RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482785.1

SHQ1-208, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 3

Gene SHQ1, Length 502 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SHQ1-208ENST00000482785 PREX1Q8TCU6 1659 aa7.4□□□□□ -1.23
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SHQ1-208ENST00000482785 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
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SHQ1-208ENST00000482785 EP400Q96L91 3159 aa7.08□□□□□ -1.28
SHQ1-208ENST00000482785 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa7.07□□□□□ -1.28
SHQ1-208ENST00000482785 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
SHQ1-208ENST00000482785 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
SHQ1-208ENST00000482785 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
SHQ1-208ENST00000482785 ERICH6Q7L0X2 663 aa7.07□□□□□ -1.28
SHQ1-208ENST00000482785 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
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