RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483092.1

CCSAP-204, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCSAP, Length 3,492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-204ENST00000483092 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP22.17■■□□□ 1.14
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
CCSAP-204ENST00000483092 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa22.17■■□□□ 1.14
CCSAP-204ENST00000483092 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
CCSAP-204ENST00000483092 POLR3GLQ9BT43 218 aa22.16■■□□□ 1.14
CCSAP-204ENST00000483092 MPHOSPH9Q99550 1183 aa22.16■■□□□ 1.14
CCSAP-204ENST00000483092 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
CCSAP-204ENST00000483092 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
CCSAP-204ENST00000483092 IQGAP2Q13576 1575 aa22.15■■□□□ 1.14
CCSAP-204ENST00000483092 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.15■■□□□ 1.14
CCSAP-204ENST00000483092 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
CCSAP-204ENST00000483092 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.14■■□□□ 1.13
CCSAP-204ENST00000483092 IL27Q8NEV9 243 aa22.13■■□□□ 1.13
CCSAP-204ENST00000483092 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
CCSAP-204ENST00000483092 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
CCSAP-204ENST00000483092 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
CCSAP-204ENST00000483092 L3MBTL2Q969R5 705 aa22.1■■□□□ 1.13
CCSAP-204ENST00000483092 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
CCSAP-204ENST00000483092 PBRM1Q86U86 1689 aa22.09■■□□□ 1.13
CCSAP-204ENST00000483092 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
CCSAP-204ENST00000483092 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.08■■□□□ 1.13
CCSAP-204ENST00000483092 ADAMTS12P58397 1594 aa22.05■■□□□ 1.12
CCSAP-204ENST00000483092 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
CCSAP-204ENST00000483092 HECW1Q76N89 1606 aa22.04■■□□□ 1.12
CCSAP-204ENST00000483092 KDM6BO15054 1643 aa22.02■■□□□ 1.12
CCSAP-204ENST00000483092 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
CCSAP-204ENST00000483092 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP22.01■■□□□ 1.115e-7■□□□□ 10.7
CCSAP-204ENST00000483092 MRS2Q9HD23 443 aa22.01■■□□□ 1.11
CCSAP-204ENST00000483092 IFT140Q96RY7 1462 aa22■■□□□ 1.11
CCSAP-204ENST00000483092 JPH4Q96JJ6 628 aa22■■□□□ 1.11
CCSAP-204ENST00000483092 WASHC2AQ641Q2 1341 aa21.97■■□□□ 1.11
CCSAP-204ENST00000483092 PLB1Q6P1J6 1458 aa21.97■■□□□ 1.11
CCSAP-204ENST00000483092 WDR62O43379 1518 aa21.95■■□□□ 1.1
CCSAP-204ENST00000483092 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa21.95■■□□□ 1.1
CCSAP-204ENST00000483092 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
CCSAP-204ENST00000483092 NBPF8Q3BBV2 869 aa21.94■■□□□ 1.1
CCSAP-204ENST00000483092 CCDC184Q52MB2 194 aa21.94■■□□□ 1.1
CCSAP-204ENST00000483092 GRIN2AQ12879 1464 aa21.94■■□□□ 1.1
CCSAP-204ENST00000483092 DISP1Q96F81 1524 aa21.94■■□□□ 1.1
CCSAP-204ENST00000483092 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
CCSAP-204ENST00000483092 DAPK1P53355 1430 aa21.91■■□□□ 1.1
CCSAP-204ENST00000483092 NEFMP07197 916 aa21.91■■□□□ 1.1
CCSAP-204ENST00000483092 PLEKHD1A6NEE1 506 aa21.9■■□□□ 1.1
CCSAP-204ENST00000483092 ABCC5O15440 1437 aa21.9■■□□□ 1.1
CCSAP-204ENST00000483092 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
CCSAP-204ENST00000483092 ARHGEF11O15085 1522 aa21.9■■□□□ 1.1
CCSAP-204ENST00000483092 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
CCSAP-204ENST00000483092 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa21.89■■□□□ 1.1
CCSAP-204ENST00000483092 MIA2Q96PC5 1412 aa21.89■■□□□ 1.09
CCSAP-204ENST00000483092 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
CCSAP-204ENST00000483092 PKD2Q13563 968 aa21.88■■□□□ 1.09
CCSAP-204ENST00000483092 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
CCSAP-204ENST00000483092 KIAA0556O60303 1618 aa21.86■■□□□ 1.09
CCSAP-204ENST00000483092 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP21.85■■□□□ 1.095e-7■■□□□ 13.3
CCSAP-204ENST00000483092 ERICH6BQ5W0A0 696 aa21.83■■□□□ 1.08
CCSAP-204ENST00000483092 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa21.79■■□□□ 1.08
CCSAP-204ENST00000483092 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa21.79■■□□□ 1.08
CCSAP-204ENST00000483092 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP21.79■■□□□ 1.08
CCSAP-204ENST00000483092 KDM5BQ9UGL1 1544 aa21.79■■□□□ 1.08
CCSAP-204ENST00000483092 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa21.79■■□□□ 1.08
CCSAP-204ENST00000483092 TSPY4P0CV99 314 aa21.78■■□□□ 1.08
CCSAP-204ENST00000483092 TSPY10P0CW01 314 aa21.78■■□□□ 1.08
CCSAP-204ENST00000483092 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
CCSAP-204ENST00000483092 CEP170Q5SW79 1584 aa21.75■■□□□ 1.07
CCSAP-204ENST00000483092 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa21.75■■□□□ 1.07
CCSAP-204ENST00000483092 SYNJ2O15056 1496 aa21.74■■□□□ 1.07
CCSAP-204ENST00000483092 NUP155O75694 1391 aa21.74■■□□□ 1.07
CCSAP-204ENST00000483092 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
CCSAP-204ENST00000483092 GCC2Q8IWJ2 1684 aa21.73■■□□□ 1.07
CCSAP-204ENST00000483092 RGL3Q3MIN7 710 aa21.72■■□□□ 1.07
CCSAP-204ENST00000483092 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
CCSAP-204ENST00000483092 KIF14Q15058 1648 aa21.72■■□□□ 1.07
CCSAP-204ENST00000483092 KIF7Q2M1P5 1343 aa21.72■■□□□ 1.07
CCSAP-204ENST00000483092 CCDC7Q96M83 1385 aa21.71■■□□□ 1.07
CCSAP-204ENST00000483092 AKNAQ7Z591 1439 aa21.71■■□□□ 1.07
CCSAP-204ENST00000483092 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
CCSAP-204ENST00000483092 BRPF3Q9ULD4 1205 aa21.7■■□□□ 1.06
CCSAP-204ENST00000483092 NCOA1Q15788 1441 aa21.7■■□□□ 1.06
CCSAP-204ENST00000483092 ROCK1Q13464 1354 aa21.7■■□□□ 1.06
CCSAP-204ENST00000483092 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa21.69■■□□□ 1.06
CCSAP-204ENST00000483092 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
CCSAP-204ENST00000483092 DCAF11Q8TEB1 546 aa21.68■■□□□ 1.06
CCSAP-204ENST00000483092 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
CCSAP-204ENST00000483092 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
CCSAP-204ENST00000483092 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa21.66■■□□□ 1.06
CCSAP-204ENST00000483092 CARD11Q9BXL7 1154 aa21.65■■□□□ 1.06
CCSAP-204ENST00000483092 CNTLNQ9NXG0 1405 aa21.64■■□□□ 1.06
CCSAP-204ENST00000483092 PTPRGP23470 1445 aa21.63■■□□□ 1.05
CCSAP-204ENST00000483092 PZPP20742 1482 aa21.61■■□□□ 1.05
CCSAP-204ENST00000483092 ATP10BO94823 1461 aa21.61■■□□□ 1.05
CCSAP-204ENST00000483092 SLC4A3P48751 1232 aa21.6■■□□□ 1.05
CCSAP-204ENST00000483092 ZBED9Q6R2W3 1325 aa21.6■■□□□ 1.05
CCSAP-204ENST00000483092 USP47Q96K76 1375 aa21.59■■□□□ 1.05
CCSAP-204ENST00000483092 TEX14Q8IWB6 1497 aa21.59■■□□□ 1.05
CCSAP-204ENST00000483092 C9orf84Q5VXU9 1444 aa21.57■■□□□ 1.04
CCSAP-204ENST00000483092 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa21.57■■□□□ 1.04
CCSAP-204ENST00000483092 KIF15Q9NS87 1388 aa21.57■■□□□ 1.04
CCSAP-204ENST00000483092 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa21.56■■□□□ 1.04
CCSAP-204ENST00000483092 NUP160Q12769 1436 aa21.56■■□□□ 1.04
CCSAP-204ENST00000483092 ARXQ96QS3 562 aa21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.4 ms