RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484918.1

MRPL23-209, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L23, human

TSL 5

Gene MRPL23, Length 232 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL23-209	ENST00000484918	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		12.23	□□□□□ -0.45
MRPL23-209	ENST00000484918	C3	P01024	1663 aa		12.22	□□□□□ -0.45
MRPL23-209	ENST00000484918	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		12.22	□□□□□ -0.45
MRPL23-209	ENST00000484918	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		12.21	□□□□□ -0.45
MRPL23-209	ENST00000484918	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	12.19	□□□□□ -0.46
MRPL23-209	ENST00000484918	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		12.18	□□□□□ -0.46
MRPL23-209	ENST00000484918	ABCA8	O94911	1581 aa		12.17	□□□□□ -0.46
MRPL23-209	ENST00000484918	CPS1	P31327	1500 aa		12.16	□□□□□ -0.46
MRPL23-209	ENST00000484918	PTPRK	Q15262	1439 aa		12.15	□□□□□ -0.46
MRPL23-209	ENST00000484918	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		12.14	□□□□□ -0.47
MRPL23-209	ENST00000484918	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		12.14	□□□□□ -0.47
MRPL23-209	ENST00000484918	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		12.14	□□□□□ -0.47
MRPL23-209	ENST00000484918	IGF1R	P08069	1367 aa		12.14	□□□□□ -0.47
MRPL23-209	ENST00000484918	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	12.14	□□□□□ -0.47
MRPL23-209	ENST00000484918	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	12.13	□□□□□ -0.47
MRPL23-209	ENST00000484918	HECW1	Q76N89	1606 aa		12.11	□□□□□ -0.47
MRPL23-209	ENST00000484918	PLA2R1	Q13018	1463 aa		12.11	□□□□□ -0.47
MRPL23-209	ENST00000484918	PKD2	Q13563	968 aa		12.09	□□□□□ -0.47
MRPL23-209	ENST00000484918	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		12.08	□□□□□ -0.47
MRPL23-209	ENST00000484918	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		12.08	□□□□□ -0.48
MRPL23-209	ENST00000484918	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		12.08	□□□□□ -0.48
MRPL23-209	ENST00000484918	ATP10A	O60312	1499 aa		12.08	□□□□□ -0.48
MRPL23-209	ENST00000484918	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		12.07	□□□□□ -0.48
MRPL23-209	ENST00000484918	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	12.06	□□□□□ -0.48
MRPL23-209	ENST00000484918	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	12.06	□□□□□ -0.48
MRPL23-209	ENST00000484918	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		12.06	□□□□□ -0.48
MRPL23-209	ENST00000484918	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		12.03	□□□□□ -0.48
MRPL23-209	ENST00000484918	ATP10B	O94823	1461 aa		12.02	□□□□□ -0.48
MRPL23-209	ENST00000484918	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		12.02	□□□□□ -0.48
MRPL23-209	ENST00000484918	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		12.01	□□□□□ -0.49
MRPL23-209	ENST00000484918	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
MRPL23-209	ENST00000484918	NPAT	Q14207	1427 aa		12	□□□□□ -0.49
MRPL23-209	ENST00000484918	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
MRPL23-209	ENST00000484918	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		11.99	□□□□□ -0.49
MRPL23-209	ENST00000484918	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		11.98	□□□□□ -0.49
MRPL23-209	ENST00000484918	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		11.98	□□□□□ -0.49
MRPL23-209	ENST00000484918	TRIM52	Q96A61	297 aa		11.98	□□□□□ -0.49
MRPL23-209	ENST00000484918	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
MRPL23-209	ENST00000484918	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
MRPL23-209	ENST00000484918	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		11.96	□□□□□ -0.49
MRPL23-209	ENST00000484918	AGL	P35573	1532 aa		11.95	□□□□□ -0.5
MRPL23-209	ENST00000484918	RERE	Q9P2R6	1566 aa		11.94	□□□□□ -0.5
MRPL23-209	ENST00000484918	MROH2A	A6NES4	1674 aa		11.94	□□□□□ -0.5
MRPL23-209	ENST00000484918	LRP5	O75197	1615 aa		11.93	□□□□□ -0.5
MRPL23-209	ENST00000484918	ZRANB1	Q9UGI0	708 aa		11.93	□□□□□ -0.5
MRPL23-209	ENST00000484918	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
MRPL23-209	ENST00000484918	ARID3C	A6NKF2	412 aa		11.92	□□□□□ -0.5
MRPL23-209	ENST00000484918	KIF27	Q86VH2	1401 aa		11.91	□□□□□ -0.5
MRPL23-209	ENST00000484918	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	11.91	□□□□□ -0.5
MRPL23-209	ENST00000484918	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		11.9	□□□□□ -0.5
MRPL23-209	ENST00000484918	SYNM	O15061	1565 aa		11.89	□□□□□ -0.51
MRPL23-209	ENST00000484918	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		11.89	□□□□□ -0.51
MRPL23-209	ENST00000484918	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		11.88	□□□□□ -0.51
MRPL23-209	ENST00000484918	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		11.88	□□□□□ -0.51
MRPL23-209	ENST00000484918	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		11.87	□□□□□ -0.51
MRPL23-209	ENST00000484918	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	11.87	□□□□□ -0.51
MRPL23-209	ENST00000484918	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	11.86	□□□□□ -0.51
MRPL23-209	ENST00000484918	GOLGA3	Q08378	1498 aa		11.84	□□□□□ -0.51
MRPL23-209	ENST00000484918	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	11.84	□□□□□ -0.51
MRPL23-209	ENST00000484918	ABCA6	Q8N139	1617 aa		11.84	□□□□□ -0.51
MRPL23-209	ENST00000484918	LRP6	O75581	1613 aa		11.83	□□□□□ -0.52
MRPL23-209	ENST00000484918	RXRB	P28702	533 aa		11.83	□□□□□ -0.52
MRPL23-209	ENST00000484918	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	11.83	□□□□□ -0.52
MRPL23-209	ENST00000484918	KDM5C	P41229	1560 aa		11.83	□□□□□ -0.52
MRPL23-209	ENST00000484918	ZMYM3	Q14202	1370 aa		11.82	□□□□□ -0.52
MRPL23-209	ENST00000484918	FOXD1	Q16676	465 aa		11.82	□□□□□ -0.52
MRPL23-209	ENST00000484918	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		11.81	□□□□□ -0.52
MRPL23-209	ENST00000484918	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	11.81	□□□□□ -0.52
MRPL23-209	ENST00000484918	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		11.81	□□□□□ -0.52
MRPL23-209	ENST00000484918	RGS12	O14924	1447 aa		11.8	□□□□□ -0.52
MRPL23-209	ENST00000484918	YY1	P25490	414 aa		11.8	□□□□□ -0.52
MRPL23-209	ENST00000484918	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		11.79	□□□□□ -0.52
MRPL23-209	ENST00000484918	MED14	O60244	1454 aa		11.78	□□□□□ -0.52
MRPL23-209	ENST00000484918	DEPDC5	O75140	1603 aa		11.76	□□□□□ -0.53
MRPL23-209	ENST00000484918	JCAD	Q9P266	1359 aa		11.76	□□□□□ -0.53
MRPL23-209	ENST00000484918	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		11.76	□□□□□ -0.53
MRPL23-209	ENST00000484918	IQGAP1	P46940	1657 aa		11.75	□□□□□ -0.53
MRPL23-209	ENST00000484918	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
MRPL23-209	ENST00000484918	PHLPP1	O60346	1717 aa		11.75	□□□□□ -0.53
MRPL23-209	ENST00000484918	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		11.74	□□□□□ -0.53
MRPL23-209	ENST00000484918	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
MRPL23-209	ENST00000484918	EP400	Q96L91	3159 aa		11.74	□□□□□ -0.53
MRPL23-209	ENST00000484918	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		11.73	□□□□□ -0.53
MRPL23-209	ENST00000484918	PLCH2	O75038	1416 aa		11.72	□□□□□ -0.53
MRPL23-209	ENST00000484918	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	11.72	□□□□□ -0.53
MRPL23-209	ENST00000484918	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.54
MRPL23-209	ENST00000484918	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
MRPL23-209	ENST00000484918	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		11.7	□□□□□ -0.54
MRPL23-209	ENST00000484918	ATAD2	Q6PL18	1390 aa		11.7	□□□□□ -0.54
MRPL23-209	ENST00000484918	AFAP1	Q8N556	730 aa		11.7	□□□□□ -0.54
MRPL23-209	ENST00000484918	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
MRPL23-209	ENST00000484918	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
MRPL23-209	ENST00000484918	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
MRPL23-209	ENST00000484918	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
MRPL23-209	ENST00000484918	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
MRPL23-209	ENST00000484918	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		11.68	□□□□□ -0.54
MRPL23-209	ENST00000484918	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
MRPL23-209	ENST00000484918	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
MRPL23-209	ENST00000484918	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		11.68	□□□□□ -0.54
MRPL23-209	ENST00000484918	ABCC1	P33527	1531 aa		11.68	□□□□□ -0.54

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