RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479263.5

PRKCZ-215, Transcript of protein kinase C zeta, human

TSL 2

Gene PRKCZ, Length 1,747 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRKCZ-215	ENST00000479263	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	32.27	■■■□□ 2.76
PRKCZ-215	ENST00000479263	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	32.27	■■■□□ 2.76
PRKCZ-215	ENST00000479263	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		32.26	■■■□□ 2.76
PRKCZ-215	ENST00000479263	DAPK1	P53355	1430 aa		32.23	■■■□□ 2.75
PRKCZ-215	ENST00000479263	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		32.23	■■■□□ 2.75
PRKCZ-215	ENST00000479263	ASXL2	Q76L83	1435 aa		32.22	■■■□□ 2.75
PRKCZ-215	ENST00000479263	ABCC5	O15440	1437 aa		32.21	■■■□□ 2.75
PRKCZ-215	ENST00000479263	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	32.2	■■■□□ 2.75
PRKCZ-215	ENST00000479263	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		32.2	■■■□□ 2.74
PRKCZ-215	ENST00000479263	HFM1	A2PYH4	1435 aa		32.19	■■■□□ 2.74
PRKCZ-215	ENST00000479263	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	32.18	■■■□□ 2.74
PRKCZ-215	ENST00000479263	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		32.17	■■■□□ 2.74
PRKCZ-215	ENST00000479263	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		32.16	■■■□□ 2.74
PRKCZ-215	ENST00000479263	NAIP	Q13075	1403 aa		32.15	■■■□□ 2.74
PRKCZ-215	ENST00000479263	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		32.15	■■■□□ 2.74
PRKCZ-215	ENST00000479263	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	32.14	■■■□□ 2.74
PRKCZ-215	ENST00000479263	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		32.13	■■■□□ 2.73
PRKCZ-215	ENST00000479263	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		32.11	■■■□□ 2.73
PRKCZ-215	ENST00000479263	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		32.1	■■■□□ 2.73
PRKCZ-215	ENST00000479263	PLCH2	O75038	1416 aa		32.1	■■■□□ 2.73
PRKCZ-215	ENST00000479263	AKNA	Q7Z591	1439 aa		32.09	■■■□□ 2.73
PRKCZ-215	ENST00000479263	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		32.08	■■■□□ 2.73
PRKCZ-215	ENST00000479263	ROCK1	Q13464	1354 aa		32.05	■■■□□ 2.72
PRKCZ-215	ENST00000479263	MBD5	Q9P267	1494 aa		32.05	■■■□□ 2.72
PRKCZ-215	ENST00000479263	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	32.04	■■■□□ 2.72	2e-6	■■■■■ 45.8
PRKCZ-215	ENST00000479263	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		32.04	■■■□□ 2.72
PRKCZ-215	ENST00000479263	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		32.04	■■■□□ 2.72
PRKCZ-215	ENST00000479263	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		32.02	■■■□□ 2.72
PRKCZ-215	ENST00000479263	KDM6B	O15054	1643 aa		32.01	■■■□□ 2.71
PRKCZ-215	ENST00000479263	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		31.99	■■■□□ 2.71
PRKCZ-215	ENST00000479263	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		31.98	■■■□□ 2.71
PRKCZ-215	ENST00000479263	ADGRL2	O95490	1459 aa		31.97	■■■□□ 2.71
PRKCZ-215	ENST00000479263	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		31.97	■■■□□ 2.71
PRKCZ-215	ENST00000479263	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		31.96	■■■□□ 2.71
PRKCZ-215	ENST00000479263	MAPKBP1	O60336	1514 aa		31.95	■■■□□ 2.71
PRKCZ-215	ENST00000479263	NCOA1	Q15788	1441 aa		31.95	■■■□□ 2.71
PRKCZ-215	ENST00000479263	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		31.95	■■■□□ 2.71
PRKCZ-215	ENST00000479263	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		31.95	■■■□□ 2.7
PRKCZ-215	ENST00000479263	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		31.94	■■■□□ 2.7
PRKCZ-215	ENST00000479263	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		31.94	■■■□□ 2.7
PRKCZ-215	ENST00000479263	ABCC1	P33527	1531 aa		31.92	■■■□□ 2.7
PRKCZ-215	ENST00000479263	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		31.9	■■■□□ 2.7
PRKCZ-215	ENST00000479263	TSPY4	P0CV99	314 aa		31.89	■■■□□ 2.69
PRKCZ-215	ENST00000479263	TSPY10	P0CW01	314 aa		31.89	■■■□□ 2.69
PRKCZ-215	ENST00000479263	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		31.88	■■■□□ 2.69
PRKCZ-215	ENST00000479263	FANCA	O15360	1455 aa		31.88	■■■□□ 2.69
PRKCZ-215	ENST00000479263	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		31.88	■■■□□ 2.69
PRKCZ-215	ENST00000479263	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		31.83	■■■□□ 2.69
PRKCZ-215	ENST00000479263	CD109	Q6YHK3	1445 aa		31.82	■■■□□ 2.68
PRKCZ-215	ENST00000479263	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		31.8	■■■□□ 2.68
PRKCZ-215	ENST00000479263	KIF15	Q9NS87	1388 aa		31.75	■■■□□ 2.67
PRKCZ-215	ENST00000479263	TRIM52	Q96A61	297 aa		31.75	■■■□□ 2.67
PRKCZ-215	ENST00000479263	ADGRL1	O94910	1474 aa		31.74	■■■□□ 2.67
PRKCZ-215	ENST00000479263	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		31.74	■■■□□ 2.67
PRKCZ-215	ENST00000479263	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		31.72	■■■□□ 2.67
PRKCZ-215	ENST00000479263	GLI2	P10070	1586 aa		31.71	■■■□□ 2.67
PRKCZ-215	ENST00000479263	PLXNC1	O60486	1568 aa		31.71	■■■□□ 2.67
PRKCZ-215	ENST00000479263	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		31.71	■■■□□ 2.67
PRKCZ-215	ENST00000479263	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		31.7	■■■□□ 2.66
PRKCZ-215	ENST00000479263	DIP2B	Q9P265	1576 aa		31.69	■■■□□ 2.66
PRKCZ-215	ENST00000479263	AFAP1	Q8N556	730 aa		31.69	■■■□□ 2.66
PRKCZ-215	ENST00000479263	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	31.68	■■■□□ 2.66
PRKCZ-215	ENST00000479263	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	31.64	■■■□□ 2.65
PRKCZ-215	ENST00000479263	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		31.63	■■■□□ 2.65
PRKCZ-215	ENST00000479263	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	31.61	■■■□□ 2.65
PRKCZ-215	ENST00000479263	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		31.61	■■■□□ 2.65
PRKCZ-215	ENST00000479263	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		31.61	■■■□□ 2.65
PRKCZ-215	ENST00000479263	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		31.61	■■■□□ 2.65
PRKCZ-215	ENST00000479263	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	31.59	■■■□□ 2.65
PRKCZ-215	ENST00000479263	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		31.59	■■■□□ 2.65
PRKCZ-215	ENST00000479263	PZP	P20742	1482 aa		31.58	■■■□□ 2.65
PRKCZ-215	ENST00000479263	NEO1	Q92859	1461 aa		31.58	■■■□□ 2.65
PRKCZ-215	ENST00000479263	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		31.57	■■■□□ 2.64
PRKCZ-215	ENST00000479263	ATP7A	Q04656	1500 aa		31.56	■■■□□ 2.64
PRKCZ-215	ENST00000479263	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		31.54	■■■□□ 2.64
PRKCZ-215	ENST00000479263	NEUROD1	Q13562	356 aa		31.52	■■■□□ 2.64
PRKCZ-215	ENST00000479263	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		31.52	■■■□□ 2.64
PRKCZ-215	ENST00000479263	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	31.52	■■■□□ 2.64
PRKCZ-215	ENST00000479263	TSPOAP1	O95153	1857 aa		31.51	■■■□□ 2.63
PRKCZ-215	ENST00000479263	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		31.5	■■■□□ 2.63
PRKCZ-215	ENST00000479263	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		31.5	■■■□□ 2.63
PRKCZ-215	ENST00000479263	FOXD1	Q16676	465 aa		31.49	■■■□□ 2.63
PRKCZ-215	ENST00000479263	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	31.49	■■■□□ 2.63
PRKCZ-215	ENST00000479263	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		31.49	■■■□□ 2.63
PRKCZ-215	ENST00000479263	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		31.49	■■■□□ 2.63
PRKCZ-215	ENST00000479263	KDM5C	P41229	1560 aa		31.48	■■■□□ 2.63
PRKCZ-215	ENST00000479263	NUP155	O75694	1391 aa		31.48	■■■□□ 2.63
PRKCZ-215	ENST00000479263	UNC13B	O14795	1591 aa		31.46	■■■□□ 2.63
PRKCZ-215	ENST00000479263	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		31.44	■■■□□ 2.62
PRKCZ-215	ENST00000479263	RICTOR	Q6R327	1708 aa		31.4	■■■□□ 2.62
PRKCZ-215	ENST00000479263	RAPGEF3	O95398	923 aa		31.4	■■■□□ 2.62
PRKCZ-215	ENST00000479263	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		31.4	■■■□□ 2.62
PRKCZ-215	ENST00000479263	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		31.38	■■■□□ 2.61
PRKCZ-215	ENST00000479263	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		31.38	■■■□□ 2.61
PRKCZ-215	ENST00000479263	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		31.37	■■■□□ 2.61
PRKCZ-215	ENST00000479263	PKD2	Q13563	968 aa		31.37	■■■□□ 2.61
PRKCZ-215	ENST00000479263	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		31.36	■■■□□ 2.61
PRKCZ-215	ENST00000479263	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	31.35	■■■□□ 2.61	3e-6	■■□□□ 13.3
PRKCZ-215	ENST00000479263	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		31.34	■■■□□ 2.61
PRKCZ-215	ENST00000479263	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		31.33	■■■□□ 2.61

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