RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478672.1

CCZ1-204, Transcript of CCZ1 homolog, vacuolar protein trafficking and biogenesis associated, humanhuman

TSL 2

Gene CCZ1, Length 2,062 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCZ1-204ENST00000478672 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.41■■■■■ 4.06
CCZ1-204ENST00000478672 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa40.4■■■■■ 4.06
CCZ1-204ENST00000478672 WDR7Q9Y4E6 1490 aa40.39■■■■■ 4.06
CCZ1-204ENST00000478672 CHIC2Q9UKJ5 165 aa40.39■■■■■ 4.06
CCZ1-204ENST00000478672 ASXL2Q76L83 1435 aa40.35■■■■■ 4.05
CCZ1-204ENST00000478672 DAPK1P53355 1430 aa40.34■■■■■ 4.05
CCZ1-204ENST00000478672 PREX2Q70Z35 1606 aa40.33■■■■■ 4.05
CCZ1-204ENST00000478672 ABCC5O15440 1437 aa40.32■■■■■ 4.04
CCZ1-204ENST00000478672 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP40.3■■■■■ 4.04
CCZ1-204ENST00000478672 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa40.3■■■■■ 4.04
CCZ1-204ENST00000478672 HFM1A2PYH4 1435 aa40.27■■■■■ 4.04
CCZ1-204ENST00000478672 ARHGAP5Q13017 1502 aa40.27■■■■■ 4.04
CCZ1-204ENST00000478672 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa40.26■■■■■ 4.04
CCZ1-204ENST00000478672 MYO5CQ9NQX4 1742 aa40.26■■■■■ 4.04
CCZ1-204ENST00000478672 NAIPQ13075 1403 aa40.21■■■■■ 4.03
CCZ1-204ENST00000478672 PLCH2O75038 1416 aa40.21■■■■■ 4.03
CCZ1-204ENST00000478672 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP40.2■■■■■ 4.03
CCZ1-204ENST00000478672 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP40.18■■■■■ 4.02
CCZ1-204ENST00000478672 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa40.18■■■■■ 4.02
CCZ1-204ENST00000478672 AKNAQ7Z591 1439 aa40.14■■■■■ 4.02
CCZ1-204ENST00000478672 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa40.14■■■■■ 4.02
CCZ1-204ENST00000478672 ROCK1Q13464 1354 aa40.13■■■■■ 4.01
CCZ1-204ENST00000478672 ABCA9Q8IUA7 1624 aa40.09■■■■■ 4.01
CCZ1-204ENST00000478672 MBD5Q9P267 1494 aa40.07■■■■■ 4.01
CCZ1-204ENST00000478672 CROCC2H7BZ55 1655 aa40.07■■■■■ 4
CCZ1-204ENST00000478672 TSPY4P0CV99 314 aa40.06■■■■■ 4
CCZ1-204ENST00000478672 TSPY10P0CW01 314 aa40.06■■■■■ 4
CCZ1-204ENST00000478672 GCC2Q8IWJ2 1684 aa40.05■■■■■ 4
CCZ1-204ENST00000478672 ARHGEF5Q12774 1597 aa40.05■■■■■ 4
CCZ1-204ENST00000478672 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa40.04■■■■■ 4
CCZ1-204ENST00000478672 SYCP2Q9BX26 1530 aa40.03■■■■■ 4
CCZ1-204ENST00000478672 RSPH4AQ5TD94 716 aa40.03■■■■■ 4
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CCZ1-204ENST00000478672 C9orf84Q5VXU9 1444 aa40■■■■□ 3.99
CCZ1-204ENST00000478672 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa40■■■■□ 3.99
CCZ1-204ENST00000478672 SHANK2Q9UPX8 1470 aa40■■■■□ 3.99
CCZ1-204ENST00000478672 NCOA1Q15788 1441 aa39.99■■■■□ 3.99
CCZ1-204ENST00000478672 ADGBQ8N7X0 1667 aa39.99■■■■□ 3.99
CCZ1-204ENST00000478672 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa39.98■■■■□ 3.99
CCZ1-204ENST00000478672 MAPKBP1O60336 1514 aa39.98■■■■□ 3.99
CCZ1-204ENST00000478672 CLSPNQ9HAW4 1339 aa39.98■■■■□ 3.99
CCZ1-204ENST00000478672 ADGRL2O95490 1459 aa39.97■■■■□ 3.99
CCZ1-204ENST00000478672 KDM6BO15054 1643 aa39.93■■■■□ 3.98
CCZ1-204ENST00000478672 FANCAO15360 1455 aa39.93■■■■□ 3.98
CCZ1-204ENST00000478672 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa39.92■■■■□ 3.98
CCZ1-204ENST00000478672 CD109Q6YHK3 1445 aa39.9■■■■□ 3.98
CCZ1-204ENST00000478672 ABCC1P33527 1531 aa39.9■■■■□ 3.98
CCZ1-204ENST00000478672 TRIM52Q96A61 297 aa39.87■■■■□ 3.97
CCZ1-204ENST00000478672 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa39.8■■■■□ 3.96
CCZ1-204ENST00000478672 KIF15Q9NS87 1388 aa39.78■■■■□ 3.96
CCZ1-204ENST00000478672 MAST1Q9Y2H9 1570 aa39.76■■■■□ 3.96
CCZ1-204ENST00000478672 ADGRL1O94910 1474 aa39.76■■■■□ 3.96
CCZ1-204ENST00000478672 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa39.75■■■■□ 3.95
CCZ1-204ENST00000478672 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP39.75■■■■□ 3.95
CCZ1-204ENST00000478672 AFAP1Q8N556 730 aa39.74■■■■□ 3.95
CCZ1-204ENST00000478672 SCAPERQ9BY12 1400 aa39.73■■■■□ 3.95
CCZ1-204ENST00000478672 FAM69CQ0P6D2 419 aa39.69■■■■□ 3.94
CCZ1-204ENST00000478672 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP39.67■■■■□ 3.94
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CCZ1-204ENST00000478672 CFAP74Q9C0B2 1584 aa39.66■■■■□ 3.94
CCZ1-204ENST00000478672 MPHOSPH9Q99550 1183 aa39.64■■■■□ 3.94
CCZ1-204ENST00000478672 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa39.62■■■■□ 3.93
CCZ1-204ENST00000478672 DIP2BQ9P265 1576 aa39.61■■■■□ 3.93
CCZ1-204ENST00000478672 PLXNC1O60486 1568 aa39.61■■■■□ 3.93
CCZ1-204ENST00000478672 SIN3AQ96ST3 1273 aa39.58■■■■□ 3.93
CCZ1-204ENST00000478672 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa39.57■■■■□ 3.92
CCZ1-204ENST00000478672 MYT1LQ9UL68 1186 aa39.56■■■■□ 3.92
CCZ1-204ENST00000478672 NEO1Q92859 1461 aa39.56■■■■□ 3.92
CCZ1-204ENST00000478672 NEUROD1Q13562 356 aa39.56■■■■□ 3.92
CCZ1-204ENST00000478672 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP39.54■■■■□ 3.92
CCZ1-204ENST00000478672 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa39.53■■■■□ 3.92
CCZ1-204ENST00000478672 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP39.52■■■■□ 3.92
CCZ1-204ENST00000478672 DUOX2Q9NRD8 1548 aa39.51■■■■□ 3.92
CCZ1-204ENST00000478672 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa39.5■■■■□ 3.91
CCZ1-204ENST00000478672 NUP155O75694 1391 aa39.48■■■■□ 3.91
CCZ1-204ENST00000478672 ATP7AQ04656 1500 aa39.47■■■■□ 3.91
CCZ1-204ENST00000478672 PZPP20742 1482 aa39.47■■■■□ 3.91
CCZ1-204ENST00000478672 POGZQ7Z3K3 1410 aa39.46■■■■□ 3.91
CCZ1-204ENST00000478672 FOXD1Q16676 465 aa39.45■■■■□ 3.91
CCZ1-204ENST00000478672 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP39.45■■■■□ 3.91
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CCZ1-204ENST00000478672 TEX14Q8IWB6 1497 aa39.3■■■■□ 3.88
CCZ1-204ENST00000478672 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP39.29■■■■□ 3.88
CCZ1-204ENST00000478672 MLH3Q9UHC1 1453 aa39.29■■■■□ 3.88
CCZ1-204ENST00000478672 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa39.29■■■■□ 3.88
CCZ1-204ENST00000478672 UNC13BO14795 1591 aa39.29■■■■□ 3.88
CCZ1-204ENST00000478672 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa39.28■■■■□ 3.88
CCZ1-204ENST00000478672 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP39.26■■■■□ 3.88
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CCZ1-204ENST00000478672 FAM135AQ9P2D6 1515 aa39.24■■■■□ 3.87
CCZ1-204ENST00000478672 TONSLQ96HA7 1378 aa39.24■■■■□ 3.87
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