RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000443528.5

ACTB-206, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 4

Gene ACTB, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-206ENST00000443528 ADGRL1O94910 1474 aa24.89■■□□□ 1.57
ACTB-206ENST00000443528 PREX2Q70Z35 1606 aa24.88■■□□□ 1.57
ACTB-206ENST00000443528 SCAPERQ9BY12 1400 aa24.87■■□□□ 1.57
ACTB-206ENST00000443528 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
ACTB-206ENST00000443528 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa24.86■■□□□ 1.57
ACTB-206ENST00000443528 MAP3K1Q13233 1512 aa24.85■■□□□ 1.57
ACTB-206ENST00000443528 RICTORQ6R327 1708 aa24.84■■□□□ 1.57
ACTB-206ENST00000443528 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa24.83■■□□□ 1.56
ACTB-206ENST00000443528 CCNB3Q8WWL7 1395 aa24.82■■□□□ 1.56
ACTB-206ENST00000443528 POGZQ7Z3K3 1410 aa24.81■■□□□ 1.56
ACTB-206ENST00000443528 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
ACTB-206ENST00000443528 NCOA2Q15596 1464 aa24.77■■□□□ 1.56
ACTB-206ENST00000443528 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa24.77■■□□□ 1.56
ACTB-206ENST00000443528 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa24.76■■□□□ 1.55
ACTB-206ENST00000443528 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
ACTB-206ENST00000443528 ABCC1P33527 1531 aa24.76■■□□□ 1.55
ACTB-206ENST00000443528 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
ACTB-206ENST00000443528 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
ACTB-206ENST00000443528 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa24.74■■□□□ 1.55
ACTB-206ENST00000443528 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa24.74■■□□□ 1.55
ACTB-206ENST00000443528 AFAP1Q8N556 730 aa24.73■■□□□ 1.55
ACTB-206ENST00000443528 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa24.72■■□□□ 1.55
ACTB-206ENST00000443528 APLP2Q06481 763 aa24.72■■□□□ 1.55
ACTB-206ENST00000443528 YEATS2Q9ULM3 1422 aa24.71■■□□□ 1.55
ACTB-206ENST00000443528 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa24.71■■□□□ 1.55
ACTB-206ENST00000443528 MAGI2Q86UL8 1455 aa24.7■■□□□ 1.55
ACTB-206ENST00000443528 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa24.7■■□□□ 1.54
ACTB-206ENST00000443528 ITSN2Q9NZM3 1697 aa24.69■■□□□ 1.54
ACTB-206ENST00000443528 KDM5CP41229 1560 aa24.69■■□□□ 1.54
ACTB-206ENST00000443528 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa24.68■■□□□ 1.54
ACTB-206ENST00000443528 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
ACTB-206ENST00000443528 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP24.67■■□□□ 1.54
ACTB-206ENST00000443528 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa24.67■■□□□ 1.54
ACTB-206ENST00000443528 SYCP2Q9BX26 1530 aa24.66■■□□□ 1.54
ACTB-206ENST00000443528 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa24.65■■□□□ 1.54
ACTB-206ENST00000443528 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
ACTB-206ENST00000443528 MLH3Q9UHC1 1453 aa24.62■■□□□ 1.53
ACTB-206ENST00000443528 HECW2Q9P2P5 1572 aa24.6■■□□□ 1.53
ACTB-206ENST00000443528 MBD5Q9P267 1494 aa24.59■■□□□ 1.53
ACTB-206ENST00000443528 ATP10AO60312 1499 aa24.58■■□□□ 1.53
ACTB-206ENST00000443528 MYOM3Q5VTT5 1437 aa24.58■■□□□ 1.53
ACTB-206ENST00000443528 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa24.58■■□□□ 1.52
ACTB-206ENST00000443528 MYT1LQ9UL68 1186 aa24.57■■□□□ 1.52
ACTB-206ENST00000443528 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa24.57■■□□□ 1.52
ACTB-206ENST00000443528 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
ACTB-206ENST00000443528 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa24.55■■□□□ 1.52
ACTB-206ENST00000443528 C9orf84Q5VXU9 1444 aa24.54■■□□□ 1.52
ACTB-206ENST00000443528 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
ACTB-206ENST00000443528 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa24.54■■□□□ 1.52
ACTB-206ENST00000443528 ABCA6Q8N139 1617 aa24.53■■□□□ 1.52
ACTB-206ENST00000443528 MIA2Q96PC5 1412 aa24.53■■□□□ 1.52
ACTB-206ENST00000443528 BCORL1Q5H9F3 1711 aa24.51■■□□□ 1.51
ACTB-206ENST00000443528 ADAMTSL3P82987 1691 aa24.5■■□□□ 1.51
ACTB-206ENST00000443528 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
ACTB-206ENST00000443528 ATP7AQ04656 1500 aa24.48■■□□□ 1.51
ACTB-206ENST00000443528 REREQ9P2R6 1566 aa24.48■■□□□ 1.51
ACTB-206ENST00000443528 CCDC141Q6ZP82 1450 aa24.47■■□□□ 1.51
ACTB-206ENST00000443528 RSPH4AQ5TD94 716 aa24.47■■□□□ 1.51
ACTB-206ENST00000443528 ARHGEF5Q12774 1597 aa24.46■■□□□ 1.51
ACTB-206ENST00000443528 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa24.44■■□□□ 1.5
ACTB-206ENST00000443528 FGD6Q6ZV73 1430 aa24.44■■□□□ 1.5
ACTB-206ENST00000443528 MLECQ14165 292 aa24.43■■□□□ 1.5
ACTB-206ENST00000443528 MADDQ8WXG6 1647 aa24.41■■□□□ 1.5
ACTB-206ENST00000443528 PTPN23Q9H3S7 1636 aa24.41■■□□□ 1.5
ACTB-206ENST00000443528 AGLP35573 1532 aa24.4■■□□□ 1.5
ACTB-206ENST00000443528 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
ACTB-206ENST00000443528 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
ACTB-206ENST00000443528 TSPY4P0CV99 314 aa24.37■■□□□ 1.49
ACTB-206ENST00000443528 TSPY10P0CW01 314 aa24.37■■□□□ 1.49
ACTB-206ENST00000443528 A2MP01023 1474 aa24.37■■□□□ 1.49
ACTB-206ENST00000443528 PTPRMP28827 1452 aa24.37■■□□□ 1.49
ACTB-206ENST00000443528 PLXNC1O60486 1568 aa24.35■■□□□ 1.49
ACTB-206ENST00000443528 ABCC5O15440 1437 aa24.33■■□□□ 1.49
ACTB-206ENST00000443528 MAST1Q9Y2H9 1570 aa24.33■■□□□ 1.48
ACTB-206ENST00000443528 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
ACTB-206ENST00000443528 ADGBQ8N7X0 1667 aa24.32■■□□□ 1.48
ACTB-206ENST00000443528 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
ACTB-206ENST00000443528 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa24.29■■□□□ 1.48
ACTB-206ENST00000443528 DAPK1P53355 1430 aa24.28■■□□□ 1.48
ACTB-206ENST00000443528 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
ACTB-206ENST00000443528 SHANK2Q9UPX8 1470 aa24.26■■□□□ 1.47
ACTB-206ENST00000443528 CROCC2H7BZ55 1655 aa24.25■■□□□ 1.47
ACTB-206ENST00000443528 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
ACTB-206ENST00000443528 GGT6Q6P531 493 aa24.21■■□□□ 1.47
ACTB-206ENST00000443528 PLPPR3Q6T4P5 718 aa24.2■■□□□ 1.46
ACTB-206ENST00000443528 KIF3BO15066 747 aa24.19■■□□□ 1.46
ACTB-206ENST00000443528 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
ACTB-206ENST00000443528 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
ACTB-206ENST00000443528 CHIC2Q9UKJ5 165 aa24.18■■□□□ 1.46
ACTB-206ENST00000443528 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa24.17■■□□□ 1.46
ACTB-206ENST00000443528 KIF15Q9NS87 1388 aa24.16■■□□□ 1.46
ACTB-206ENST00000443528 CNTLNQ9NXG0 1405 aa24.16■■□□□ 1.46
ACTB-206ENST00000443528 DUOX2Q9NRD8 1548 aa24.15■■□□□ 1.46
ACTB-206ENST00000443528 PPP6R1Q9UPN7 881 aa24.14■■□□□ 1.45
ACTB-206ENST00000443528 PTPRKQ15262 1439 aa24.13■■□□□ 1.45
ACTB-206ENST00000443528 NCOA1Q15788 1441 aa24.13■■□□□ 1.45
ACTB-206ENST00000443528 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa24.13■■□□□ 1.45
ACTB-206ENST00000443528 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP24.13■■□□□ 1.454e-28■■□□□ 12.2
ACTB-206ENST00000443528 ADGRL2O95490 1459 aa24.13■■□□□ 1.45
ACTB-206ENST00000443528 C3P01024 1663 aa24.11■■□□□ 1.45
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