RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482401.6

CAPN8-209, Transcript of calpain 8, humanhuman

TSL 2

Gene CAPN8, Length 1,023 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN8-209ENST00000482401 LMTK3Q96Q04 1460 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPN8-209ENST00000482401 YEATS2Q9ULM3 1422 aa22.83■■□□□ 1.25
CAPN8-209ENST00000482401 EHMT2Q96KQ7 1210 aa22.83■■□□□ 1.25
CAPN8-209ENST00000482401 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.79■■□□□ 1.24
CAPN8-209ENST00000482401 MLECQ14165 292 aa22.79■■□□□ 1.24
CAPN8-209ENST00000482401 PLPPR3Q6T4P5 718 aa22.78■■□□□ 1.24
CAPN8-209ENST00000482401 ATP10AO60312 1499 aa22.78■■□□□ 1.24
CAPN8-209ENST00000482401 MYO5CQ9NQX4 1742 aa22.77■■□□□ 1.24
CAPN8-209ENST00000482401 CLIP1P30622 1438 aa22.77■■□□□ 1.24
CAPN8-209ENST00000482401 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
CAPN8-209ENST00000482401 KIF14Q15058 1648 aa22.75■■□□□ 1.23
CAPN8-209ENST00000482401 C9orf84Q5VXU9 1444 aa22.74■■□□□ 1.23
CAPN8-209ENST00000482401 CHIC1Q5VXU3 224 aa22.74■■□□□ 1.23
CAPN8-209ENST00000482401 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa22.73■■□□□ 1.23
CAPN8-209ENST00000482401 HSPA2P54652 639 aa22.72■■□□□ 1.23
CAPN8-209ENST00000482401 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa22.71■■□□□ 1.23
CAPN8-209ENST00000482401 ARHGAP5Q13017 1502 aa22.71■■□□□ 1.23
CAPN8-209ENST00000482401 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa22.71■■□□□ 1.23
CAPN8-209ENST00000482401 MYT1LQ9UL68 1186 aa22.7■■□□□ 1.22
CAPN8-209ENST00000482401 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa22.68■■□□□ 1.22
CAPN8-209ENST00000482401 AFAP1Q8N556 730 aa22.68■■□□□ 1.22
CAPN8-209ENST00000482401 KDM5CP41229 1560 aa22.63■■□□□ 1.21
CAPN8-209ENST00000482401 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.63■■□□□ 1.21
CAPN8-209ENST00000482401 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.62■■□□□ 1.21
CAPN8-209ENST00000482401 DMRT2Q9Y5R5 561 aa22.59■■□□□ 1.21
CAPN8-209ENST00000482401 MLH3Q9UHC1 1453 aa22.59■■□□□ 1.21
CAPN8-209ENST00000482401 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
CAPN8-209ENST00000482401 CERKQ8TCT0 537 aa22.58■■□□□ 1.21
CAPN8-209ENST00000482401 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
CAPN8-209ENST00000482401 REREQ9P2R6 1566 aa22.58■■□□□ 1.2
CAPN8-209ENST00000482401 PREX1Q8TCU6 1659 aa22.58■■□□□ 1.2
CAPN8-209ENST00000482401 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.57■■□□□ 1.2
CAPN8-209ENST00000482401 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa22.57■■□□□ 1.2
CAPN8-209ENST00000482401 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa22.55■■□□□ 1.2
CAPN8-209ENST00000482401 PREX2Q70Z35 1606 aa22.54■■□□□ 1.2
CAPN8-209ENST00000482401 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa22.54■■□□□ 1.2
CAPN8-209ENST00000482401 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
CAPN8-209ENST00000482401 ABCC1P33527 1531 aa22.52■■□□□ 1.2
CAPN8-209ENST00000482401 AGLP35573 1532 aa22.52■■□□□ 1.19
CAPN8-209ENST00000482401 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa22.51■■□□□ 1.19
CAPN8-209ENST00000482401 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.51■■□□□ 1.19
CAPN8-209ENST00000482401 ABCA6Q8N139 1617 aa22.49■■□□□ 1.19
CAPN8-209ENST00000482401 ITSN2Q9NZM3 1697 aa22.48■■□□□ 1.19
CAPN8-209ENST00000482401 CNTLNQ9NXG0 1405 aa22.46■■□□□ 1.19
CAPN8-209ENST00000482401 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
CAPN8-209ENST00000482401 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa22.45■■□□□ 1.18
CAPN8-209ENST00000482401 C3P01024 1663 aa22.42■■□□□ 1.18
CAPN8-209ENST00000482401 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
CAPN8-209ENST00000482401 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa22.42■■□□□ 1.18
CAPN8-209ENST00000482401 STRCQ7RTU9 1775 aa22.41■■□□□ 1.18
CAPN8-209ENST00000482401 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
CAPN8-209ENST00000482401 PTPRTO14522 1441 aa22.4■■□□□ 1.18
CAPN8-209ENST00000482401 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa22.39■■□□□ 1.18
CAPN8-209ENST00000482401 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
CAPN8-209ENST00000482401 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa22.39■■□□□ 1.17
CAPN8-209ENST00000482401 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP22.38■■□□□ 1.17
CAPN8-209ENST00000482401 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa22.38■■□□□ 1.17
CAPN8-209ENST00000482401 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.37■■□□□ 1.17
CAPN8-209ENST00000482401 SYCP2Q9BX26 1530 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPN8-209ENST00000482401 NPATQ14207 1427 aa22.34■■□□□ 1.17
CAPN8-209ENST00000482401 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.34■■□□□ 1.17
CAPN8-209ENST00000482401 ZMYM3Q14202 1370 aa22.33■■□□□ 1.17
CAPN8-209ENST00000482401 MROH2AA6NES4 1674 aa22.32■■□□□ 1.16
CAPN8-209ENST00000482401 ATP7AQ04656 1500 aa22.31■■□□□ 1.16
CAPN8-209ENST00000482401 PPP6R1Q9UPN7 881 aa22.3■■□□□ 1.16
CAPN8-209ENST00000482401 NCOA1Q15788 1441 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPN8-209ENST00000482401 A2MP01023 1474 aa22.28■■□□□ 1.16
CAPN8-209ENST00000482401 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
CAPN8-209ENST00000482401 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
CAPN8-209ENST00000482401 GGT6Q6P531 493 aa22.25■■□□□ 1.15
CAPN8-209ENST00000482401 PLXNC1O60486 1568 aa22.24■■□□□ 1.15
CAPN8-209ENST00000482401 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa22.23■■□□□ 1.15
CAPN8-209ENST00000482401 IQSEC2Q5JU85 1478 aa22.22■■□□□ 1.15
CAPN8-209ENST00000482401 PKD2Q13563 968 aa22.21■■□□□ 1.15
CAPN8-209ENST00000482401 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.15
CAPN8-209ENST00000482401 LTBP4Q8N2S1 1624 aa22.2■■□□□ 1.14
CAPN8-209ENST00000482401 ADGBQ8N7X0 1667 aa22.2■■□□□ 1.14
CAPN8-209ENST00000482401 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa22.19■■□□□ 1.14
CAPN8-209ENST00000482401 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.19■■□□□ 1.14
CAPN8-209ENST00000482401 CEP162Q5TB80 1403 aa22.18■■□□□ 1.14
CAPN8-209ENST00000482401 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
CAPN8-209ENST00000482401 TIAM1Q13009 1591 aa22.17■■□□□ 1.14
CAPN8-209ENST00000482401 PTPRKQ15262 1439 aa22.17■■□□□ 1.14
CAPN8-209ENST00000482401 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa22.17■■□□□ 1.14
CAPN8-209ENST00000482401 MBD5Q9P267 1494 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPN8-209ENST00000482401 DISP3Q9P2K9 1392 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPN8-209ENST00000482401 RSPH4AQ5TD94 716 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPN8-209ENST00000482401 PLA2R1Q13018 1463 aa22.15■■□□□ 1.14
CAPN8-209ENST00000482401 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
CAPN8-209ENST00000482401 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
CAPN8-209ENST00000482401 MYO3AQ8NEV4 1616 aa22.13■■□□□ 1.13
CAPN8-209ENST00000482401 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
CAPN8-209ENST00000482401 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
CAPN8-209ENST00000482401 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
CAPN8-209ENST00000482401 KIF3BO15066 747 aa22.08■■□□□ 1.13
CAPN8-209ENST00000482401 A2ML1A8K2U0 1454 aa22.08■■□□□ 1.12
CAPN8-209ENST00000482401 CCDC141Q6ZP82 1450 aa22.08■■□□□ 1.12
CAPN8-209ENST00000482401 FAM135AQ9P2D6 1515 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPN8-209ENST00000482401 TSPY4P0CV99 314 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPN8-209ENST00000482401 TSPY10P0CW01 314 aa22.06■■□□□ 1.12
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