28.11■■■□□ 2.09
TOP3B-217ENST00000489581 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa28.1■■■□□ 2.09
TOP3B-217ENST00000489581 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
TOP3B-217ENST00000489581 KIF14Q15058 1648 aa28.07■■■□□ 2.08
TOP3B-217ENST00000489581 ATP10AO60312 1499 aa28.06■■■□□ 2.08
TOP3B-217ENST00000489581 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP28.01■■■□□ 2.08
TOP3B-217ENST00000489581 C9orf84Q5VXU9 1444 aa28.01■■■□□ 2.08
TOP3B-217ENST00000489581 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa28.01■■■□□ 2.07
TOP3B-217ENST00000489581 ARHGAP5Q13017 1502 aa27.99■■■□□ 2.07
TOP3B-217ENST00000489581 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa27.98■■■□□ 2.07
TOP3B-217ENST00000489581 AFAP1Q8N556 730 aa27.98■■■□□ 2.07
TOP3B-217ENST00000489581 MYT1LQ9UL68 1186 aa27.97■■■□□ 2.07
TOP3B-217ENST00000489581 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa27.96■■■□□ 2.07
TOP3B-217ENST00000489581 CLIP1P30622 1438 aa27.96■■■□□ 2.07
TOP3B-217ENST00000489581 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP27.96■■■□□ 2.07
TOP3B-217ENST00000489581 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa27.92■■■□□ 2.06
TOP3B-217ENST00000489581 KDM5CP41229 1560 aa27.91■■■□□ 2.06
TOP3B-217ENST00000489581 PREX1Q8TCU6 1659 aa27.89■■■□□ 2.06
TOP3B-217ENST00000489581 CERKQ8TCT0 537 aa27.87■■■□□ 2.05
TOP3B-217ENST00000489581 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP27.87■■■□□ 2.05
TOP3B-217ENST00000489581 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa27.86■■■□□ 2.05
TOP3B-217ENST00000489581 PREX2Q70Z35 1606 aa27.82■■■□□ 2.04
TOP3B-217ENST00000489581 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa27.82■■■□□ 2.04
TOP3B-217ENST00000489581 ABCA6Q8N139 1617 aa27.81■■■□□ 2.04
TOP3B-217ENST00000489581 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa27.81■■■□□ 2.04
TOP3B-217ENST00000489581 MLH3Q9UHC1 1453 aa27.81■■■□□ 2.04
TOP3B-217ENST00000489581 CCDC18Q5T9S5 1454 aa27.8■■■□□ 2.04
TOP3B-217ENST00000489581 REREQ9P2R6 1566 aa27.79■■■□□ 2.04
TOP3B-217ENST00000489581 ABCC1P33527 1531 aa27.78■■■□□ 2.04
TOP3B-217ENST00000489581 STRCQ7RTU9 1775 aa27.78■■■□□ 2.04
TOP3B-217ENST00000489581 ITSN2Q9NZM3 1697 aa27.78■■■□□ 2.04
TOP3B-217ENST00000489581 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa27.77■■■□□ 2.04
TOP3B-217ENST00000489581 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa27.76■■■□□ 2.03
TOP3B-217ENST00000489581 C3P01024 1663 aa27.75■■■□□ 2.03
TOP3B-217ENST00000489581 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP27.74■■■□□ 2.03
TOP3B-217ENST00000489581 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa27.73■■■□□ 2.03
TOP3B-217ENST00000489581 DMRT2Q9Y5R5 561 aa27.72■■■□□ 2.03
TOP3B-217ENST00000489581 AGLP35573 1532 aa27.72■■■□□ 2.03
TOP3B-217ENST00000489581 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP27.71■■■□□ 2.03
TOP3B-217ENST00000489581 FYCO1Q9BQS8 1478 aa27.68■■■□□ 2.02
TOP3B-217ENST00000489581 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa27.64■■■□□ 2.01
TOP3B-217ENST00000489581 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP27.62■■■□□ 2.01
TOP3B-217ENST00000489581 SYCP2Q9BX26 1530 aa27.61■■■□□ 2.01
TOP3B-217ENST00000489581 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP27.61■■■□□ 2.01
TOP3B-217ENST00000489581 CNTLNQ9NXG0 1405 aa27.59■■■□□ 2.01
TOP3B-217ENST00000489581 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP27.59■■■□□ 2.01
TOP3B-217ENST00000489581 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP27.58■■■□□ 2.01
TOP3B-217ENST00000489581 PTPRTO14522 1441 aa27.58■■■□□ 2
TOP3B-217ENST00000489581 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP27.54■■■□□ 2
TOP3B-217ENST00000489581 MROH2AA6NES4 1674 aa27.52■■■□□ 2
TOP3B-217ENST00000489581 ZMYM3Q14202 1370 aa27.51■■□□□ 1.99
TOP3B-217ENST00000489581 CCNB3Q8WWL7 1395 aa27.51■■□□□ 1.99
TOP3B-217ENST00000489581 ATP7AQ04656 1500 aa27.51■■□□□ 1.99
TOP3B-217ENST00000489581 NCOA1Q15788 1441 aa27.5■■□□□ 1.99
TOP3B-217ENST00000489581 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa27.49■■□□□ 1.99
TOP3B-217ENST00000489581 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa27.48■■□□□ 1.99
TOP3B-217ENST00000489581 NPATQ14207 1427 aa27.48■■□□□ 1.99
TOP3B-217ENST00000489581 MTUS2Q5JR59 1369 aa27.48■■□□□ 1.99
TOP3B-217ENST00000489581 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP27.47■■□□□ 1.99
TOP3B-217ENST00000489581 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa27.46■■□□□ 1.99
TOP3B-217ENST00000489581 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP27.46■■□□□ 1.99
TOP3B-217ENST00000489581 LTBP4Q8N2S1 1624 aa27.45■■□□□ 1.99
TOP3B-217ENST00000489581 A2MP01023 1474 aa27.45■■□□□ 1.99
TOP3B-217ENST00000489581 GGT6Q6P531 493 aa27.44■■□□□ 1.98
TOP3B-217ENST00000489581 PLXNC1O60486 1568 aa27.43■■□□□ 1.98
TOP3B-217ENST00000489581 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP27.41■■□□□ 1.98
TOP3B-217ENST00000489581 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa27.41■■□□□ 1.98
TOP3B-217ENST00000489581 DISP3Q9P2K9 1392 aa27.41■■□□□ 1.98
TOP3B-217ENST00000489581 TIAM1Q13009 1591 aa27.37■■□□□ 1.97
TOP3B-217ENST00000489581 ADGBQ8N7X0 1667 aa27.36■■□□□ 1.97
TOP3B-217ENST00000489581 PTPRKQ15262 1439 aa27.35■■□□□ 1.97
TOP3B-217ENST00000489581 MYO3AQ8NEV4 1616 aa27.35■■□□□ 1.97
TOP3B-217ENST00000489581 ILDR2Q71H61 639 aa27.34■■□□□ 1.97
TOP3B-217ENST00000489581 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.97
TOP3B-217ENST00000489581 IQSEC2Q5JU85 1478 aa27.32■■□□□ 1.96
TOP3B-217ENST00000489581 MBD5Q9P267 1494 aa27.32■■□□□ 1.96
TOP3B-217ENST00000489581 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa27.32■■□□□ 1.96
TOP3B-217ENST00000489581 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
TOP3B-217ENST00000489581 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP27.31■■□□□ 1.96
TOP3B-217ENST00000489581 PPP6R1Q9UPN7 881 aa27.31■■□□□ 1.96
TOP3B-217ENST00000489581 PKD2Q13563 968 aa27.3■■□□□ 1.96
TOP3B-217ENST00000489581 PLA2R1Q13018 1463 aa27.28■■□□□ 1.96
TOP3B-217ENST00000489581 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa27.27■■□□□ 1.96
TOP3B-217ENST00000489581 CEP162Q5TB80 1403 aa27.27■■□□□ 1.96
TOP3B-217ENST00000489581 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP27.25■■□□□ 1.95
TOP3B-217ENST00000489581 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP27.25■■□□□ 1.95
TOP3B-217ENST00000489581 KIF3BO15066 747 aa27.22■■□□□ 1.95
TOP3B-217ENST00000489581 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa27.22■■□□□ 1.95
TOP3B-217ENST00000489581 UBAP1LF5GYI3 381 aa27.21■■□□□ 1.95
TOP3B-217ENST00000489581 A2ML1A8K2U0 1454 aa27.2■■□□□ 1.95
TOP3B-217ENST00000489581 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP27.19■■□□□ 1.94
TOP3B-217ENST00000489581 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69 ms