RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465306.1

TNS1-213, Transcript of tensin 1, humanhuman

TSL 5

Gene TNS1, Length 393 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-213ENST00000465306 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa16.92■□□□□ 0.3
TNS1-213ENST00000465306 MLECQ14165 292 aa16.92■□□□□ 0.3
TNS1-213ENST00000465306 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa16.91■□□□□ 0.3
TNS1-213ENST00000465306 RICTORQ6R327 1708 aa16.91■□□□□ 0.3
TNS1-213ENST00000465306 ATP10AO60312 1499 aa16.9■□□□□ 0.3
TNS1-213ENST00000465306 BCORL1Q5H9F3 1711 aa16.9■□□□□ 0.3
TNS1-213ENST00000465306 MYT1LQ9UL68 1186 aa16.89■□□□□ 0.29
TNS1-213ENST00000465306 CCDC18Q5T9S5 1454 aa16.87■□□□□ 0.29
TNS1-213ENST00000465306 PLPPR3Q6T4P5 718 aa16.87■□□□□ 0.29
TNS1-213ENST00000465306 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa16.86■□□□□ 0.29
TNS1-213ENST00000465306 ARHGAP5Q13017 1502 aa16.86■□□□□ 0.29
TNS1-213ENST00000465306 KIF14Q15058 1648 aa16.86■□□□□ 0.29
TNS1-213ENST00000465306 MADDQ8WXG6 1647 aa16.85■□□□□ 0.29
TNS1-213ENST00000465306 C9orf84Q5VXU9 1444 aa16.84■□□□□ 0.29
TNS1-213ENST00000465306 LMTK3Q96Q04 1460 aa16.81■□□□□ 0.28
TNS1-213ENST00000465306 FYCO1Q9BQS8 1478 aa16.81■□□□□ 0.28
TNS1-213ENST00000465306 HSPA2P54652 639 aa16.81■□□□□ 0.28
TNS1-213ENST00000465306 MYO5CQ9NQX4 1742 aa16.81■□□□□ 0.28
TNS1-213ENST00000465306 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP16.8■□□□□ 0.28
TNS1-213ENST00000465306 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
TNS1-213ENST00000465306 MLH3Q9UHC1 1453 aa16.8■□□□□ 0.28
TNS1-213ENST00000465306 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP16.79■□□□□ 0.28
TNS1-213ENST00000465306 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa16.79■□□□□ 0.28
TNS1-213ENST00000465306 FBXO41Q8TF61 875 aa16.77■□□□□ 0.28
TNS1-213ENST00000465306 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.28
TNS1-213ENST00000465306 KDM5CP41229 1560 aa16.77■□□□□ 0.27
TNS1-213ENST00000465306 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa16.76■□□□□ 0.27
TNS1-213ENST00000465306 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
TNS1-213ENST00000465306 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
TNS1-213ENST00000465306 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP16.75■□□□□ 0.27
TNS1-213ENST00000465306 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa16.75■□□□□ 0.27
TNS1-213ENST00000465306 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa16.74■□□□□ 0.27
TNS1-213ENST00000465306 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
TNS1-213ENST00000465306 MTUS2Q5JR59 1369 aa16.73■□□□□ 0.27
TNS1-213ENST00000465306 CCNB3Q8WWL7 1395 aa16.73■□□□□ 0.27
TNS1-213ENST00000465306 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
TNS1-213ENST00000465306 ABCC1P33527 1531 aa16.71■□□□□ 0.27
TNS1-213ENST00000465306 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa16.7■□□□□ 0.26
TNS1-213ENST00000465306 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa16.7■□□□□ 0.26
TNS1-213ENST00000465306 PREX2Q70Z35 1606 aa16.7■□□□□ 0.26
TNS1-213ENST00000465306 AGLP35573 1532 aa16.69■□□□□ 0.26
TNS1-213ENST00000465306 REREQ9P2R6 1566 aa16.68■□□□□ 0.26
TNS1-213ENST00000465306 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa16.68■□□□□ 0.26
TNS1-213ENST00000465306 DMRT2Q9Y5R5 561 aa16.68■□□□□ 0.26
TNS1-213ENST00000465306 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa16.67■□□□□ 0.26
TNS1-213ENST00000465306 CEP162Q5TB80 1403 aa16.65■□□□□ 0.26
TNS1-213ENST00000465306 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa16.65■□□□□ 0.26
TNS1-213ENST00000465306 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
TNS1-213ENST00000465306 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa16.63■□□□□ 0.25
TNS1-213ENST00000465306 CNTLNQ9NXG0 1405 aa16.63■□□□□ 0.25
TNS1-213ENST00000465306 CERKQ8TCT0 537 aa16.63■□□□□ 0.25
TNS1-213ENST00000465306 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa16.63■□□□□ 0.25
TNS1-213ENST00000465306 ABCA6Q8N139 1617 aa16.63■□□□□ 0.25
TNS1-213ENST00000465306 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa16.62■□□□□ 0.25
TNS1-213ENST00000465306 PPP6R1Q9UPN7 881 aa16.62■□□□□ 0.25
TNS1-213ENST00000465306 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa16.62■□□□□ 0.25
TNS1-213ENST00000465306 SYCP2Q9BX26 1530 aa16.61■□□□□ 0.25
TNS1-213ENST00000465306 ITSN2Q9NZM3 1697 aa16.61■□□□□ 0.25
TNS1-213ENST00000465306 ZMYM3Q14202 1370 aa16.61■□□□□ 0.25
TNS1-213ENST00000465306 RSPH4AQ5TD94 716 aa16.6■□□□□ 0.25
TNS1-213ENST00000465306 GGT6Q6P531 493 aa16.6■□□□□ 0.25
TNS1-213ENST00000465306 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa16.59■□□□□ 0.25
TNS1-213ENST00000465306 A2MP01023 1474 aa16.57■□□□□ 0.24
TNS1-213ENST00000465306 MBD5Q9P267 1494 aa16.57■□□□□ 0.24
TNS1-213ENST00000465306 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
TNS1-213ENST00000465306 ATP7AQ04656 1500 aa16.55■□□□□ 0.24
TNS1-213ENST00000465306 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa16.55■□□□□ 0.24
TNS1-213ENST00000465306 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa16.55■□□□□ 0.24
TNS1-213ENST00000465306 NPATQ14207 1427 aa16.54■□□□□ 0.24
TNS1-213ENST00000465306 PREX1Q8TCU6 1659 aa16.54■□□□□ 0.24
TNS1-213ENST00000465306 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
TNS1-213ENST00000465306 TSPY4P0CV99 314 aa16.52■□□□□ 0.24
TNS1-213ENST00000465306 TSPY10P0CW01 314 aa16.52■□□□□ 0.24
TNS1-213ENST00000465306 PTPRTO14522 1441 aa16.52■□□□□ 0.23
TNS1-213ENST00000465306 TIAM1Q13009 1591 aa16.51■□□□□ 0.23
TNS1-213ENST00000465306 NCOA2Q15596 1464 aa16.51■□□□□ 0.23
TNS1-213ENST00000465306 KIF3BO15066 747 aa16.5■□□□□ 0.23
TNS1-213ENST00000465306 C3P01024 1663 aa16.5■□□□□ 0.23
TNS1-213ENST00000465306 VPS8Q8N3P4 1428 aa16.49■□□□□ 0.23
TNS1-213ENST00000465306 PLXNC1O60486 1568 aa16.48■□□□□ 0.23
TNS1-213ENST00000465306 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
TNS1-213ENST00000465306 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
TNS1-213ENST00000465306 PTPRKQ15262 1439 aa16.46■□□□□ 0.23
TNS1-213ENST00000465306 NCOA1Q15788 1441 aa16.46■□□□□ 0.23
TNS1-213ENST00000465306 PKD2Q13563 968 aa16.46■□□□□ 0.23
TNS1-213ENST00000465306 CCDC141Q6ZP82 1450 aa16.46■□□□□ 0.23
TNS1-213ENST00000465306 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa16.45■□□□□ 0.22
TNS1-213ENST00000465306 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa16.45■□□□□ 0.22
TNS1-213ENST00000465306 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
TNS1-213ENST00000465306 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa16.45■□□□□ 0.22
TNS1-213ENST00000465306 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa16.44■□□□□ 0.22
TNS1-213ENST00000465306 STRCQ7RTU9 1775 aa16.43■□□□□ 0.22
TNS1-213ENST00000465306 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
TNS1-213ENST00000465306 MROH2AA6NES4 1674 aa16.42■□□□□ 0.22
TNS1-213ENST00000465306 APLP2Q06481 763 aa16.41■□□□□ 0.22
TNS1-213ENST00000465306 MAP3K1Q13233 1512 aa16.4■□□□□ 0.22
TNS1-213ENST00000465306 ADGBQ8N7X0 1667 aa16.4■□□□□ 0.22
TNS1-213ENST00000465306 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa16.39■□□□□ 0.21
TNS1-213ENST00000465306 MIA2Q96PC5 1412 aa16.38■□□□□ 0.21
TNS1-213ENST00000465306 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.2 ms