RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000458666.1

LMCD1-AS1-207, LMCD1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene LMCD1-AS1, Length 581 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 AFAP1Q8N556 730 aa16.7■□□□□ 0.26
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 YEATS2Q9ULM3 1422 aa16.7■□□□□ 0.26
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 PLPPR3Q6T4P5 718 aa16.69■□□□□ 0.26
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa16.69■□□□□ 0.26
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa16.68■□□□□ 0.26
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 PTPRMP28827 1452 aa16.67■□□□□ 0.26
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 MTUS2Q5JR59 1369 aa16.66■□□□□ 0.26
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LMCD1-AS1-207ENST00000458666 CEP162Q5TB80 1403 aa16.66■□□□□ 0.26
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LMCD1-AS1-207ENST00000458666 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa16.63■□□□□ 0.25
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
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LMCD1-AS1-207ENST00000458666 HECW2Q9P2P5 1572 aa16.62■□□□□ 0.25
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 CCNB3Q8WWL7 1395 aa16.62■□□□□ 0.25
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 C9orf84Q5VXU9 1444 aa16.62■□□□□ 0.25
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LMCD1-AS1-207ENST00000458666 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa16.56■□□□□ 0.24
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LMCD1-AS1-207ENST00000458666 MLH3Q9UHC1 1453 aa16.54■□□□□ 0.24
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 PREX2Q70Z35 1606 aa16.53■□□□□ 0.24
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 ABCC1P33527 1531 aa16.53■□□□□ 0.24
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa16.53■□□□□ 0.24
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 KDM5CP41229 1560 aa16.52■□□□□ 0.24
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa16.52■□□□□ 0.23
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LMCD1-AS1-207ENST00000458666 HSPA2P54652 639 aa16.49■□□□□ 0.23
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LMCD1-AS1-207ENST00000458666 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa16.48■□□□□ 0.23
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 SYCP2Q9BX26 1530 aa16.48■□□□□ 0.23
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 VPS8Q8N3P4 1428 aa16.46■□□□□ 0.23
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 APLP2Q06481 763 aa16.46■□□□□ 0.23
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa16.46■□□□□ 0.23
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 LMTK3Q96Q04 1460 aa16.45■□□□□ 0.22
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa16.44■□□□□ 0.22
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa16.43■□□□□ 0.22
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa16.43■□□□□ 0.22
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 ITSN2Q9NZM3 1697 aa16.42■□□□□ 0.22
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LMCD1-AS1-207ENST00000458666 TIAM1Q13009 1591 aa16.39■□□□□ 0.21
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 CNTLNQ9NXG0 1405 aa16.39■□□□□ 0.21
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 TSPY4P0CV99 314 aa16.39■□□□□ 0.21
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 TSPY10P0CW01 314 aa16.39■□□□□ 0.21
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LMCD1-AS1-207ENST00000458666 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa16.38■□□□□ 0.21
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa16.38■□□□□ 0.21
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 A2MP01023 1474 aa16.38■□□□□ 0.21
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
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LMCD1-AS1-207ENST00000458666 MBD5Q9P267 1494 aa16.36■□□□□ 0.21
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa16.36■□□□□ 0.21
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 DMRT2Q9Y5R5 561 aa16.34■□□□□ 0.21
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 ZMYM3Q14202 1370 aa16.34■□□□□ 0.21
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa16.34■□□□□ 0.21
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa16.34■□□□□ 0.21
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 CCDC141Q6ZP82 1450 aa16.34■□□□□ 0.21
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LMCD1-AS1-207ENST00000458666 KIF3BO15066 747 aa16.32■□□□□ 0.2
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP16.3■□□□□ 0.2
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 FBXO41Q8TF61 875 aa16.3■□□□□ 0.2
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 MAP3K1Q13233 1512 aa16.29■□□□□ 0.2
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa16.27■□□□□ 0.2
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 NPATQ14207 1427 aa16.27■□□□□ 0.19
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 MYOM3Q5VTT5 1437 aa16.27■□□□□ 0.19
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 MIA2Q96PC5 1412 aa16.26■□□□□ 0.19
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 PLXNC1O60486 1568 aa16.26■□□□□ 0.19
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 PREX1Q8TCU6 1659 aa16.24■□□□□ 0.19
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 CERKQ8TCT0 537 aa16.22■□□□□ 0.19
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 C3P01024 1663 aa16.21■□□□□ 0.18
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 PTPRKQ15262 1439 aa16.2■□□□□ 0.18
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 ARHGEF5Q12774 1597 aa16.2■□□□□ 0.18
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 ADGBQ8N7X0 1667 aa16.2■□□□□ 0.18
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa16.18■□□□□ 0.18
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa16.17■□□□□ 0.18
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 TNRQ92752 1358 aa16.16■□□□□ 0.18
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 MROH2AA6NES4 1674 aa16.16■□□□□ 0.18
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 PTPRTO14522 1441 aa16.16■□□□□ 0.18
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 NCOA1Q15788 1441 aa16.16■□□□□ 0.18
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
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