RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478150.1

STX4-208, Transcript of syntaxin 4, humanhuman

TSL 4

Gene STX4, Length 545 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4-208ENST00000478150 PLCH2O75038 1416 aa28.77■■■□□ 2.2
STX4-208ENST00000478150 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa28.76■■■□□ 2.19
STX4-208ENST00000478150 MADDQ8WXG6 1647 aa28.73■■■□□ 2.19
STX4-208ENST00000478150 MYO5CQ9NQX4 1742 aa28.73■■■□□ 2.19
STX4-208ENST00000478150 POGZQ7Z3K3 1410 aa28.72■■■□□ 2.19
STX4-208ENST00000478150 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa28.71■■■□□ 2.19
STX4-208ENST00000478150 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa28.68■■■□□ 2.18
STX4-208ENST00000478150 RICTORQ6R327 1708 aa28.66■■■□□ 2.18
STX4-208ENST00000478150 LMTK3Q96Q04 1460 aa28.66■■■□□ 2.18
STX4-208ENST00000478150 ARHGAP5Q13017 1502 aa28.64■■■□□ 2.17
STX4-208ENST00000478150 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP28.63■■■□□ 2.17
STX4-208ENST00000478150 MAGI2Q86UL8 1455 aa28.62■■■□□ 2.17
STX4-208ENST00000478150 SCAPERQ9BY12 1400 aa28.61■■■□□ 2.17
STX4-208ENST00000478150 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa28.6■■■□□ 2.17
STX4-208ENST00000478150 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa28.58■■■□□ 2.17
STX4-208ENST00000478150 MTUS2Q5JR59 1369 aa28.57■■■□□ 2.16
STX4-208ENST00000478150 PREX2Q70Z35 1606 aa28.57■■■□□ 2.16
STX4-208ENST00000478150 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa28.55■■■□□ 2.16
STX4-208ENST00000478150 PLPPR3Q6T4P5 718 aa28.52■■■□□ 2.16
STX4-208ENST00000478150 VPS8Q8N3P4 1428 aa28.52■■■□□ 2.16
STX4-208ENST00000478150 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa28.51■■■□□ 2.15
STX4-208ENST00000478150 HSPA2P54652 639 aa28.5■■■□□ 2.15
STX4-208ENST00000478150 YEATS2Q9ULM3 1422 aa28.5■■■□□ 2.15
STX4-208ENST00000478150 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa28.48■■■□□ 2.15
STX4-208ENST00000478150 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa28.47■■■□□ 2.15
STX4-208ENST00000478150 MLECQ14165 292 aa28.47■■■□□ 2.15
STX4-208ENST00000478150 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP28.47■■■□□ 2.15
STX4-208ENST00000478150 CCNB3Q8WWL7 1395 aa28.45■■■□□ 2.14
STX4-208ENST00000478150 ABCC1P33527 1531 aa28.43■■■□□ 2.14
STX4-208ENST00000478150 ATP10AO60312 1499 aa28.43■■■□□ 2.14
STX4-208ENST00000478150 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa28.42■■■□□ 2.14
STX4-208ENST00000478150 AFAP1Q8N556 730 aa28.41■■■□□ 2.14
STX4-208ENST00000478150 KDM5CP41229 1560 aa28.41■■■□□ 2.14
STX4-208ENST00000478150 TIAM1Q13009 1591 aa28.41■■■□□ 2.14
STX4-208ENST00000478150 CERKQ8TCT0 537 aa28.4■■■□□ 2.14
STX4-208ENST00000478150 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP28.4■■■□□ 2.14
STX4-208ENST00000478150 C9orf84Q5VXU9 1444 aa28.4■■■□□ 2.14
STX4-208ENST00000478150 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP28.39■■■□□ 2.14
STX4-208ENST00000478150 ITSN2Q9NZM3 1697 aa28.38■■■□□ 2.13
STX4-208ENST00000478150 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa28.38■■■□□ 2.13
STX4-208ENST00000478150 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa28.37■■■□□ 2.13
STX4-208ENST00000478150 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa28.36■■■□□ 2.13
STX4-208ENST00000478150 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa28.35■■■□□ 2.13
STX4-208ENST00000478150 MYT1LQ9UL68 1186 aa28.35■■■□□ 2.13
STX4-208ENST00000478150 DMRT2Q9Y5R5 561 aa28.34■■■□□ 2.13
STX4-208ENST00000478150 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
STX4-208ENST00000478150 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa28.33■■■□□ 2.13
STX4-208ENST00000478150 MLH3Q9UHC1 1453 aa28.32■■■□□ 2.12
STX4-208ENST00000478150 NCOA2Q15596 1464 aa28.31■■■□□ 2.12
STX4-208ENST00000478150 MAP3K1Q13233 1512 aa28.31■■■□□ 2.12
STX4-208ENST00000478150 SYCP2Q9BX26 1530 aa28.31■■■□□ 2.12
STX4-208ENST00000478150 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa28.3■■■□□ 2.12
STX4-208ENST00000478150 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa28.3■■■□□ 2.12
STX4-208ENST00000478150 PREX1Q8TCU6 1659 aa28.29■■■□□ 2.12
STX4-208ENST00000478150 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
STX4-208ENST00000478150 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP28.26■■■□□ 2.11
STX4-208ENST00000478150 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa28.25■■■□□ 2.11
STX4-208ENST00000478150 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP28.23■■■□□ 2.11
STX4-208ENST00000478150 ABCA6Q8N139 1617 aa28.22■■■□□ 2.11
STX4-208ENST00000478150 APLP2Q06481 763 aa28.22■■■□□ 2.11
STX4-208ENST00000478150 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa28.21■■■□□ 2.11
STX4-208ENST00000478150 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP28.2■■■□□ 2.11
STX4-208ENST00000478150 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP28.2■■■□□ 2.11
STX4-208ENST00000478150 REREQ9P2R6 1566 aa28.2■■■□□ 2.11
STX4-208ENST00000478150 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa28.2■■■□□ 2.11
STX4-208ENST00000478150 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP28.2■■■□□ 2.1
STX4-208ENST00000478150 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP28.2■■■□□ 2.1
STX4-208ENST00000478150 MBD5Q9P267 1494 aa28.14■■■□□ 2.09
STX4-208ENST00000478150 ATP7AQ04656 1500 aa28.13■■■□□ 2.09
STX4-208ENST00000478150 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa28.13■■■□□ 2.09
STX4-208ENST00000478150 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP28.12■■■□□ 2.09
STX4-208ENST00000478150 AGLP35573 1532 aa28.11■■■□□ 2.09
STX4-208ENST00000478150 STRCQ7RTU9 1775 aa28.09■■■□□ 2.09
STX4-208ENST00000478150 PTPRTO14522 1441 aa28.08■■■□□ 2.09
STX4-208ENST00000478150 RSPH4AQ5TD94 716 aa28.06■■■□□ 2.08
STX4-208ENST00000478150 MYOM3Q5VTT5 1437 aa28.06■■■□□ 2.08
STX4-208ENST00000478150 CCDC141Q6ZP82 1450 aa28.06■■■□□ 2.08
STX4-208ENST00000478150 CNTLNQ9NXG0 1405 aa28.05■■■□□ 2.08
STX4-208ENST00000478150 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa28.03■■■□□ 2.08
STX4-208ENST00000478150 MIA2Q96PC5 1412 aa28.03■■■□□ 2.08
STX4-208ENST00000478150 C3P01024 1663 aa28.02■■■□□ 2.08
STX4-208ENST00000478150 A2MP01023 1474 aa28.02■■■□□ 2.08
STX4-208ENST00000478150 ARHGEF5Q12774 1597 aa28.01■■■□□ 2.07
STX4-208ENST00000478150 DISP3Q9P2K9 1392 aa28■■■□□ 2.07
STX4-208ENST00000478150 ADGBQ8N7X0 1667 aa27.99■■■□□ 2.07
STX4-208ENST00000478150 PLXNC1O60486 1568 aa27.99■■■□□ 2.07
STX4-208ENST00000478150 TSPY4P0CV99 314 aa27.95■■■□□ 2.06
STX4-208ENST00000478150 TSPY10P0CW01 314 aa27.95■■■□□ 2.06
STX4-208ENST00000478150 IQSEC2Q5JU85 1478 aa27.92■■■□□ 2.06
STX4-208ENST00000478150 NPATQ14207 1427 aa27.92■■■□□ 2.06
STX4-208ENST00000478150 NCOA1Q15788 1441 aa27.91■■■□□ 2.06
STX4-208ENST00000478150 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP27.9■■■□□ 2.06
STX4-208ENST00000478150 MROH2AA6NES4 1674 aa27.87■■■□□ 2.05
STX4-208ENST00000478150 PTPN23Q9H3S7 1636 aa27.87■■■□□ 2.05
STX4-208ENST00000478150 FGD6Q6ZV73 1430 aa27.86■■■□□ 2.05
STX4-208ENST00000478150 SOCS7O14512 581 aa27.86■■■□□ 2.05
STX4-208ENST00000478150 MAST1Q9Y2H9 1570 aa27.86■■■□□ 2.05
STX4-208ENST00000478150 ZMYM3Q14202 1370 aa27.86■■■□□ 2.05
STX4-208ENST00000478150 LTBP4Q8N2S1 1624 aa27.85■■■□□ 2.05
STX4-208ENST00000478150 GGT6Q6P531 493 aa27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.5 ms