RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449704.5

TOP3B-211, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 3

Gene TOP3B, Length 543 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-211ENST00000449704 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
TOP3B-211ENST00000449704 SCAPERQ9BY12 1400 aa24.66■■□□□ 1.54
TOP3B-211ENST00000449704 CFAP74Q9C0B2 1584 aa24.66■■□□□ 1.54
TOP3B-211ENST00000449704 MYO5CQ9NQX4 1742 aa24.66■■□□□ 1.54
TOP3B-211ENST00000449704 ADGRL1O94910 1474 aa24.65■■□□□ 1.54
TOP3B-211ENST00000449704 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.54
TOP3B-211ENST00000449704 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
TOP3B-211ENST00000449704 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa24.63■■□□□ 1.53
TOP3B-211ENST00000449704 MAP3K1Q13233 1512 aa24.62■■□□□ 1.53
TOP3B-211ENST00000449704 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa24.6■■□□□ 1.53
TOP3B-211ENST00000449704 NCOA2Q15596 1464 aa24.58■■□□□ 1.52
TOP3B-211ENST00000449704 PREX2Q70Z35 1606 aa24.57■■□□□ 1.52
TOP3B-211ENST00000449704 POGZQ7Z3K3 1410 aa24.56■■□□□ 1.52
TOP3B-211ENST00000449704 AFAP1Q8N556 730 aa24.56■■□□□ 1.52
TOP3B-211ENST00000449704 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa24.55■■□□□ 1.52
TOP3B-211ENST00000449704 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa24.54■■□□□ 1.52
TOP3B-211ENST00000449704 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa24.53■■□□□ 1.52
TOP3B-211ENST00000449704 MYT1LQ9UL68 1186 aa24.53■■□□□ 1.52
TOP3B-211ENST00000449704 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
TOP3B-211ENST00000449704 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP24.51■■□□□ 1.512e-6■■■■■ 28.8
TOP3B-211ENST00000449704 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
TOP3B-211ENST00000449704 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa24.49■■□□□ 1.51
TOP3B-211ENST00000449704 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa24.49■■□□□ 1.51
TOP3B-211ENST00000449704 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa24.48■■□□□ 1.51
TOP3B-211ENST00000449704 RICTORQ6R327 1708 aa24.48■■□□□ 1.51
TOP3B-211ENST00000449704 ABCC1P33527 1531 aa24.47■■□□□ 1.51
TOP3B-211ENST00000449704 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
TOP3B-211ENST00000449704 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa24.46■■□□□ 1.51
TOP3B-211ENST00000449704 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa24.45■■□□□ 1.51
TOP3B-211ENST00000449704 YEATS2Q9ULM3 1422 aa24.44■■□□□ 1.5
TOP3B-211ENST00000449704 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa24.44■■□□□ 1.5
TOP3B-211ENST00000449704 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa24.44■■□□□ 1.5
TOP3B-211ENST00000449704 MAGI2Q86UL8 1455 aa24.44■■□□□ 1.5
TOP3B-211ENST00000449704 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
TOP3B-211ENST00000449704 SYCP2Q9BX26 1530 aa24.42■■□□□ 1.5
TOP3B-211ENST00000449704 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa24.41■■□□□ 1.5
TOP3B-211ENST00000449704 ITSN2Q9NZM3 1697 aa24.41■■□□□ 1.5
TOP3B-211ENST00000449704 MYOM3Q5VTT5 1437 aa24.4■■□□□ 1.5
TOP3B-211ENST00000449704 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.5
TOP3B-211ENST00000449704 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
TOP3B-211ENST00000449704 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa24.38■■□□□ 1.49
TOP3B-211ENST00000449704 KDM5CP41229 1560 aa24.37■■□□□ 1.49
TOP3B-211ENST00000449704 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa24.36■■□□□ 1.49
TOP3B-211ENST00000449704 MLH3Q9UHC1 1453 aa24.35■■□□□ 1.49
TOP3B-211ENST00000449704 ATP10AO60312 1499 aa24.34■■□□□ 1.49
TOP3B-211ENST00000449704 MBD5Q9P267 1494 aa24.34■■□□□ 1.49
TOP3B-211ENST00000449704 MIA2Q96PC5 1412 aa24.34■■□□□ 1.49
TOP3B-211ENST00000449704 RSPH4AQ5TD94 716 aa24.32■■□□□ 1.48
TOP3B-211ENST00000449704 HECW2Q9P2P5 1572 aa24.32■■□□□ 1.48
TOP3B-211ENST00000449704 C9orf84Q5VXU9 1444 aa24.3■■□□□ 1.48
TOP3B-211ENST00000449704 MLECQ14165 292 aa24.29■■□□□ 1.48
TOP3B-211ENST00000449704 TSPY4P0CV99 314 aa24.28■■□□□ 1.48
TOP3B-211ENST00000449704 TSPY10P0CW01 314 aa24.28■■□□□ 1.48
TOP3B-211ENST00000449704 CCDC141Q6ZP82 1450 aa24.26■■□□□ 1.47
TOP3B-211ENST00000449704 FGD6Q6ZV73 1430 aa24.26■■□□□ 1.47
TOP3B-211ENST00000449704 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa24.25■■□□□ 1.47
TOP3B-211ENST00000449704 ATP7AQ04656 1500 aa24.23■■□□□ 1.47
TOP3B-211ENST00000449704 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa24.21■■□□□ 1.47
TOP3B-211ENST00000449704 ABCA6Q8N139 1617 aa24.21■■□□□ 1.47
TOP3B-211ENST00000449704 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
TOP3B-211ENST00000449704 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa24.2■■□□□ 1.46
TOP3B-211ENST00000449704 ARHGEF5Q12774 1597 aa24.19■■□□□ 1.46
TOP3B-211ENST00000449704 PTPN23Q9H3S7 1636 aa24.18■■□□□ 1.46
TOP3B-211ENST00000449704 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
TOP3B-211ENST00000449704 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa24.16■■□□□ 1.46
TOP3B-211ENST00000449704 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
TOP3B-211ENST00000449704 A2MP01023 1474 aa24.15■■□□□ 1.46
TOP3B-211ENST00000449704 BCORL1Q5H9F3 1711 aa24.15■■□□□ 1.46
TOP3B-211ENST00000449704 REREQ9P2R6 1566 aa24.14■■□□□ 1.45
TOP3B-211ENST00000449704 ABCC5O15440 1437 aa24.13■■□□□ 1.45
TOP3B-211ENST00000449704 ADAMTSL3P82987 1691 aa24.11■■□□□ 1.45
TOP3B-211ENST00000449704 AGLP35573 1532 aa24.11■■□□□ 1.45
TOP3B-211ENST00000449704 PLPPR3Q6T4P5 718 aa24.11■■□□□ 1.45
TOP3B-211ENST00000449704 CHIC2Q9UKJ5 165 aa24.11■■□□□ 1.45
TOP3B-211ENST00000449704 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
TOP3B-211ENST00000449704 DAPK1P53355 1430 aa24.1■■□□□ 1.45
TOP3B-211ENST00000449704 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
TOP3B-211ENST00000449704 GGT6Q6P531 493 aa24.08■■□□□ 1.45
TOP3B-211ENST00000449704 MADDQ8WXG6 1647 aa24.08■■□□□ 1.45
TOP3B-211ENST00000449704 PTPRMP28827 1452 aa24.07■■□□□ 1.44
TOP3B-211ENST00000449704 KIF3BO15066 747 aa24.06■■□□□ 1.44
TOP3B-211ENST00000449704 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa24.06■■□□□ 1.44
TOP3B-211ENST00000449704 MAST1Q9Y2H9 1570 aa24.03■■□□□ 1.44
TOP3B-211ENST00000449704 SHANK2Q9UPX8 1470 aa24.03■■□□□ 1.44
TOP3B-211ENST00000449704 PLXNC1O60486 1568 aa24.03■■□□□ 1.44
TOP3B-211ENST00000449704 ADGBQ8N7X0 1667 aa24.02■■□□□ 1.44
TOP3B-211ENST00000449704 ITGAEP38570 1179 aa24.02■■□□□ 1.44
TOP3B-211ENST00000449704 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
TOP3B-211ENST00000449704 KIF15Q9NS87 1388 aa24.01■■□□□ 1.43
TOP3B-211ENST00000449704 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
TOP3B-211ENST00000449704 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa24■■□□□ 1.43
TOP3B-211ENST00000449704 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
TOP3B-211ENST00000449704 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP23.95■■□□□ 1.42
TOP3B-211ENST00000449704 PPP6R1Q9UPN7 881 aa23.95■■□□□ 1.42
TOP3B-211ENST00000449704 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa23.95■■□□□ 1.42
TOP3B-211ENST00000449704 NCOA1Q15788 1441 aa23.94■■□□□ 1.42
TOP3B-211ENST00000449704 CROCC2H7BZ55 1655 aa23.94■■□□□ 1.42
TOP3B-211ENST00000449704 PTPRKQ15262 1439 aa23.93■■□□□ 1.42
TOP3B-211ENST00000449704 CNTLNQ9NXG0 1405 aa23.93■■□□□ 1.42
TOP3B-211ENST00000449704 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8 ms