RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461214.1

COL5A3-202, Transcript of collagen type V alpha 3 chain, humanhuman

TSL 3

Gene COL5A3, Length 828 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A3-202ENST00000461214 DISP3Q9P2K9 1392 aa22.58■■□□□ 1.21
COL5A3-202ENST00000461214 MADDQ8WXG6 1647 aa22.57■■□□□ 1.2
COL5A3-202ENST00000461214 RAPGEF3O95398 923 aa22.57■■□□□ 1.2
COL5A3-202ENST00000461214 APLP2Q06481 763 aa22.57■■□□□ 1.2
COL5A3-202ENST00000461214 TTC37Q6PGP7 1564 aa22.57■■□□□ 1.2
COL5A3-202ENST00000461214 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.56■■□□□ 1.2
COL5A3-202ENST00000461214 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
COL5A3-202ENST00000461214 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
COL5A3-202ENST00000461214 PREX2Q70Z35 1606 aa22.56■■□□□ 1.2
COL5A3-202ENST00000461214 CERKQ8TCT0 537 aa22.55■■□□□ 1.2
COL5A3-202ENST00000461214 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP22.54■■□□□ 1.2
COL5A3-202ENST00000461214 SOCS7O14512 581 aa22.54■■□□□ 1.2
COL5A3-202ENST00000461214 PLEKHD1A6NEE1 506 aa22.53■■□□□ 1.2
COL5A3-202ENST00000461214 BCORL1Q5H9F3 1711 aa22.53■■□□□ 1.2
COL5A3-202ENST00000461214 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa22.51■■□□□ 1.19
COL5A3-202ENST00000461214 CFAP74Q9C0B2 1584 aa22.5■■□□□ 1.19
COL5A3-202ENST00000461214 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
COL5A3-202ENST00000461214 NCOA2Q15596 1464 aa22.47■■□□□ 1.19
COL5A3-202ENST00000461214 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.44■■□□□ 1.18
COL5A3-202ENST00000461214 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
COL5A3-202ENST00000461214 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa22.39■■□□□ 1.18
COL5A3-202ENST00000461214 NEO1Q92859 1461 aa22.37■■□□□ 1.17
COL5A3-202ENST00000461214 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.34■■□□□ 1.17
COL5A3-202ENST00000461214 ARHGAP5Q13017 1502 aa22.34■■□□□ 1.17
COL5A3-202ENST00000461214 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
COL5A3-202ENST00000461214 MLECQ14165 292 aa22.33■■□□□ 1.17
COL5A3-202ENST00000461214 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.33■■□□□ 1.17
COL5A3-202ENST00000461214 PLCH2O75038 1416 aa22.31■■□□□ 1.16
COL5A3-202ENST00000461214 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa22.31■■□□□ 1.16
COL5A3-202ENST00000461214 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.31■■□□□ 1.16
COL5A3-202ENST00000461214 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa22.31■■□□□ 1.16
COL5A3-202ENST00000461214 MIA2Q96PC5 1412 aa22.29■■□□□ 1.16
COL5A3-202ENST00000461214 CROCC2H7BZ55 1655 aa22.29■■□□□ 1.16
COL5A3-202ENST00000461214 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa22.29■■□□□ 1.16
COL5A3-202ENST00000461214 FANCAO15360 1455 aa22.28■■□□□ 1.16
COL5A3-202ENST00000461214 ABCC1P33527 1531 aa22.28■■□□□ 1.16
COL5A3-202ENST00000461214 POGZQ7Z3K3 1410 aa22.28■■□□□ 1.16
COL5A3-202ENST00000461214 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
COL5A3-202ENST00000461214 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.25■■□□□ 1.15
COL5A3-202ENST00000461214 RICTORQ6R327 1708 aa22.24■■□□□ 1.15
COL5A3-202ENST00000461214 AKNAQ7Z591 1439 aa22.23■■□□□ 1.15
COL5A3-202ENST00000461214 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa22.23■■□□□ 1.15
COL5A3-202ENST00000461214 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
COL5A3-202ENST00000461214 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa22.23■■□□□ 1.15
COL5A3-202ENST00000461214 ARHGEF5Q12774 1597 aa22.21■■□□□ 1.15
COL5A3-202ENST00000461214 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.15
COL5A3-202ENST00000461214 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa22.2■■□□□ 1.14
COL5A3-202ENST00000461214 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
COL5A3-202ENST00000461214 YEATS2Q9ULM3 1422 aa22.2■■□□□ 1.14
COL5A3-202ENST00000461214 SYCP2Q9BX26 1530 aa22.19■■□□□ 1.14
COL5A3-202ENST00000461214 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa22.19■■□□□ 1.14
COL5A3-202ENST00000461214 ADGBQ8N7X0 1667 aa22.17■■□□□ 1.14
COL5A3-202ENST00000461214 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa22.17■■□□□ 1.14
COL5A3-202ENST00000461214 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
COL5A3-202ENST00000461214 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
COL5A3-202ENST00000461214 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
COL5A3-202ENST00000461214 DMRT2Q9Y5R5 561 aa22.15■■□□□ 1.14
COL5A3-202ENST00000461214 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa22.14■■□□□ 1.13
COL5A3-202ENST00000461214 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa22.14■■□□□ 1.13
COL5A3-202ENST00000461214 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP22.13■■□□□ 1.13
COL5A3-202ENST00000461214 KDM5CP41229 1560 aa22.13■■□□□ 1.13
COL5A3-202ENST00000461214 PREX1Q8TCU6 1659 aa22.12■■□□□ 1.13
COL5A3-202ENST00000461214 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
COL5A3-202ENST00000461214 MAST1Q9Y2H9 1570 aa22.11■■□□□ 1.13
COL5A3-202ENST00000461214 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa22.11■■□□□ 1.13
COL5A3-202ENST00000461214 STRCQ7RTU9 1775 aa22.1■■□□□ 1.13
COL5A3-202ENST00000461214 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa22.09■■□□□ 1.13
COL5A3-202ENST00000461214 CCDC141Q6ZP82 1450 aa22.09■■□□□ 1.13
COL5A3-202ENST00000461214 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa22.08■■□□□ 1.13
COL5A3-202ENST00000461214 MBD5Q9P267 1494 aa22.08■■□□□ 1.12
COL5A3-202ENST00000461214 SHANK2Q9UPX8 1470 aa22.08■■□□□ 1.12
COL5A3-202ENST00000461214 PLXNC1O60486 1568 aa22.05■■□□□ 1.12
COL5A3-202ENST00000461214 MAGI2Q86UL8 1455 aa22.05■■□□□ 1.12
COL5A3-202ENST00000461214 SCAPERQ9BY12 1400 aa22.05■■□□□ 1.12
COL5A3-202ENST00000461214 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa22.04■■□□□ 1.12
COL5A3-202ENST00000461214 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa22.04■■□□□ 1.12
COL5A3-202ENST00000461214 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
COL5A3-202ENST00000461214 DAPK1P53355 1430 aa22.02■■□□□ 1.12
COL5A3-202ENST00000461214 GCC2Q8IWJ2 1684 aa22.01■■□□□ 1.11
COL5A3-202ENST00000461214 ATP7AQ04656 1500 aa22.01■■□□□ 1.11
COL5A3-202ENST00000461214 ATP10AO60312 1499 aa22■■□□□ 1.11
COL5A3-202ENST00000461214 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
COL5A3-202ENST00000461214 C9orf84Q5VXU9 1444 aa21.98■■□□□ 1.11
COL5A3-202ENST00000461214 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa21.98■■□□□ 1.11
COL5A3-202ENST00000461214 ABCA6Q8N139 1617 aa21.98■■□□□ 1.11
COL5A3-202ENST00000461214 RSPH4AQ5TD94 716 aa21.97■■□□□ 1.11
COL5A3-202ENST00000461214 PTPRTO14522 1441 aa21.97■■□□□ 1.11
COL5A3-202ENST00000461214 ABCC5O15440 1437 aa21.96■■□□□ 1.11
COL5A3-202ENST00000461214 MLH3Q9UHC1 1453 aa21.96■■□□□ 1.11
COL5A3-202ENST00000461214 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
COL5A3-202ENST00000461214 MYT1LQ9UL68 1186 aa21.95■■□□□ 1.1
COL5A3-202ENST00000461214 ADGRL2O95490 1459 aa21.95■■□□□ 1.1
COL5A3-202ENST00000461214 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa21.94■■□□□ 1.1
COL5A3-202ENST00000461214 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa21.94■■□□□ 1.1
COL5A3-202ENST00000461214 LTBP4Q8N2S1 1624 aa21.94■■□□□ 1.1
COL5A3-202ENST00000461214 REREQ9P2R6 1566 aa21.92■■□□□ 1.1
COL5A3-202ENST00000461214 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
COL5A3-202ENST00000461214 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP21.9■■□□□ 1.1
COL5A3-202ENST00000461214 UBAP1LF5GYI3 381 aa21.88■■□□□ 1.09
COL5A3-202ENST00000461214 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
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