RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480883.1

LAMC3-204, Transcript of laminin subunit gamma 3, humanhuman

TSL 5

Gene LAMC3, Length 1,903 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC3-204ENST00000480883 SETD5Q9C0A6 1442 aa36.45■■■■□ 3.42
LAMC3-204ENST00000480883 WDR7Q9Y4E6 1490 aa36.44■■■■□ 3.42
LAMC3-204ENST00000480883 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa36.42■■■■□ 3.42
LAMC3-204ENST00000480883 PTPRKQ15262 1439 aa36.42■■■■□ 3.42
LAMC3-204ENST00000480883 ASXL2Q76L83 1435 aa36.4■■■■□ 3.42
LAMC3-204ENST00000480883 TTC37Q6PGP7 1564 aa36.4■■■■□ 3.42
LAMC3-204ENST00000480883 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP36.37■■■■□ 3.41
LAMC3-204ENST00000480883 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa36.37■■■■□ 3.41
LAMC3-204ENST00000480883 PREX2Q70Z35 1606 aa36.32■■■■□ 3.4
LAMC3-204ENST00000480883 MAPKBP1O60336 1514 aa36.28■■■■□ 3.4
LAMC3-204ENST00000480883 DAPK1P53355 1430 aa36.27■■■■□ 3.4
LAMC3-204ENST00000480883 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa36.27■■■■□ 3.4
LAMC3-204ENST00000480883 ABCC5O15440 1437 aa36.27■■■■□ 3.4
LAMC3-204ENST00000480883 PLCH2O75038 1416 aa36.26■■■■□ 3.39
LAMC3-204ENST00000480883 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP36.25■■■■□ 3.39
LAMC3-204ENST00000480883 MYO5CQ9NQX4 1742 aa36.23■■■■□ 3.39
LAMC3-204ENST00000480883 ARHGAP5Q13017 1502 aa36.23■■■■□ 3.39
LAMC3-204ENST00000480883 HFM1A2PYH4 1435 aa36.22■■■■□ 3.39
LAMC3-204ENST00000480883 CHIC2Q9UKJ5 165 aa36.22■■■■□ 3.39
LAMC3-204ENST00000480883 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa36.17■■■■□ 3.38
LAMC3-204ENST00000480883 ABCA9Q8IUA7 1624 aa36.17■■■■□ 3.38
LAMC3-204ENST00000480883 NAIPQ13075 1403 aa36.15■■■■□ 3.38
LAMC3-204ENST00000480883 AKNAQ7Z591 1439 aa36.14■■■■□ 3.38
LAMC3-204ENST00000480883 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa36.14■■■■□ 3.38
LAMC3-204ENST00000480883 ARAP3Q8WWN8 1544 aa36.13■■■■□ 3.37
LAMC3-204ENST00000480883 MBD5Q9P267 1494 aa36.13■■■■□ 3.37
LAMC3-204ENST00000480883 ROCK1Q13464 1354 aa36.12■■■■□ 3.37
LAMC3-204ENST00000480883 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP36.12■■■■□ 3.37
LAMC3-204ENST00000480883 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa36.11■■■■□ 3.37
LAMC3-204ENST00000480883 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa36.07■■■■□ 3.37
LAMC3-204ENST00000480883 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa36.07■■■■□ 3.36
LAMC3-204ENST00000480883 ARHGEF5Q12774 1597 aa36.07■■■■□ 3.36
LAMC3-204ENST00000480883 RSPH4AQ5TD94 716 aa36.06■■■■□ 3.36
LAMC3-204ENST00000480883 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP36.06■■■■□ 3.36
LAMC3-204ENST00000480883 SYCP2Q9BX26 1530 aa36.03■■■■□ 3.36
LAMC3-204ENST00000480883 CROCC2H7BZ55 1655 aa36.03■■■■□ 3.36
LAMC3-204ENST00000480883 SHANK2Q9UPX8 1470 aa36.02■■■■□ 3.36
LAMC3-204ENST00000480883 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP36.02■■■■□ 3.36
LAMC3-204ENST00000480883 CCDC141Q6ZP82 1450 aa36.01■■■■□ 3.36
LAMC3-204ENST00000480883 TSPY4P0CV99 314 aa36.01■■■■□ 3.36
LAMC3-204ENST00000480883 TSPY10P0CW01 314 aa36.01■■■■□ 3.36
LAMC3-204ENST00000480883 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP36.01■■■■□ 3.36
LAMC3-204ENST00000480883 NCOA1Q15788 1441 aa36■■■■□ 3.35
LAMC3-204ENST00000480883 ADGRL2O95490 1459 aa35.99■■■■□ 3.35
LAMC3-204ENST00000480883 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa35.99■■■■□ 3.35
LAMC3-204ENST00000480883 FANCAO15360 1455 aa35.99■■■■□ 3.35
LAMC3-204ENST00000480883 C9orf84Q5VXU9 1444 aa35.98■■■■□ 3.35
LAMC3-204ENST00000480883 GCC2Q8IWJ2 1684 aa35.97■■■■□ 3.35
LAMC3-204ENST00000480883 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa35.97■■■■□ 3.35
LAMC3-204ENST00000480883 CD109Q6YHK3 1445 aa35.97■■■■□ 3.35
LAMC3-204ENST00000480883 MIER1Q8N108 512 aa35.97■■■■□ 3.35
LAMC3-204ENST00000480883 ABCC1P33527 1531 aa35.95■■■■□ 3.35
LAMC3-204ENST00000480883 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa35.95■■■■□ 3.35
LAMC3-204ENST00000480883 NEUROD1Q13562 356 aa35.93■■■■□ 3.34
LAMC3-204ENST00000480883 ADGBQ8N7X0 1667 aa35.91■■■■□ 3.34
LAMC3-204ENST00000480883 KDM6BO15054 1643 aa35.86■■■■□ 3.33
LAMC3-204ENST00000480883 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa35.85■■■■□ 3.33
LAMC3-204ENST00000480883 GLI2P10070 1586 aa35.85■■■■□ 3.33
LAMC3-204ENST00000480883 ADGRL1O94910 1474 aa35.82■■■■□ 3.33
LAMC3-204ENST00000480883 MAST1Q9Y2H9 1570 aa35.82■■■■□ 3.32
LAMC3-204ENST00000480883 SIN3AQ96ST3 1273 aa35.8■■■■□ 3.32
LAMC3-204ENST00000480883 SCAPERQ9BY12 1400 aa35.79■■■■□ 3.32
LAMC3-204ENST00000480883 FAM69CQ0P6D2 419 aa35.79■■■■□ 3.32
LAMC3-204ENST00000480883 DIP2BQ9P265 1576 aa35.78■■■■□ 3.32
LAMC3-204ENST00000480883 KIF15Q9NS87 1388 aa35.78■■■■□ 3.32
LAMC3-204ENST00000480883 AFAP1Q8N556 730 aa35.78■■■■□ 3.32
LAMC3-204ENST00000480883 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa35.77■■■■□ 3.32
LAMC3-204ENST00000480883 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa35.76■■■■□ 3.31
LAMC3-204ENST00000480883 CFAP74Q9C0B2 1584 aa35.74■■■■□ 3.31
LAMC3-204ENST00000480883 NEO1Q92859 1461 aa35.71■■■■□ 3.31
LAMC3-204ENST00000480883 TRIM52Q96A61 297 aa35.71■■■■□ 3.31
LAMC3-204ENST00000480883 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP35.7■■■■□ 3.31
LAMC3-204ENST00000480883 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa35.68■■■■□ 3.3
LAMC3-204ENST00000480883 PLXNC1O60486 1568 aa35.68■■■■□ 3.3
LAMC3-204ENST00000480883 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP35.64■■■■□ 3.3
LAMC3-204ENST00000480883 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa35.62■■■■□ 3.29
LAMC3-204ENST00000480883 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa35.62■■■■□ 3.29
LAMC3-204ENST00000480883 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa35.62■■■■□ 3.29
LAMC3-204ENST00000480883 POGZQ7Z3K3 1410 aa35.59■■■■□ 3.29
LAMC3-204ENST00000480883 MPHOSPH9Q99550 1183 aa35.59■■■■□ 3.29
LAMC3-204ENST00000480883 DUOX2Q9NRD8 1548 aa35.57■■■■□ 3.28
LAMC3-204ENST00000480883 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP35.55■■■■□ 3.28
LAMC3-204ENST00000480883 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP35.55■■■■□ 3.28
LAMC3-204ENST00000480883 ATP7AQ04656 1500 aa35.55■■■■□ 3.28
LAMC3-204ENST00000480883 KDM5CP41229 1560 aa35.51■■■■□ 3.28
LAMC3-204ENST00000480883 ERBINQ96RT1 1412 aa35.51■■■■□ 3.28
LAMC3-204ENST00000480883 TONSLQ96HA7 1378 aa35.5■■■■□ 3.27
LAMC3-204ENST00000480883 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP35.49■■■■□ 3.27
LAMC3-204ENST00000480883 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP35.49■■■■□ 3.27
LAMC3-204ENST00000480883 MYT1LQ9UL68 1186 aa35.49■■■■□ 3.27
LAMC3-204ENST00000480883 KIF13AQ9H1H9 1805 aa35.49■■■■□ 3.27
LAMC3-204ENST00000480883 PZPP20742 1482 aa35.49■■■■□ 3.27
LAMC3-204ENST00000480883 TEX14Q8IWB6 1497 aa35.49■■■■□ 3.27
LAMC3-204ENST00000480883 RAPGEF3O95398 923 aa35.48■■■■□ 3.27
LAMC3-204ENST00000480883 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP35.47■■■■□ 3.27
LAMC3-204ENST00000480883 NUP155O75694 1391 aa35.47■■■■□ 3.27
LAMC3-204ENST00000480883 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa35.47■■■■□ 3.27
LAMC3-204ENST00000480883 MLH3Q9UHC1 1453 aa35.46■■■■□ 3.27
LAMC3-204ENST00000480883 TSPOAP1O95153 1857 aa35.43■■■■□ 3.26
LAMC3-204ENST00000480883 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa35.43■■■■□ 3.26
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