RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478932.1

USP25-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene USP25, Length 2,605 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-208ENST00000478932 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
USP25-208ENST00000478932 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
USP25-208ENST00000478932 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa6.02□□□□□ -1.45
USP25-208ENST00000478932 ARHGEF11O15085 1522 aa6.01□□□□□ -1.45
USP25-208ENST00000478932 ATP10BO94823 1461 aa6.01□□□□□ -1.45
USP25-208ENST00000478932 TRIM52Q96A61 297 aa6□□□□□ -1.45
USP25-208ENST00000478932 KCNH8Q96L42 1107 aa6□□□□□ -1.45
USP25-208ENST00000478932 CHD1O14646 1710 aa6□□□□□ -1.45
USP25-208ENST00000478932 PTPN23Q9H3S7 1636 aa6□□□□□ -1.45
USP25-208ENST00000478932 HFM1A2PYH4 1435 aa6□□□□□ -1.45
USP25-208ENST00000478932 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
USP25-208ENST00000478932 NAIPQ13075 1403 aa6□□□□□ -1.45
USP25-208ENST00000478932 MIA2Q96PC5 1412 aa6□□□□□ -1.45
USP25-208ENST00000478932 MAPKBP1O60336 1514 aa5.99□□□□□ -1.45
USP25-208ENST00000478932 NPM3O75607 178 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
USP25-208ENST00000478932 ERCC6L2Q5T890 1561 aa5.99□□□□□ -1.45
USP25-208ENST00000478932 KCNA4P22459 653 aa5.98□□□□□ -1.45
USP25-208ENST00000478932 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
USP25-208ENST00000478932 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP5.97□□□□□ -1.45
USP25-208ENST00000478932 ABCA8O94911 1581 aa5.97□□□□□ -1.45
USP25-208ENST00000478932 ABCC5O15440 1437 aa5.97□□□□□ -1.45
USP25-208ENST00000478932 UACAQ9BZF9 1416 aa5.97□□□□□ -1.45
USP25-208ENST00000478932 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
USP25-208ENST00000478932 KIF14Q15058 1648 aa5.97□□□□□ -1.45
USP25-208ENST00000478932 MPHOSPH9Q99550 1183 aa5.96□□□□□ -1.46
USP25-208ENST00000478932 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
USP25-208ENST00000478932 DAPK1P53355 1430 aa5.96□□□□□ -1.46
USP25-208ENST00000478932 OSCARQ8IYS5 282 aa5.95□□□□□ -1.46
USP25-208ENST00000478932 MIER1Q8N108 512 aa5.95□□□□□ -1.46
USP25-208ENST00000478932 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
USP25-208ENST00000478932 TSPY4P0CV99 314 aa5.95□□□□□ -1.46
USP25-208ENST00000478932 TSPY10P0CW01 314 aa5.95□□□□□ -1.46
USP25-208ENST00000478932 KDM6BO15054 1643 aa5.94□□□□□ -1.46
USP25-208ENST00000478932 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
USP25-208ENST00000478932 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa5.94□□□□□ -1.46
USP25-208ENST00000478932 NCOA1Q15788 1441 aa5.94□□□□□ -1.46
USP25-208ENST00000478932 SHROOM2Q13796 1616 aa5.93□□□□□ -1.46
USP25-208ENST00000478932 ABCC10Q5T3U5 1492 aa5.93□□□□□ -1.46
USP25-208ENST00000478932 TONSLQ96HA7 1378 aa5.93□□□□□ -1.46
USP25-208ENST00000478932 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa5.93□□□□□ -1.46
USP25-208ENST00000478932 AKNAQ7Z591 1439 aa5.92□□□□□ -1.46
USP25-208ENST00000478932 ROCK1Q13464 1354 aa5.92□□□□□ -1.46
USP25-208ENST00000478932 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
USP25-208ENST00000478932 CLASP1Q7Z460 1538 aa5.92□□□□□ -1.46
USP25-208ENST00000478932 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP5.92□□□□□ -1.46
USP25-208ENST00000478932 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa5.91□□□□□ -1.46
USP25-208ENST00000478932 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
USP25-208ENST00000478932 ABCC2Q92887 1545 aa5.9□□□□□ -1.46
USP25-208ENST00000478932 L3MBTL2Q969R5 705 aa5.9□□□□□ -1.46
USP25-208ENST00000478932 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
USP25-208ENST00000478932 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa5.9□□□□□ -1.47
USP25-208ENST00000478932 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa5.9□□□□□ -1.47
USP25-208ENST00000478932 PKD2Q13563 968 aa5.9□□□□□ -1.47
USP25-208ENST00000478932 C9orf84Q5VXU9 1444 aa5.89□□□□□ -1.47
USP25-208ENST00000478932 ADCY10Q96PN6 1610 aa5.89□□□□□ -1.47
USP25-208ENST00000478932 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
USP25-208ENST00000478932 MBD5Q9P267 1494 aa5.89□□□□□ -1.47
USP25-208ENST00000478932 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa5.89□□□□□ -1.47
USP25-208ENST00000478932 AFAP1Q8N556 730 aa5.89□□□□□ -1.47
USP25-208ENST00000478932 NUP155O75694 1391 aa5.89□□□□□ -1.47
USP25-208ENST00000478932 ITSN2Q9NZM3 1697 aa5.89□□□□□ -1.47
USP25-208ENST00000478932 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP5.88□□□□□ -1.47
USP25-208ENST00000478932 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa5.88□□□□□ -1.47
USP25-208ENST00000478932 KIF15Q9NS87 1388 aa5.88□□□□□ -1.47
USP25-208ENST00000478932 RSPH4AQ5TD94 716 aa5.88□□□□□ -1.47
USP25-208ENST00000478932 ARHGAP5Q13017 1502 aa5.88□□□□□ -1.47
USP25-208ENST00000478932 KDM5BQ9UGL1 1544 aa5.88□□□□□ -1.47
USP25-208ENST00000478932 GCC2Q8IWJ2 1684 aa5.87□□□□□ -1.47
USP25-208ENST00000478932 TTC37Q6PGP7 1564 aa5.87□□□□□ -1.47
USP25-208ENST00000478932 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP5.87□□□□□ -1.47
USP25-208ENST00000478932 CYB5RLQ6IPT4 315 aa5.87□□□□□ -1.47
USP25-208ENST00000478932 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa5.87□□□□□ -1.47
USP25-208ENST00000478932 PLCH2O75038 1416 aa5.86□□□□□ -1.47
USP25-208ENST00000478932 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
USP25-208ENST00000478932 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa5.86□□□□□ -1.47
USP25-208ENST00000478932 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa5.86□□□□□ -1.47
USP25-208ENST00000478932 MYT1LQ9UL68 1186 aa5.86□□□□□ -1.47
USP25-208ENST00000478932 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
USP25-208ENST00000478932 ADGRL2O95490 1459 aa5.86□□□□□ -1.47
USP25-208ENST00000478932 PZPP20742 1482 aa5.86□□□□□ -1.47
USP25-208ENST00000478932 SYCP2Q9BX26 1530 aa5.86□□□□□ -1.47
USP25-208ENST00000478932 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa5.86□□□□□ -1.47
USP25-208ENST00000478932 NBPF8Q3BBV2 869 aa5.85□□□□□ -1.47
USP25-208ENST00000478932 PCDH10Q9P2E7 1040 aa5.85□□□□□ -1.47
USP25-208ENST00000478932 CCDC141Q6ZP82 1450 aa5.85□□□□□ -1.47
USP25-208ENST00000478932 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
USP25-208ENST00000478932 PREX2Q70Z35 1606 aa5.84□□□□□ -1.47
USP25-208ENST00000478932 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa5.84□□□□□ -1.47
USP25-208ENST00000478932 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa5.84□□□□□ -1.47
USP25-208ENST00000478932 ASXL2Q76L83 1435 aa5.84□□□□□ -1.48
USP25-208ENST00000478932 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa5.84□□□□□ -1.48
USP25-208ENST00000478932 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.48
USP25-208ENST00000478932 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
USP25-208ENST00000478932 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
USP25-208ENST00000478932 SHANK2Q9UPX8 1470 aa5.83□□□□□ -1.48
USP25-208ENST00000478932 WDR7Q9Y4E6 1490 aa5.83□□□□□ -1.48
USP25-208ENST00000478932 RGL3Q3MIN7 710 aa5.83□□□□□ -1.48
USP25-208ENST00000478932 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa5.83□□□□□ -1.48
USP25-208ENST00000478932 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP5.82□□□□□ -1.48
USP25-208ENST00000478932 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa5.82□□□□□ -1.48
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