RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469781.5

C1orf35-203, Transcript of chromosome 1 open reading frame 35, humanhuman

TSL 2

Gene C1orf35, Length 2,256 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf35-203ENST00000469781 KDM5BQ9UGL1 1544 aa29.75■■■□□ 2.35
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C1orf35-203ENST00000469781 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa29.75■■■□□ 2.35
C1orf35-203ENST00000469781 ABCC5O15440 1437 aa29.74■■■□□ 2.35
C1orf35-203ENST00000469781 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP29.73■■■□□ 2.35
C1orf35-203ENST00000469781 PLB1Q6P1J6 1458 aa29.71■■■□□ 2.35
C1orf35-203ENST00000469781 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP29.71■■■□□ 2.35
C1orf35-203ENST00000469781 ANP32CO43423 234 aa29.7■■■□□ 2.35
C1orf35-203ENST00000469781 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP29.7■■■□□ 2.35
C1orf35-203ENST00000469781 CCER2I3L3R5 266 aa29.64■■■□□ 2.33
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C1orf35-203ENST00000469781 ITSN2Q9NZM3 1697 aa29.62■■■□□ 2.33
C1orf35-203ENST00000469781 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa29.61■■■□□ 2.33
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C1orf35-203ENST00000469781 ADCY10Q96PN6 1610 aa29.59■■■□□ 2.33
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C1orf35-203ENST00000469781 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP29.57■■■□□ 2.32
C1orf35-203ENST00000469781 KIF14Q15058 1648 aa29.56■■■□□ 2.32
C1orf35-203ENST00000469781 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa29.54■■■□□ 2.32
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C1orf35-203ENST00000469781 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP29.53■■■□□ 2.32
C1orf35-203ENST00000469781 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP29.52■■■□□ 2.32
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C1orf35-203ENST00000469781 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP29.51■■■□□ 2.31
C1orf35-203ENST00000469781 ABCA8O94911 1581 aa29.49■■■□□ 2.31
C1orf35-203ENST00000469781 NCOA1Q15788 1441 aa29.49■■■□□ 2.31
C1orf35-203ENST00000469781 PLEKHD1A6NEE1 506 aa29.48■■■□□ 2.31
C1orf35-203ENST00000469781 ADGBQ8N7X0 1667 aa29.48■■■□□ 2.31
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C1orf35-203ENST00000469781 SHROOM2Q13796 1616 aa29.46■■■□□ 2.31
C1orf35-203ENST00000469781 ADGRL2O95490 1459 aa29.45■■■□□ 2.3
C1orf35-203ENST00000469781 CROCC2H7BZ55 1655 aa29.43■■■□□ 2.3
C1orf35-203ENST00000469781 WASHC2AQ641Q2 1341 aa29.43■■■□□ 2.3
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C1orf35-203ENST00000469781 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa29.42■■■□□ 2.3
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C1orf35-203ENST00000469781 TEX14Q8IWB6 1497 aa29.42■■■□□ 2.3
C1orf35-203ENST00000469781 PZPP20742 1482 aa29.41■■■□□ 2.3
C1orf35-203ENST00000469781 ABCC10Q5T3U5 1492 aa29.37■■■□□ 2.29
C1orf35-203ENST00000469781 ERCC6L2Q5T890 1561 aa29.34■■■□□ 2.29
C1orf35-203ENST00000469781 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa29.34■■■□□ 2.29
C1orf35-203ENST00000469781 NBPF8Q3BBV2 869 aa29.34■■■□□ 2.29
C1orf35-203ENST00000469781 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa29.32■■■□□ 2.28
C1orf35-203ENST00000469781 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa29.31■■■□□ 2.28
C1orf35-203ENST00000469781 SHANK2Q9UPX8 1470 aa29.31■■■□□ 2.28
C1orf35-203ENST00000469781 OSCARQ8IYS5 282 aa29.3■■■□□ 2.28
C1orf35-203ENST00000469781 C9orf84Q5VXU9 1444 aa29.28■■■□□ 2.28
C1orf35-203ENST00000469781 CNTLNQ9NXG0 1405 aa29.28■■■□□ 2.28
C1orf35-203ENST00000469781 PKD2Q13563 968 aa29.26■■■□□ 2.27
C1orf35-203ENST00000469781 CCDC7Q96M83 1385 aa29.26■■■□□ 2.27
C1orf35-203ENST00000469781 TSPY4P0CV99 314 aa29.25■■■□□ 2.27
C1orf35-203ENST00000469781 TSPY10P0CW01 314 aa29.25■■■□□ 2.27
C1orf35-203ENST00000469781 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP29.22■■■□□ 2.27
C1orf35-203ENST00000469781 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa29.19■■■□□ 2.26
C1orf35-203ENST00000469781 FKBP8Q14318 412 aa29.19■■■□□ 2.26
C1orf35-203ENST00000469781 NUP155O75694 1391 aa29.19■■■□□ 2.26
C1orf35-203ENST00000469781 MBD5Q9P267 1494 aa29.17■■■□□ 2.26
C1orf35-203ENST00000469781 NEFLP07196 543 aa29.17■■■□□ 2.26
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C1orf35-203ENST00000469781 ARHGEF5Q12774 1597 aa29.16■■■□□ 2.26
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C1orf35-203ENST00000469781 KIF7Q2M1P5 1343 aa29.12■■■□□ 2.25
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C1orf35-203ENST00000469781 ABCC2Q92887 1545 aa29.11■■■□□ 2.25
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C1orf35-203ENST00000469781 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP29.1■■■□□ 2.25
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C1orf35-203ENST00000469781 PREX2Q70Z35 1606 aa29.1■■■□□ 2.25
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C1orf35-203ENST00000469781 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa29.05■■■□□ 2.24
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C1orf35-203ENST00000469781 TTC37Q6PGP7 1564 aa28.97■■■□□ 2.23
C1orf35-203ENST00000469781 SYCP2Q9BX26 1530 aa28.97■■■□□ 2.23
C1orf35-203ENST00000469781 MRS2Q9HD23 443 aa28.96■■■□□ 2.23
C1orf35-203ENST00000469781 RALGAPBQ86X10 1494 aa28.96■■■□□ 2.23
C1orf35-203ENST00000469781 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP28.96■■■□□ 2.23
C1orf35-203ENST00000469781 KDM5CP41229 1560 aa28.95■■■□□ 2.22
C1orf35-203ENST00000469781 FAM135AQ9P2D6 1515 aa28.93■■■□□ 2.22
C1orf35-203ENST00000469781 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa28.92■■■□□ 2.22
C1orf35-203ENST00000469781 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP28.92■■■□□ 2.22
C1orf35-203ENST00000469781 FAM9BQ8IZU0 186 aa28.91■■■□□ 2.22
C1orf35-203ENST00000469781 MAST1Q9Y2H9 1570 aa28.9■■■□□ 2.22
C1orf35-203ENST00000469781 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP28.9■■■□□ 2.22
C1orf35-203ENST00000469781 POLR3GLQ9BT43 218 aa28.9■■■□□ 2.22
C1orf35-203ENST00000469781 CARD11Q9BXL7 1154 aa28.9■■■□□ 2.22
C1orf35-203ENST00000469781 BCORL1Q5H9F3 1711 aa28.9■■■□□ 2.22
C1orf35-203ENST00000469781 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa28.89■■■□□ 2.21
C1orf35-203ENST00000469781 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa28.89■■■□□ 2.21
C1orf35-203ENST00000469781 DCAF11Q8TEB1 546 aa28.87■■■□□ 2.21
C1orf35-203ENST00000469781 MYO5CQ9NQX4 1742 aa28.86■■■□□ 2.21
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