RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471274.1

PTPRD-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRD, Length 1,205 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-208ENST00000471274 ARAP3Q8WWN8 1544 aa15.48■□□□□ 0.07
PTPRD-208ENST00000471274 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa15.47■□□□□ 0.07
PTPRD-208ENST00000471274 MYO5CQ9NQX4 1742 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRD-208ENST00000471274 CFAP74Q9C0B2 1584 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRD-208ENST00000471274 ARID3CA6NKF2 412 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRD-208ENST00000471274 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP15.45■□□□□ 0.06
PTPRD-208ENST00000471274 TTC37Q6PGP7 1564 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRD-208ENST00000471274 PREX2Q70Z35 1606 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRD-208ENST00000471274 NCOA2Q15596 1464 aa15.41■□□□□ 0.06
PTPRD-208ENST00000471274 TEX14Q8IWB6 1497 aa15.41■□□□□ 0.06
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PTPRD-208ENST00000471274 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa15.26■□□□□ 0.03
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PTPRD-208ENST00000471274 ADGRL1O94910 1474 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRD-208ENST00000471274 ARHGEF5Q12774 1597 aa15.24■□□□□ 0.03
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PTPRD-208ENST00000471274 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
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PTPRD-208ENST00000471274 SYCP2Q9BX26 1530 aa15.22■□□□□ 0.03
PTPRD-208ENST00000471274 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa15.21■□□□□ 0.03
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PTPRD-208ENST00000471274 ZBTB22O15209 634 aa15.2■□□□□ 0.02
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PTPRD-208ENST00000471274 MAST1Q9Y2H9 1570 aa15.16■□□□□ 0.02
PTPRD-208ENST00000471274 HECW2Q9P2P5 1572 aa15.15■□□□□ 0.02
PTPRD-208ENST00000471274 MAGI2Q86UL8 1455 aa15.15■□□□□ 0.02
PTPRD-208ENST00000471274 MBD5Q9P267 1494 aa15.15■□□□□ 0.02
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PTPRD-208ENST00000471274 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
PTPRD-208ENST00000471274 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa15.12■□□□□ 0.01
PTPRD-208ENST00000471274 DAPK1P53355 1430 aa15.12■□□□□ 0.01
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PTPRD-208ENST00000471274 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0
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PTPRD-208ENST00000471274 RNF39Q9H2S5 420 aa15.07■□□□□ 0
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PTPRD-208ENST00000471274 TSPY10P0CW01 314 aa15.06■□□□□ 0
PTPRD-208ENST00000471274 ROCK1Q13464 1354 aa15.06■□□□□ 0
PTPRD-208ENST00000471274 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP15.06■□□□□ 0
PTPRD-208ENST00000471274 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP15.05■□□□□ -0
PTPRD-208ENST00000471274 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP15.04■□□□□ -0
PTPRD-208ENST00000471274 ABCA6Q8N139 1617 aa15.03■□□□□ -0
PTPRD-208ENST00000471274 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa15.03■□□□□ -0
PTPRD-208ENST00000471274 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa15.03■□□□□ -0
PTPRD-208ENST00000471274 GCC2Q8IWJ2 1684 aa15.03■□□□□ -0
PTPRD-208ENST00000471274 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP15.02■□□□□ -0
PTPRD-208ENST00000471274 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP15.02□□□□□ -0.01
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