RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472768.5

GPSM3-208, Transcript of G protein signaling modulator 3, human

TSL 2

Gene GPSM3, Length 1,417 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPSM3-208	ENST00000472768	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		30.02	■■■□□ 2.4
GPSM3-208	ENST00000472768	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		30.01	■■■□□ 2.4
GPSM3-208	ENST00000472768	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		30	■■■□□ 2.39
GPSM3-208	ENST00000472768	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		29.99	■■■□□ 2.39
GPSM3-208	ENST00000472768	CLIP1	P30622	1438 aa		29.97	■■■□□ 2.39
GPSM3-208	ENST00000472768	KIF14	Q15058	1648 aa		29.97	■■■□□ 2.39
GPSM3-208	ENST00000472768	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		29.96	■■■□□ 2.39
GPSM3-208	ENST00000472768	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		29.96	■■■□□ 2.39
GPSM3-208	ENST00000472768	MLEC	Q14165	292 aa		29.94	■■■□□ 2.38
GPSM3-208	ENST00000472768	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		29.93	■■■□□ 2.38
GPSM3-208	ENST00000472768	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		29.92	■■■□□ 2.38
GPSM3-208	ENST00000472768	ATP10A	O60312	1499 aa		29.92	■■■□□ 2.38
GPSM3-208	ENST00000472768	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	29.91	■■■□□ 2.38
GPSM3-208	ENST00000472768	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		29.9	■■■□□ 2.38
GPSM3-208	ENST00000472768	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		29.88	■■■□□ 2.37
GPSM3-208	ENST00000472768	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		29.87	■■■□□ 2.37
GPSM3-208	ENST00000472768	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		29.86	■■■□□ 2.37
GPSM3-208	ENST00000472768	HSPA2	P54652	639 aa		29.85	■■■□□ 2.37
GPSM3-208	ENST00000472768	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		29.83	■■■□□ 2.37
GPSM3-208	ENST00000472768	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		29.82	■■■□□ 2.36
GPSM3-208	ENST00000472768	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		29.78	■■■□□ 2.36
GPSM3-208	ENST00000472768	KDM5C	P41229	1560 aa		29.78	■■■□□ 2.36
GPSM3-208	ENST00000472768	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		29.75	■■■□□ 2.35
GPSM3-208	ENST00000472768	AFAP1	Q8N556	730 aa		29.74	■■■□□ 2.35
GPSM3-208	ENST00000472768	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		29.72	■■■□□ 2.35
GPSM3-208	ENST00000472768	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		29.71	■■■□□ 2.35
GPSM3-208	ENST00000472768	RERE	Q9P2R6	1566 aa		29.7	■■■□□ 2.35
GPSM3-208	ENST00000472768	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	29.7	■■■□□ 2.34
GPSM3-208	ENST00000472768	PREX2	Q70Z35	1606 aa		29.7	■■■□□ 2.34
GPSM3-208	ENST00000472768	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		29.69	■■■□□ 2.34
GPSM3-208	ENST00000472768	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		29.68	■■■□□ 2.34
GPSM3-208	ENST00000472768	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		29.68	■■■□□ 2.34
GPSM3-208	ENST00000472768	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		29.67	■■■□□ 2.34
GPSM3-208	ENST00000472768	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		29.66	■■■□□ 2.34
GPSM3-208	ENST00000472768	ABCC1	P33527	1531 aa		29.65	■■■□□ 2.34
GPSM3-208	ENST00000472768	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	29.64	■■■□□ 2.34
GPSM3-208	ENST00000472768	CERK	Q8TCT0	537 aa		29.64	■■■□□ 2.34
GPSM3-208	ENST00000472768	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	29.63	■■■□□ 2.33
GPSM3-208	ENST00000472768	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		29.61	■■■□□ 2.33
GPSM3-208	ENST00000472768	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		29.61	■■■□□ 2.33
GPSM3-208	ENST00000472768	ABCA6	Q8N139	1617 aa		29.61	■■■□□ 2.33
GPSM3-208	ENST00000472768	AGL	P35573	1532 aa		29.6	■■■□□ 2.33
GPSM3-208	ENST00000472768	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		29.58	■■■□□ 2.33
GPSM3-208	ENST00000472768	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		29.55	■■■□□ 2.32
GPSM3-208	ENST00000472768	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		29.54	■■■□□ 2.32
GPSM3-208	ENST00000472768	C3	P01024	1663 aa		29.51	■■■□□ 2.31
GPSM3-208	ENST00000472768	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	29.51	■■■□□ 2.31
GPSM3-208	ENST00000472768	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		29.49	■■■□□ 2.31
GPSM3-208	ENST00000472768	STRC	Q7RTU9	1775 aa		29.45	■■■□□ 2.31
GPSM3-208	ENST00000472768	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	29.45	■■■□□ 2.31
GPSM3-208	ENST00000472768	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		29.45	■■■□□ 2.31
GPSM3-208	ENST00000472768	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		29.45	■■■□□ 2.31
GPSM3-208	ENST00000472768	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		29.43	■■■□□ 2.3
GPSM3-208	ENST00000472768	PTPRT	O14522	1441 aa		29.43	■■■□□ 2.3
GPSM3-208	ENST00000472768	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	29.42	■■■□□ 2.3
GPSM3-208	ENST00000472768	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		29.4	■■■□□ 2.3
GPSM3-208	ENST00000472768	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	29.4	■■■□□ 2.3
GPSM3-208	ENST00000472768	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		29.39	■■■□□ 2.3
GPSM3-208	ENST00000472768	MROH2A	A6NES4	1674 aa		29.39	■■■□□ 2.3
GPSM3-208	ENST00000472768	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		29.38	■■■□□ 2.29
GPSM3-208	ENST00000472768	NPAT	Q14207	1427 aa		29.37	■■■□□ 2.29
GPSM3-208	ENST00000472768	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	29.37	■■■□□ 2.29
GPSM3-208	ENST00000472768	ATP7A	Q04656	1500 aa		29.36	■■■□□ 2.29
GPSM3-208	ENST00000472768	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	29.33	■■■□□ 2.29
GPSM3-208	ENST00000472768	NCOA1	Q15788	1441 aa		29.31	■■■□□ 2.28
GPSM3-208	ENST00000472768	A2M	P01023	1474 aa		29.3	■■■□□ 2.28
GPSM3-208	ENST00000472768	ZMYM3	Q14202	1370 aa		29.3	■■■□□ 2.28
GPSM3-208	ENST00000472768	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	29.3	■■■□□ 2.28
GPSM3-208	ENST00000472768	PLXNC1	O60486	1568 aa		29.25	■■■□□ 2.27
GPSM3-208	ENST00000472768	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		29.25	■■■□□ 2.27
GPSM3-208	ENST00000472768	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		29.25	■■■□□ 2.27
GPSM3-208	ENST00000472768	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		29.24	■■■□□ 2.27
GPSM3-208	ENST00000472768	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		29.24	■■■□□ 2.27
GPSM3-208	ENST00000472768	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	29.23	■■■□□ 2.27
GPSM3-208	ENST00000472768	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		29.23	■■■□□ 2.27
GPSM3-208	ENST00000472768	GGT6	Q6P531	493 aa		29.22	■■■□□ 2.27
GPSM3-208	ENST00000472768	TIAM1	Q13009	1591 aa		29.18	■■■□□ 2.26
GPSM3-208	ENST00000472768	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		29.17	■■■□□ 2.26
GPSM3-208	ENST00000472768	PKD2	Q13563	968 aa		29.17	■■■□□ 2.26
GPSM3-208	ENST00000472768	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	29.16	■■■□□ 2.26
GPSM3-208	ENST00000472768	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		29.16	■■■□□ 2.26
GPSM3-208	ENST00000472768	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		29.16	■■■□□ 2.26
GPSM3-208	ENST00000472768	PLA2R1	Q13018	1463 aa		29.15	■■■□□ 2.26
GPSM3-208	ENST00000472768	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		29.15	■■■□□ 2.26
GPSM3-208	ENST00000472768	CEP162	Q5TB80	1403 aa		29.15	■■■□□ 2.26
GPSM3-208	ENST00000472768	PTPRK	Q15262	1439 aa		29.13	■■■□□ 2.25
GPSM3-208	ENST00000472768	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	29.13	■■■□□ 2.25
GPSM3-208	ENST00000472768	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		29.1	■■■□□ 2.25
GPSM3-208	ENST00000472768	MBD5	Q9P267	1494 aa		29.1	■■■□□ 2.25
GPSM3-208	ENST00000472768	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	29.09	■■■□□ 2.25
GPSM3-208	ENST00000472768	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		29.09	■■■□□ 2.25
GPSM3-208	ENST00000472768	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	29.08	■■■□□ 2.25
GPSM3-208	ENST00000472768	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		29.06	■■■□□ 2.24
GPSM3-208	ENST00000472768	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		29.05	■■■□□ 2.24
GPSM3-208	ENST00000472768	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	29.04	■■■□□ 2.24
GPSM3-208	ENST00000472768	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		29.03	■■■□□ 2.24
GPSM3-208	ENST00000472768	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	29.01	■■■□□ 2.24
GPSM3-208	ENST00000472768	NCOA2	Q15596	1464 aa		29	■■■□□ 2.23
GPSM3-208	ENST00000472768	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		29	■■■□□ 2.23
GPSM3-208	ENST00000472768	KIF3B	O15066	747 aa		29	■■■□□ 2.23

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