RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489343.5

NPHP3-AS1-201, NPHP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NPHP3-AS1, Length 2,957 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.1■■□□□ 1.13
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 UACAQ9BZF9 1416 aa22.1■■□□□ 1.13
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PTPRGP23470 1445 aa22.08■■□□□ 1.13
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ABCC5O15440 1437 aa22.07■■□□□ 1.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MPHOSPH9Q99550 1183 aa22.07■■□□□ 1.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DAPK1P53355 1430 aa22.06■■□□□ 1.12
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NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MIA2Q96PC5 1412 aa22.02■■□□□ 1.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
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NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
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NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ANP32EQ9BTT0 268 aa21.99■■□□□ 1.11
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NPHP3-AS1-201ENST00000489343 L3MBTL2Q969R5 705 aa21.94■■□□□ 1.1
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NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa21.86■■□□□ 1.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP21.86■■□□□ 1.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PKD2Q13563 968 aa21.85■■□□□ 1.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NCOA1Q15788 1441 aa21.85■■□□□ 1.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BCANQ96GW7 911 aa21.85■■□□□ 1.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TSPY4P0CV99 314 aa21.84■■□□□ 1.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TSPY10P0CW01 314 aa21.84■■□□□ 1.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NBPF8Q3BBV2 869 aa21.83■■□□□ 1.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ABCC10Q5T3U5 1492 aa21.82■■□□□ 1.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KDM5BQ9UGL1 1544 aa21.8■■□□□ 1.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ITSN2Q9NZM3 1697 aa21.8■■□□□ 1.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 POLR3GLQ9BT43 218 aa21.79■■□□□ 1.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa21.79■■□□□ 1.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ROCK1Q13464 1354 aa21.78■■□□□ 1.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NUP155O75694 1391 aa21.78■■□□□ 1.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C9orf84Q5VXU9 1444 aa21.78■■□□□ 1.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa21.77■■□□□ 1.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa21.77■■□□□ 1.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa21.77■■□□□ 1.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa21.77■■□□□ 1.07
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NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
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NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa21.69■■□□□ 1.06
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NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa21.68■■□□□ 1.06
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NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MBD5Q9P267 1494 aa21.65■■□□□ 1.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ABCC2Q92887 1545 aa21.65■■□□□ 1.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ADGBQ8N7X0 1667 aa21.65■■□□□ 1.06
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NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa21.59■■□□□ 1.05
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NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa21.59■■□□□ 1.05
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NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TEX14Q8IWB6 1497 aa21.59■■□□□ 1.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CCDC141Q6ZP82 1450 aa21.58■■□□□ 1.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PREX2Q70Z35 1606 aa21.58■■□□□ 1.04
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NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa21.55■■□□□ 1.04
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NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa21.53■■□□□ 1.04
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NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OSCARQ8IYS5 282 aa21.5■■□□□ 1.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MYO5CQ9NQX4 1742 aa21.5■■□□□ 1.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CCER2I3L3R5 266 aa21.47■■□□□ 1.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP21.47■■□□□ 1.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SHANK2Q9UPX8 1470 aa21.47■■□□□ 1.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KIF7Q2M1P5 1343 aa21.47■■□□□ 1.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CARD11Q9BXL7 1154 aa21.45■■□□□ 1.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PLCH2O75038 1416 aa21.45■■□□□ 1.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ARHGEF5Q12774 1597 aa21.44■■□□□ 1.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FAM135AQ9P2D6 1515 aa21.43■■□□□ 1.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CCDC7Q96M83 1385 aa21.43■■□□□ 1.02
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