RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475693.1

ATG4B-217, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 2,237 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-217ENST00000475693 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP27.22■■□□□ 1.95
ATG4B-217ENST00000475693 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa27.22■■□□□ 1.95
ATG4B-217ENST00000475693 ITSN2Q9NZM3 1697 aa27.21■■□□□ 1.95
ATG4B-217ENST00000475693 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP27.21■■□□□ 1.95
ATG4B-217ENST00000475693 ARHGAP5Q13017 1502 aa27.2■■□□□ 1.94
ATG4B-217ENST00000475693 PREX2Q70Z35 1606 aa27.17■■□□□ 1.94
ATG4B-217ENST00000475693 PLCH2O75038 1416 aa27.17■■□□□ 1.94
ATG4B-217ENST00000475693 MAPKBP1O60336 1514 aa27.16■■□□□ 1.94
ATG4B-217ENST00000475693 MYO5CQ9NQX4 1742 aa27.16■■□□□ 1.94
ATG4B-217ENST00000475693 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa27.14■■□□□ 1.94
ATG4B-217ENST00000475693 FAM69CQ0P6D2 419 aa27.13■■□□□ 1.93
ATG4B-217ENST00000475693 ABCC5O15440 1437 aa27.13■■□□□ 1.93
ATG4B-217ENST00000475693 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa27.13■■□□□ 1.93
ATG4B-217ENST00000475693 ABCA9Q8IUA7 1624 aa27.13■■□□□ 1.93
ATG4B-217ENST00000475693 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa27.12■■□□□ 1.93
ATG4B-217ENST00000475693 DAPK1P53355 1430 aa27.11■■□□□ 1.93
ATG4B-217ENST00000475693 CD109Q6YHK3 1445 aa27.1■■□□□ 1.93
ATG4B-217ENST00000475693 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa27.06■■□□□ 1.92
ATG4B-217ENST00000475693 MBD5Q9P267 1494 aa27.05■■□□□ 1.92
ATG4B-217ENST00000475693 SYCP2Q9BX26 1530 aa27.05■■□□□ 1.92
ATG4B-217ENST00000475693 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
ATG4B-217ENST00000475693 FANCAO15360 1455 aa27.04■■□□□ 1.92
ATG4B-217ENST00000475693 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa27.02■■□□□ 1.92
ATG4B-217ENST00000475693 AFAP1Q8N556 730 aa27■■□□□ 1.91
ATG4B-217ENST00000475693 SETD5Q9C0A6 1442 aa26.99■■□□□ 1.91
ATG4B-217ENST00000475693 DIP2BQ9P265 1576 aa26.99■■□□□ 1.91
ATG4B-217ENST00000475693 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa26.98■■□□□ 1.91
ATG4B-217ENST00000475693 TSPY4P0CV99 314 aa26.97■■□□□ 1.91
ATG4B-217ENST00000475693 TSPY10P0CW01 314 aa26.97■■□□□ 1.91
ATG4B-217ENST00000475693 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
ATG4B-217ENST00000475693 NAIPQ13075 1403 aa26.96■■□□□ 1.91
ATG4B-217ENST00000475693 AKNAQ7Z591 1439 aa26.95■■□□□ 1.91
ATG4B-217ENST00000475693 ABCC1P33527 1531 aa26.93■■□□□ 1.9
ATG4B-217ENST00000475693 TSPOAP1O95153 1857 aa26.93■■□□□ 1.9
ATG4B-217ENST00000475693 ARAP3Q8WWN8 1544 aa26.93■■□□□ 1.9
ATG4B-217ENST00000475693 HFM1A2PYH4 1435 aa26.93■■□□□ 1.9
ATG4B-217ENST00000475693 SCAPERQ9BY12 1400 aa26.93■■□□□ 1.9
ATG4B-217ENST00000475693 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa26.93■■□□□ 1.9
ATG4B-217ENST00000475693 C9orf84Q5VXU9 1444 aa26.92■■□□□ 1.9
ATG4B-217ENST00000475693 ADGRL1O94910 1474 aa26.92■■□□□ 1.9
ATG4B-217ENST00000475693 CCDC141Q6ZP82 1450 aa26.92■■□□□ 1.9
ATG4B-217ENST00000475693 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa26.91■■□□□ 1.9
ATG4B-217ENST00000475693 GLI2P10070 1586 aa26.91■■□□□ 1.9
ATG4B-217ENST00000475693 KDM6BO15054 1643 aa26.9■■□□□ 1.9
ATG4B-217ENST00000475693 NCOA1Q15788 1441 aa26.9■■□□□ 1.9
ATG4B-217ENST00000475693 ARHGEF5Q12774 1597 aa26.9■■□□□ 1.9
ATG4B-217ENST00000475693 CROCC2H7BZ55 1655 aa26.9■■□□□ 1.9
ATG4B-217ENST00000475693 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa26.88■■□□□ 1.89
ATG4B-217ENST00000475693 KIF13AQ9H1H9 1805 aa26.87■■□□□ 1.89
ATG4B-217ENST00000475693 RAPGEF3O95398 923 aa26.87■■□□□ 1.89
ATG4B-217ENST00000475693 RSPH4AQ5TD94 716 aa26.86■■□□□ 1.89
ATG4B-217ENST00000475693 ROCK1Q13464 1354 aa26.85■■□□□ 1.89
ATG4B-217ENST00000475693 TRHP20396 242 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
ATG4B-217ENST00000475693 MYT1LQ9UL68 1186 aa26.84■■□□□ 1.89
ATG4B-217ENST00000475693 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa26.83■■□□□ 1.89
ATG4B-217ENST00000475693 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
ATG4B-217ENST00000475693 SHANK2Q9UPX8 1470 aa26.81■■□□□ 1.88
ATG4B-217ENST00000475693 ADGRL2O95490 1459 aa26.8■■□□□ 1.88
ATG4B-217ENST00000475693 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
ATG4B-217ENST00000475693 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
ATG4B-217ENST00000475693 KIF15Q9NS87 1388 aa26.79■■□□□ 1.88
ATG4B-217ENST00000475693 ADGBQ8N7X0 1667 aa26.78■■□□□ 1.88
ATG4B-217ENST00000475693 TRIM52Q96A61 297 aa26.78■■□□□ 1.88
ATG4B-217ENST00000475693 GCC2Q8IWJ2 1684 aa26.76■■□□□ 1.88
ATG4B-217ENST00000475693 NEO1Q92859 1461 aa26.76■■□□□ 1.87
ATG4B-217ENST00000475693 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa26.72■■□□□ 1.87
ATG4B-217ENST00000475693 CFAP74Q9C0B2 1584 aa26.72■■□□□ 1.87
ATG4B-217ENST00000475693 POGZQ7Z3K3 1410 aa26.72■■□□□ 1.87
ATG4B-217ENST00000475693 MAST1Q9Y2H9 1570 aa26.7■■□□□ 1.86
ATG4B-217ENST00000475693 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
ATG4B-217ENST00000475693 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa26.69■■□□□ 1.86
ATG4B-217ENST00000475693 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa26.68■■□□□ 1.86
ATG4B-217ENST00000475693 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
ATG4B-217ENST00000475693 ATP7AQ04656 1500 aa26.65■■□□□ 1.86
ATG4B-217ENST00000475693 FOXD1Q16676 465 aa26.65■■□□□ 1.86
ATG4B-217ENST00000475693 TEX14Q8IWB6 1497 aa26.64■■□□□ 1.86
ATG4B-217ENST00000475693 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP26.63■■□□□ 1.856e-14■■□□□ 11.4
ATG4B-217ENST00000475693 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa26.63■■□□□ 1.85
ATG4B-217ENST00000475693 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa26.62■■□□□ 1.85
ATG4B-217ENST00000475693 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
ATG4B-217ENST00000475693 PLXNC1O60486 1568 aa26.61■■□□□ 1.85
ATG4B-217ENST00000475693 MPHOSPH9Q99550 1183 aa26.6■■□□□ 1.85
ATG4B-217ENST00000475693 KDM5CP41229 1560 aa26.6■■□□□ 1.85
ATG4B-217ENST00000475693 RICTORQ6R327 1708 aa26.59■■□□□ 1.85
ATG4B-217ENST00000475693 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa26.59■■□□□ 1.85
ATG4B-217ENST00000475693 YEATS2Q9ULM3 1422 aa26.57■■□□□ 1.84
ATG4B-217ENST00000475693 SIN3AQ96ST3 1273 aa26.57■■□□□ 1.84
ATG4B-217ENST00000475693 NUP155O75694 1391 aa26.56■■□□□ 1.84
ATG4B-217ENST00000475693 DUOX2Q9NRD8 1548 aa26.56■■□□□ 1.84
ATG4B-217ENST00000475693 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
ATG4B-217ENST00000475693 MLH3Q9UHC1 1453 aa26.55■■□□□ 1.84
ATG4B-217ENST00000475693 HECW2Q9P2P5 1572 aa26.53■■□□□ 1.84
ATG4B-217ENST00000475693 KIF3BO15066 747 aa26.53■■□□□ 1.84
ATG4B-217ENST00000475693 NEUROD1Q13562 356 aa26.51■■□□□ 1.84
ATG4B-217ENST00000475693 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
ATG4B-217ENST00000475693 PZPP20742 1482 aa26.51■■□□□ 1.83
ATG4B-217ENST00000475693 ABCA6Q8N139 1617 aa26.5■■□□□ 1.83
ATG4B-217ENST00000475693 ERBINQ96RT1 1412 aa26.48■■□□□ 1.83
ATG4B-217ENST00000475693 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
ATG4B-217ENST00000475693 A2MP01023 1474 aa26.47■■□□□ 1.83
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