RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466596.5

HS3ST3B1-202, Transcript of heparan sulfate-glucosamine 3-sulfotransferase 3B1, humanhuman

TSL 2

Gene HS3ST3B1, Length 2,808 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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HS3ST3B1-202ENST00000466596 CCDC136Q96JN2 1154 aa20.34■□□□□ 0.85
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HS3ST3B1-202ENST00000466596 ERCC6Q03468 1493 aa20.29■□□□□ 0.84
HS3ST3B1-202ENST00000466596 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
HS3ST3B1-202ENST00000466596 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
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HS3ST3B1-202ENST00000466596 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa20.27■□□□□ 0.84
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HS3ST3B1-202ENST00000466596 BCORL1Q5H9F3 1711 aa20.18■□□□□ 0.82
HS3ST3B1-202ENST00000466596 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa20.17■□□□□ 0.82
HS3ST3B1-202ENST00000466596 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa20.17■□□□□ 0.82
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HS3ST3B1-202ENST00000466596 TMC1Q8TDI8 760 aa20.16■□□□□ 0.82
HS3ST3B1-202ENST00000466596 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
HS3ST3B1-202ENST00000466596 SYNJ2O15056 1496 aa20.15■□□□□ 0.82
HS3ST3B1-202ENST00000466596 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
HS3ST3B1-202ENST00000466596 RNF123Q5XPI4 1314 aa20.14■□□□□ 0.82
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HS3ST3B1-202ENST00000466596 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
HS3ST3B1-202ENST00000466596 CARD11Q9BXL7 1154 aa20.12■□□□□ 0.81
HS3ST3B1-202ENST00000466596 EXOC6Q8TAG9 804 aa20.12■□□□□ 0.81
HS3ST3B1-202ENST00000466596 DCAF11Q8TEB1 546 aa20.12■□□□□ 0.81
HS3ST3B1-202ENST00000466596 ATP10BO94823 1461 aa20.11■□□□□ 0.81
HS3ST3B1-202ENST00000466596 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
HS3ST3B1-202ENST00000466596 MBD5Q9P267 1494 aa20.11■□□□□ 0.81
HS3ST3B1-202ENST00000466596 C9orf84Q5VXU9 1444 aa20.1■□□□□ 0.81
HS3ST3B1-202ENST00000466596 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa20.1■□□□□ 0.81
HS3ST3B1-202ENST00000466596 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa20.1■□□□□ 0.81
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HS3ST3B1-202ENST00000466596 ADGBQ8N7X0 1667 aa20.08■□□□□ 0.81
HS3ST3B1-202ENST00000466596 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP20.08■□□□□ 0.82e-6■□□□□ 10.6
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